```markdown
/ 📂 app
├── 📄 ali2consensus.py
├── 📄 ecodbtaxstat.py
├── 📄 ecotag.py
├── 📄 ecotaxspecificity.py
├── 📄 ecotaxstat.py
├── 📄 extractreads.py
├── 📄 extractreads2.py
├── 📄 illuminapairedend.py
├── 📄 ngsfilter.py
├── 📄 obiaddtaxids.py
├── 📄 obiannotate.py
├── 📄 obiclean.py
├── 📄 obicomplement.py
├── 📄 obiconvert.py
├── 📄 obicount.py
├── 📄 obicut.py
├── 📄 obidistribute.py
├── 📄 obiextract.py
├── 📄 obigrep.py
├── 📄 obihead.py
├── 📄 obijoinpairedend.py
├── 📄 obipr2.py
├── 📄 obisample.py
├── 📄 obiselect.py
├── 📄 obisilva.py
├── 📄 obisort.py
├── 📄 obisplit.py
├── 📄 obistat.py
├── 📄 obisubset.py
├── 📄 obitab.py
├── 📄 obitail.py
├── 📄 obitaxonomy.py
└── 📂 obitools/
│  ├── 📄 SVGdraw.py
│  ├── 📄 __init__.py
│  ├── 📄 _obitools.h
│  ├── 📄 _obitools.pxd
│  ├── 📄 _obitools.pyx
│  └── 📂 align/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _assemble.pxd
│    ├── 📄 _assemble.pyx
│    ├── 📄 _codonnws.pxd
│    ├── 📄 _codonnws.pyx
│    ├── 📄 _dynamic.pxd
│    ├── 📄 _dynamic.pyx
│    ├── 📄 _freeendgap.pxd
│    ├── 📄 _freeendgap.pyx
│    ├── 📄 _freeendgapfm.pxd
│    ├── 📄 _freeendgapfm.pyx
│    ├── 📄 _gprofilenws.pxd
│    ├── 📄 _gprofilenws.pyx
│    ├── 📄 _lcs.cfiles
│    ├── 📄 _lcs.ext.1.c
│    ├── 📄 _lcs.ext.2.c
│    ├── 📄 _lcs.ext.3.c
│    ├── 📄 _lcs.ext.4.c
│    ├── 📄 _lcs.h
│    ├── 📄 _lcs.lnk
│    ├── 📄 _lcs.pxd
│    ├── 📄 _lcs.pyx
│    ├── 📄 _lcs_fast.h
│    ├── 📄 _nws.pxd
│    ├── 📄 _nws.pyx
│    ├── 📄 _nwsdnabyprot.pxd
│    ├── 📄 _nwsdnabyprot.pyx
│    ├── 📄 _profilenws.pxd
│    ├── 📄 _profilenws.pyx
│    ├── 📄 _qsassemble.pyx
│    ├── 📄 _qsrassemble.pyx
│    ├── 📄 _rassemble.pxd
│    ├── 📄 _rassemble.pyx
│    ├── 📄 _sse.h
│    ├── 📄 _upperbond.cfiles
│    ├── 📄 _upperbond.ext.1.c
│    ├── 📄 _upperbond.h
│    ├── 📄 _upperbond.pxd
│    ├── 📄 _upperbond.pyx
│    ├── 📄 homopolymere.py
│    ├── 📄 ssearch.py
│  └── 📂 alignment/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 ace.py
│  └── 📂 barcodecoverage/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 calcBc.py
│    ├── 📄 drawBcTree.py
│    ├── 📄 findErrors.py
│    ├── 📄 readFiles.py
│    ├── 📄 writeBcTree.py
│  └── 📂 blast/
│    ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 carto/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 truc.svg
│    ├── 📄 truc2.svg
│  ├── 📄 collections.py
│  ├── 📄 decorator.py
│  └── 📂 distances/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 observed.py
│    ├── 📄 phylip.py
│    ├── 📄 r.py
│  └── 📂 dnahash/
│    ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 ecobarcode/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 databases.py
│    ├── 📄 ecotag.py
│    ├── 📄 options.py
│    ├── 📄 rawdata.py
│    ├── 📄 taxonomy.py
│  └── 📂 ecopcr/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 annotation.py
│    ├── 📄 options.py
│    ├── 📄 sequence.py
│    ├── 📄 taxonomy.py
│  └── 📂 ecotag/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 parser.py
│  └── 📂 eutils/
│    ├── 📄 __init__.py
│  ├── 📄 fast.py
│  └── 📂 fasta/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _fasta.pxd
│    ├── 📄 _fasta.pyx
│  └── 📂 fastq/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _fastq.pyx
│  └── 📂 fnaqual/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 fasta.py
│    ├── 📄 quality.py
│  └── 📂 format/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _format.pyx
│    └── 📂 genericparser/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 _genericparser.pyx
│    └── 📂 ontology/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 go_obo.py
│    ├── 📄 options.py
│    └── 📂 sequence/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 embl.py
│      ├── 📄 fasta.py
│      ├── 📄 fastq.py
│      ├── 📄 fnaqual.py
│      ├── 📄 genbank.py
│      ├── 📄 tagmatcher.py
│  └── 📂 goa/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 parser.py
│  └── 📂 graph/
│    ├── 📄 __init__.py
│    └── 📂 algorithms/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 clique.py
│      ├── 📄 compact.py
│      ├── 📄 component.py
│    ├── 📄 dag.py
│    └── 📂 layout/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 radialtree.py
│    ├── 📄 rootedtree.py
│    ├── 📄 tree.py
│  ├── 📄 gzip.py
│  └── 📂 interactive/
│    ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 location/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 feature.py
│  └── 📂 metabarcoding/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 options.py
│  └── 📂 obischemas/
│    ├── 📄 __init__.py
│    └── 📂 kb/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 extern.py
│    ├── 📄 options.py
│  └── 📂 obo/
│    ├── 📄 __init__.py
│    └── 📂 go/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 parser.py
│    ├── 📄 parser.py
│  └── 📂 options/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _bioseqfilter.pyx
│    ├── 📄 _options.pyx
│    ├── 📄 bioseqcutter.py
│    ├── 📄 bioseqedittag.py
│    ├── 📄 bioseqfilter.py
│    ├── 📄 taxonomyfilter.py
│  └── 📂 parallel/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 jobqueue.py
│  └── 📂 phylogeny/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 newick.py
│  └── 📂 profile/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _profile.pxd
│    ├── 📄 _profile.pyx
│  ├── 📄 sample.py
│  └── 📂 seqdb/
│    ├── 📄 __init__.py
│    └── 📂 blastdb/
│      ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 dnaparser.py
│    └── 📂 embl/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 parser.py
│    └── 📂 genbank/
│      ├── 📄 __init__.py
│      ├── 📄 ncbi.py
│      ├── 📄 parser.py
│  └── 📂 sequenceencoder/
│    ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 solexa/
│    ├── 📄 __init__.py
│  ├── 📄 solexaPairEnd.py
│  └── 📂 statistics/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 hypergeometric.py
│    ├── 📄 noncentralhypergeo.py
│  ├── 📄 svg.py
│  └── 📂 table/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 csv.py
│  └── 📂 tagmatcher/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 options.py
│    ├── 📄 parser.py
│  └── 📂 thermo/
│    ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 tools/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _solexapairend.pyx
│    ├── 📄 solexapairend.py
│  └── 📂 tree/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 dot.py
│    ├── 📄 layout.py
│    ├── 📄 newick.py
│    ├── 📄 svg.py
│    ├── 📄 unrooted.py
│  └── 📂 unit/
│    ├── 📄 __init__.py
│    └── 📂 obitools/
│      ├── 📄 __init__.py
│  └── 📂 utils/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _utils.pxd
│    ├── 📄 _utils.pyx
│    ├── 📄 bioseq.py
│    ├── 📄 crc64.py
│    ├── 📄 iterator.py
│  ├── 📄 version.py
│  └── 📂 word/
│    ├── 📄 __init__.py
│    ├── 📄 _binary.pyx
│    ├── 📄 _readindex.cfiles
│    ├── 📄 _readindex.ext.1.c
│    ├── 📄 _readindex.h
│    ├── 📄 _readindex.pyx
│    ├── 📄 options.py
│    ├── 📄 predicate.py
│  ├── 📄 zipfile.py
├── 📄 obiuniq.py
└── 📄 oligotag.py
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