obikmer/benchmark/test_shared.csv

1	genome	Candidozyma_auris--GCF_003013715.1_ASM301371v2	Acidobacterium_capsulatum--ATCC_51196	Bacillus_subtilis--168	Escherichia_coli--CFT073	Escherichia_coli--EDL933	Escherichia_coli--K-12_MG1655	Escherichia_coli--K-12_W3110	Klebsiella_pneumoniae--ATCC_13883	Klebsiella_pneumoniae--HS11286	Klebsiella_pneumoniae--MGH_78578	Opitutus_terrae--PB90-1	Proteus_mirabilis--HI4320	Saccharolobus_islandicus--M.16.4	Salmonella_enterica--AKU_12601	Salmonella_enterica--CT18	Salmonella_enterica--LT2	Salmonella_enterica--P125109	Shouchella_clausii--KSM-K16	Wolbachia_endosymbiont--GCF_000306885.1_ASM30688v1	Yersinia_ruckeri--YRB
2	Candidozyma_auris--GCF_003013715.1_ASM301371v2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	8	0	1	0	0	0	0	3
3	Acidobacterium_capsulatum--ATCC_51196	0	0	203	119	128	141	140	116	109	111	78	112	0	136	109	147	134	117	55	129
4	Bacillus_subtilis--168	0	203	0	124	132	128	123	133	109	130	66	158	6	131	112	124	135	2393	46	124
5	Escherichia_coli--CFT073	0	119	124	0	1966777	1998059	1999094	117743	32029	22312	63	4225	0	74946	31918	73311	76585	113	128	7854
6	Escherichia_coli--EDL933	0	128	132	1966777	0	2627885	2628700	52488	20134	22064	48	4202	0	74655	28602	71244	74665	112	108	7963
7	Escherichia_coli--K-12_MG1655	0	141	128	1998059	2627885	0	4452541	48302	21382	24602	47	4277	0	75729	30449	73622	76778	119	111	8566
8	Escherichia_coli--K-12_W3110	0	140	123	1999094	2628700	4452541	0	47894	21226	24470	68	4278	0	75658	30207	73614	76583	112	108	8660
9	Klebsiella_pneumoniae--ATCC_13883	0	116	133	117743	52488	48302	47894	0	1416091	1477759	42	4172	0	48296	18988	48144	50416	120	106	7712
10	Klebsiella_pneumoniae--HS11286	0	109	109	32029	20134	21382	21226	1416091	0	644063	42	2738	0	21498	29758	21606	21376	99	102	4417
11	Klebsiella_pneumoniae--MGH_78578	0	111	130	22312	22064	24602	24470	1477759	644063	0	42	2614	0	19948	35067	21330	20813	97	102	4374
12	Opitutus_terrae--PB90-1	0	78	66	63	48	47	68	42	42	42	0	43	18	57	42	53	66	39	58	43
13	Proteus_mirabilis--HI4320	0	112	158	4225	4202	4277	4278	4172	2738	2614	43	0	0	4254	2481	4166	4215	131	103	4704
14	Saccharolobus_islandicus--M.16.4	8	0	6	0	0	0	0	0	0	0	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0
15	Salmonella_enterica--AKU_12601	0	136	131	74946	74655	75729	75658	48296	21498	19948	57	4254	0	0	1047731	2857146	2951421	117	108	7643
16	Salmonella_enterica--CT18	1	109	112	31918	28602	30449	30207	18988	29758	35067	42	2481	0	1047731	0	917948	940297	106	106	3716
17	Salmonella_enterica--LT2	0	147	124	73311	71244	73622	73614	48144	21606	21330	53	4166	0	2857146	917948	0	3284800	122	108	7460
18	Salmonella_enterica--P125109	0	134	135	76585	74665	76778	76583	50416	21376	20813	66	4215	0	2951421	940297	3284800	0	134	124	7645
19	Shouchella_clausii--KSM-K16	0	117	2393	113	112	119	112	120	99	97	39	131	0	117	106	122	134	0	58	124
20	Wolbachia_endosymbiont--GCF_000306885.1_ASM30688v1	0	55	46	128	108	111	108	106	102	102	58	103	0	108	106	108	124	58	0	96
21	Yersinia_ruckeri--YRB	3	129	124	7854	7963	8566	8660	7712	4417	4374	43	4704	0	7643	3716	7460	7645	124	96	0