Coverage: implementation/pipeline.md
Code couvert
obikpartitionner/src/partition.rs— estimation des paramètres (phase 0)obiskbuilder/src/iter.rs— scatter : filtre entropie, extraction superkmers, routage partition (phase 1)obikpartitionner/src/filter.rs— déduplication bucket-sort (phase 2)obikpartitionner/src/kmer_sort.rs— tri externe + agrégation de comptages (phase 3)obidebruinj/src/debruijn.rs— graphe De Bruijn, extraction des unitigs (phase 5)obikpartitionner/src/index_layer.rs— construction MPHF + évidence (phase 6), paramètreblock_bitsobikindex/src/index.rs—build_layers(),dereplicate_and_count()
Notes
RISQUE DE DÉRIVE modéré. Vérifier :
- Phase 6 : la doc mentionne-t-elle le filtre d'abondance (min_ab, max_ab) ?
- Phase 6 : block_bits passé à build_index_layer depuis IndexConfig
- Phase 6 : dispatch exact/approx selon EvidenceKind dans build_index_layer