Ajout du filtre de fréquence avec v niveaux Roaring Bitmaps

Implémentation complète du filtre de fréquence utilisant v niveaux de Roaring Bitmaps pour éliminer efficacement les erreurs de séquençage.

- Ajout de la logique de filtrage par fréquence avec v niveaux
- Intégration des bibliothèques RoaringBitmap et bitset
- Ajout d'exemples d'utilisation et de documentation
- Implémentation de l'itérateur de k-mers pour une utilisation mémoire efficace
- Optimisation pour les distributions skewed typiques du séquençage

Ce changement permet de filtrer les k-mers par fréquence minimale avec une utilisation mémoire optimale et une seule passe sur les données.
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Eric Coissac
2026-02-04 21:20:27 +01:00
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go.sum
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