obitools/obitools4
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Implémentation des superkmers canoniques et nettoyage du parsing GenBank

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Ajout de la fonction IterCanonicalSuperKmers dans superkmer_iter.go pour implémenter les superkmers canoniques selon le document d'architecture.

Corrections dans genbank_read.go :
- Nettoyage des lignes de données avec strings.TrimSpace
- Augmentation du nombre de parties extraites avec SplitN à 7
- Début de la boucle à l'indice 1 au lieu de 0 pour ignorer le premier élément vide

Création du fichier Canonical-superkmers.md pour documenter l'implémentation.
This commit is contained in:
Eric Coissac
2026-02-19 18:30:46 +01:00
parent c30a22d356
commit 0580611031
2 changed files with 6 additions and 2 deletions
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blackboard/ToDo/Canonical-superkmers.md Normal file
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@@ -0,0 +1,3 @@
lit le ficier [@canonical-super-kmer-strategy.md](file:///Users/coissac/Sync/travail/__MOI__/GO/obitools4/blackboard/Prospective/canonical-super-kmer-strategy.md).
Dans le fichier [@superkmer_iter.go](file:///Users/coissac/Sync/travail/__MOI__/GO/obitools4/pkg/obikmer/superkmer_iter.go) implemente une nouvelle fonction IterCanonicalSuperKmers sur le modèle de IterSuperKmers, qui implémente la notion de SuperKmers canonique présenté dans le document d'architecture.