Implement strict word finding and sequence filtering

This introduces new structures for defining sequence roles and constraints, core logic for strict word identification, and comprehensive unit tests to ensure accuracy and correct behavior.

OBIPRIMERS_NOTES.md

@@ -211,3 +211,41 @@ Un bug trouvé par ces tests dans ma boucle de réduction (compteur de séquence
 Contrôle de bout en bout prévu (étape suivante) : `Strict primer count` d'ecoPrimers = **1 208**
 (Cyprinidae) et **255** (Teleostei) avec `-e 3 -3 2 -l 30 -L 150 -c`, k = 18, quorum 0,7 ; le calcul
 d'ecoPrimers est `floor(|E| x 0,7)` séquences (> longueur d'amorce).
+
+## 10. Mode A, étape 2b : mots stricts de bout en bout (2026-11-03)
+
+Code : `pkg/obiprimer/roles.go` (`Role`, `Selection`, `BelongingTo`) et `words.go` (`WordSearch`,
+`StrictWords`, `FindStrictWords`, `MinSequences`). Tests : `words_test.go`.
+
+- `Selection` reproduit `-r` (restrict), `-i` (ignore) et `-E` (exception) d'ecoPrimers, vérifié sur les
+  quatre cas du tableau de la section 4 : exemple = dans Restrict et hors Except ; sinon contre-exemple si
+  dans Ignore ou Except ; sinon ignoré. Prédicats construits avec `obiseq.IsSubCladeOf` (existant).
+- `FindStrictWords` lit les séquences une fois (consommateurs parallèles via `Split()`), indexe les
+  exemples dans un `SeqKmerCounter`, puis `CountAtLeast(floor(exemples x quorum))`. Quorum calculé avec
+  une petite tolérance (10 x 0,7 = 7) au lieu de la multiplication en float32 du C.
+
+**Contrôle contre ecoPrimers** (test opt-in : `OBIPRIMERS_TUTORIAL=<dossier du tutoriel> go test ./pkg/obiprimer/`) :
+
+| Jeu | Exemples | Quorum | Mots obiprimers | Mots ecoPrimers |
+|---|---|---|---|---|
+| Teleostei | 3 909 | 2 736 | **255** | 255 (identique) |
+| Cyprinidae | 325 | 227 | **1 207** | 1 208 |
+
+Écart de Cyprinidae : un mot en plus chez ecoPrimers, `TTTATGAAAACAAATAAA`. Comparaison des deux listes
+complètes (le journal d'ecoPrimers imprime ses 1 208 mots) : tous les autres mots sont identiques. Un
+comptage par force brute (deux brins, jonction circulaire) trouve ce mot dans **225** séquences sur 325,
+sous le quorum de 227 : ecoPrimers le garde à tort. Le mécanisme exact n'est pas établi (`merge.c` élague
+avec `remainingSeq + count >= quorum` pendant une fusion en place avec file d'attente ; non investigué
+plus loin). Impact : ce mot n'apparaît dans **aucune** des 3 448 paires finales de
+`Cyprinidae.ecoprimers`. Le test fige 1 207 avec cette explication.
+
+Mesure : étape « mots stricts » seule, 0,5 s (Cyprinidae) et 1,1 s (Teleostei) sur cette machine, lecture
+de la taxonomie et du FASTA non comprise ; ecoPrimers complet : 134 s et 350 s (non décomposé par étape).
+
+**Bug existant repéré hors périmètre** : `go test -race` signale une course dans
+`obiutils/pipe.go` (`globalLockerCounter` est un `int` incrémenté et décrémenté depuis plusieurs
+goroutines, utilisé seulement pour des `log.Debugln`). Sans rapport avec obiprimers ; un `atomic.Int64`
+suffirait. Non modifié (code partagé) : à décider.
+
+Suite : étape 3 (recherche approchée des mots stricts, <= e substitutions, deux brins, dans exemples
+et contre-exemples), puis paires et indices.