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# Coverage: architecture/index_architecture.md

## Code couvert

- `obilayeredmap/src/layer.rs` — Layer<D>, trait LayerData, modes () / PersistentCompactIntMatrix / PersistentBitMatrix
- `obilayeredmap/src/mphf_layer.rs` — MphfLayer, EvidenceKind (Exact / Approx), LayerEvidence enum
- `obilayeredmap/src/map.rs` — LayeredMap<D>
- `obilayeredmap/src/meta.rs` — LayerMeta, PartitionMeta
- `obikindex/src/meta.rs` — IndexConfig (kmer_size, n_bits, with_counts, evidence, block_bits), IndexMeta
- `obikindex/src/index.rs` — KmerIndex, build_layers
- `obicompactvec/src/` — PersistentCompactIntMatrix, PersistentBitMatrix (DataStore implementations)

## Notes

FORT RISQUE DE DÉRIVE. Nombreux changements récents :
- Ajout de `EvidenceKind` (Exact / Approx { b, z }) dans `IndexConfig` et `LayerMeta`
- Ajout de `block_bits` dans `IndexConfig`
- `LayerEvidence` enum dans `mphf_layer.rs` remplace l'ancienne approche monolithique
- Distinction `open()` vs `open_sequential()` dans `UnitigFileReader`
- Commandes `reindex` et `estimate` ajoutées
Vérifier que la hiérarchie à 3 niveaux décrite est toujours exacte et que les nouveaux paramètres sont documentés.
