mirror of
https://github.com/metabarcoding/obitools4.git
synced 2025-12-07 16:20:27 +00:00
5671 lines
175 KiB
Go
5671 lines
175 KiB
Go
package obikmer
|
|
|
|
// LexicographicNormalizationInt contient les tables de normalisation
|
|
// pour les k-mers encodés en entier (k=1 à 6).
|
|
// L'index du tableau correspond à la taille du k-mer.
|
|
// Chaque table associe le code entier d'un k-mer à son représentant
|
|
// lexicographique canonique obtenu par permutation circulaire.
|
|
var LexicographicNormalizationInt = [7]map[int]int{
|
|
0: nil, // k=0 n'existe pas
|
|
1: {
|
|
0: 0, // a -> a
|
|
1: 1, // c -> c
|
|
2: 2, // g -> g
|
|
3: 3, // t -> t
|
|
},
|
|
2: {
|
|
0: 0, // aa -> aa
|
|
1: 1, // ac -> ac
|
|
2: 2, // ag -> ag
|
|
3: 3, // at -> at
|
|
4: 1, // ca -> ac
|
|
5: 5, // cc -> cc
|
|
6: 6, // cg -> cg
|
|
7: 7, // ct -> ct
|
|
8: 2, // ga -> ag
|
|
9: 6, // gc -> cg
|
|
10: 10, // gg -> gg
|
|
11: 11, // gt -> gt
|
|
12: 3, // ta -> at
|
|
13: 7, // tc -> ct
|
|
14: 11, // tg -> gt
|
|
15: 15, // tt -> tt
|
|
},
|
|
3: {
|
|
0: 0, // aaa -> aaa
|
|
1: 1, // aac -> aac
|
|
2: 2, // aag -> aag
|
|
3: 3, // aat -> aat
|
|
4: 1, // aca -> aac
|
|
5: 5, // acc -> acc
|
|
6: 6, // acg -> acg
|
|
7: 7, // act -> act
|
|
8: 2, // aga -> aag
|
|
9: 9, // agc -> agc
|
|
10: 10, // agg -> agg
|
|
11: 11, // agt -> agt
|
|
12: 3, // ata -> aat
|
|
13: 13, // atc -> atc
|
|
14: 14, // atg -> atg
|
|
15: 15, // att -> att
|
|
16: 1, // caa -> aac
|
|
17: 5, // cac -> acc
|
|
18: 9, // cag -> agc
|
|
19: 13, // cat -> atc
|
|
20: 5, // cca -> acc
|
|
21: 21, // ccc -> ccc
|
|
22: 22, // ccg -> ccg
|
|
23: 23, // cct -> cct
|
|
24: 6, // cga -> acg
|
|
25: 22, // cgc -> ccg
|
|
26: 26, // cgg -> cgg
|
|
27: 27, // cgt -> cgt
|
|
28: 7, // cta -> act
|
|
29: 23, // ctc -> cct
|
|
30: 30, // ctg -> ctg
|
|
31: 31, // ctt -> ctt
|
|
32: 2, // gaa -> aag
|
|
33: 6, // gac -> acg
|
|
34: 10, // gag -> agg
|
|
35: 14, // gat -> atg
|
|
36: 9, // gca -> agc
|
|
37: 22, // gcc -> ccg
|
|
38: 26, // gcg -> cgg
|
|
39: 30, // gct -> ctg
|
|
40: 10, // gga -> agg
|
|
41: 26, // ggc -> cgg
|
|
42: 42, // ggg -> ggg
|
|
43: 43, // ggt -> ggt
|
|
44: 11, // gta -> agt
|
|
45: 27, // gtc -> cgt
|
|
46: 43, // gtg -> ggt
|
|
47: 47, // gtt -> gtt
|
|
48: 3, // taa -> aat
|
|
49: 7, // tac -> act
|
|
50: 11, // tag -> agt
|
|
51: 15, // tat -> att
|
|
52: 13, // tca -> atc
|
|
53: 23, // tcc -> cct
|
|
54: 27, // tcg -> cgt
|
|
55: 31, // tct -> ctt
|
|
56: 14, // tga -> atg
|
|
57: 30, // tgc -> ctg
|
|
58: 43, // tgg -> ggt
|
|
59: 47, // tgt -> gtt
|
|
60: 15, // tta -> att
|
|
61: 31, // ttc -> ctt
|
|
62: 47, // ttg -> gtt
|
|
63: 63, // ttt -> ttt
|
|
},
|
|
4: {
|
|
0: 0, // aaaa -> aaaa
|
|
1: 1, // aaac -> aaac
|
|
2: 2, // aaag -> aaag
|
|
3: 3, // aaat -> aaat
|
|
4: 1, // aaca -> aaac
|
|
5: 5, // aacc -> aacc
|
|
6: 6, // aacg -> aacg
|
|
7: 7, // aact -> aact
|
|
8: 2, // aaga -> aaag
|
|
9: 9, // aagc -> aagc
|
|
10: 10, // aagg -> aagg
|
|
11: 11, // aagt -> aagt
|
|
12: 3, // aata -> aaat
|
|
13: 13, // aatc -> aatc
|
|
14: 14, // aatg -> aatg
|
|
15: 15, // aatt -> aatt
|
|
16: 1, // acaa -> aaac
|
|
17: 17, // acac -> acac
|
|
18: 18, // acag -> acag
|
|
19: 19, // acat -> acat
|
|
20: 5, // acca -> aacc
|
|
21: 21, // accc -> accc
|
|
22: 22, // accg -> accg
|
|
23: 23, // acct -> acct
|
|
24: 6, // acga -> aacg
|
|
25: 25, // acgc -> acgc
|
|
26: 26, // acgg -> acgg
|
|
27: 27, // acgt -> acgt
|
|
28: 7, // acta -> aact
|
|
29: 29, // actc -> actc
|
|
30: 30, // actg -> actg
|
|
31: 31, // actt -> actt
|
|
32: 2, // agaa -> aaag
|
|
33: 18, // agac -> acag
|
|
34: 34, // agag -> agag
|
|
35: 35, // agat -> agat
|
|
36: 9, // agca -> aagc
|
|
37: 37, // agcc -> agcc
|
|
38: 38, // agcg -> agcg
|
|
39: 39, // agct -> agct
|
|
40: 10, // agga -> aagg
|
|
41: 41, // aggc -> aggc
|
|
42: 42, // aggg -> aggg
|
|
43: 43, // aggt -> aggt
|
|
44: 11, // agta -> aagt
|
|
45: 45, // agtc -> agtc
|
|
46: 46, // agtg -> agtg
|
|
47: 47, // agtt -> agtt
|
|
48: 3, // ataa -> aaat
|
|
49: 19, // atac -> acat
|
|
50: 35, // atag -> agat
|
|
51: 51, // atat -> atat
|
|
52: 13, // atca -> aatc
|
|
53: 53, // atcc -> atcc
|
|
54: 54, // atcg -> atcg
|
|
55: 55, // atct -> atct
|
|
56: 14, // atga -> aatg
|
|
57: 57, // atgc -> atgc
|
|
58: 58, // atgg -> atgg
|
|
59: 59, // atgt -> atgt
|
|
60: 15, // atta -> aatt
|
|
61: 61, // attc -> attc
|
|
62: 62, // attg -> attg
|
|
63: 63, // attt -> attt
|
|
64: 1, // caaa -> aaac
|
|
65: 5, // caac -> aacc
|
|
66: 9, // caag -> aagc
|
|
67: 13, // caat -> aatc
|
|
68: 17, // caca -> acac
|
|
69: 21, // cacc -> accc
|
|
70: 25, // cacg -> acgc
|
|
71: 29, // cact -> actc
|
|
72: 18, // caga -> acag
|
|
73: 37, // cagc -> agcc
|
|
74: 41, // cagg -> aggc
|
|
75: 45, // cagt -> agtc
|
|
76: 19, // cata -> acat
|
|
77: 53, // catc -> atcc
|
|
78: 57, // catg -> atgc
|
|
79: 61, // catt -> attc
|
|
80: 5, // ccaa -> aacc
|
|
81: 21, // ccac -> accc
|
|
82: 37, // ccag -> agcc
|
|
83: 53, // ccat -> atcc
|
|
84: 21, // ccca -> accc
|
|
85: 85, // cccc -> cccc
|
|
86: 86, // cccg -> cccg
|
|
87: 87, // ccct -> ccct
|
|
88: 22, // ccga -> accg
|
|
89: 86, // ccgc -> cccg
|
|
90: 90, // ccgg -> ccgg
|
|
91: 91, // ccgt -> ccgt
|
|
92: 23, // ccta -> acct
|
|
93: 87, // cctc -> ccct
|
|
94: 94, // cctg -> cctg
|
|
95: 95, // cctt -> cctt
|
|
96: 6, // cgaa -> aacg
|
|
97: 22, // cgac -> accg
|
|
98: 38, // cgag -> agcg
|
|
99: 54, // cgat -> atcg
|
|
100: 25, // cgca -> acgc
|
|
101: 86, // cgcc -> cccg
|
|
102: 102, // cgcg -> cgcg
|
|
103: 103, // cgct -> cgct
|
|
104: 26, // cgga -> acgg
|
|
105: 90, // cggc -> ccgg
|
|
106: 106, // cggg -> cggg
|
|
107: 107, // cggt -> cggt
|
|
108: 27, // cgta -> acgt
|
|
109: 91, // cgtc -> ccgt
|
|
110: 110, // cgtg -> cgtg
|
|
111: 111, // cgtt -> cgtt
|
|
112: 7, // ctaa -> aact
|
|
113: 23, // ctac -> acct
|
|
114: 39, // ctag -> agct
|
|
115: 55, // ctat -> atct
|
|
116: 29, // ctca -> actc
|
|
117: 87, // ctcc -> ccct
|
|
118: 103, // ctcg -> cgct
|
|
119: 119, // ctct -> ctct
|
|
120: 30, // ctga -> actg
|
|
121: 94, // ctgc -> cctg
|
|
122: 122, // ctgg -> ctgg
|
|
123: 123, // ctgt -> ctgt
|
|
124: 31, // ctta -> actt
|
|
125: 95, // cttc -> cctt
|
|
126: 126, // cttg -> cttg
|
|
127: 127, // cttt -> cttt
|
|
128: 2, // gaaa -> aaag
|
|
129: 6, // gaac -> aacg
|
|
130: 10, // gaag -> aagg
|
|
131: 14, // gaat -> aatg
|
|
132: 18, // gaca -> acag
|
|
133: 22, // gacc -> accg
|
|
134: 26, // gacg -> acgg
|
|
135: 30, // gact -> actg
|
|
136: 34, // gaga -> agag
|
|
137: 38, // gagc -> agcg
|
|
138: 42, // gagg -> aggg
|
|
139: 46, // gagt -> agtg
|
|
140: 35, // gata -> agat
|
|
141: 54, // gatc -> atcg
|
|
142: 58, // gatg -> atgg
|
|
143: 62, // gatt -> attg
|
|
144: 9, // gcaa -> aagc
|
|
145: 25, // gcac -> acgc
|
|
146: 41, // gcag -> aggc
|
|
147: 57, // gcat -> atgc
|
|
148: 37, // gcca -> agcc
|
|
149: 86, // gccc -> cccg
|
|
150: 90, // gccg -> ccgg
|
|
151: 94, // gcct -> cctg
|
|
152: 38, // gcga -> agcg
|
|
153: 102, // gcgc -> cgcg
|
|
154: 106, // gcgg -> cggg
|
|
155: 110, // gcgt -> cgtg
|
|
156: 39, // gcta -> agct
|
|
157: 103, // gctc -> cgct
|
|
158: 122, // gctg -> ctgg
|
|
159: 126, // gctt -> cttg
|
|
160: 10, // ggaa -> aagg
|
|
161: 26, // ggac -> acgg
|
|
162: 42, // ggag -> aggg
|
|
163: 58, // ggat -> atgg
|
|
164: 41, // ggca -> aggc
|
|
165: 90, // ggcc -> ccgg
|
|
166: 106, // ggcg -> cggg
|
|
167: 122, // ggct -> ctgg
|
|
168: 42, // ggga -> aggg
|
|
169: 106, // gggc -> cggg
|
|
170: 170, // gggg -> gggg
|
|
171: 171, // gggt -> gggt
|
|
172: 43, // ggta -> aggt
|
|
173: 107, // ggtc -> cggt
|
|
174: 171, // ggtg -> gggt
|
|
175: 175, // ggtt -> ggtt
|
|
176: 11, // gtaa -> aagt
|
|
177: 27, // gtac -> acgt
|
|
178: 43, // gtag -> aggt
|
|
179: 59, // gtat -> atgt
|
|
180: 45, // gtca -> agtc
|
|
181: 91, // gtcc -> ccgt
|
|
182: 107, // gtcg -> cggt
|
|
183: 123, // gtct -> ctgt
|
|
184: 46, // gtga -> agtg
|
|
185: 110, // gtgc -> cgtg
|
|
186: 171, // gtgg -> gggt
|
|
187: 187, // gtgt -> gtgt
|
|
188: 47, // gtta -> agtt
|
|
189: 111, // gttc -> cgtt
|
|
190: 175, // gttg -> ggtt
|
|
191: 191, // gttt -> gttt
|
|
192: 3, // taaa -> aaat
|
|
193: 7, // taac -> aact
|
|
194: 11, // taag -> aagt
|
|
195: 15, // taat -> aatt
|
|
196: 19, // taca -> acat
|
|
197: 23, // tacc -> acct
|
|
198: 27, // tacg -> acgt
|
|
199: 31, // tact -> actt
|
|
200: 35, // taga -> agat
|
|
201: 39, // tagc -> agct
|
|
202: 43, // tagg -> aggt
|
|
203: 47, // tagt -> agtt
|
|
204: 51, // tata -> atat
|
|
205: 55, // tatc -> atct
|
|
206: 59, // tatg -> atgt
|
|
207: 63, // tatt -> attt
|
|
208: 13, // tcaa -> aatc
|
|
209: 29, // tcac -> actc
|
|
210: 45, // tcag -> agtc
|
|
211: 61, // tcat -> attc
|
|
212: 53, // tcca -> atcc
|
|
213: 87, // tccc -> ccct
|
|
214: 91, // tccg -> ccgt
|
|
215: 95, // tcct -> cctt
|
|
216: 54, // tcga -> atcg
|
|
217: 103, // tcgc -> cgct
|
|
218: 107, // tcgg -> cggt
|
|
219: 111, // tcgt -> cgtt
|
|
220: 55, // tcta -> atct
|
|
221: 119, // tctc -> ctct
|
|
222: 123, // tctg -> ctgt
|
|
223: 127, // tctt -> cttt
|
|
224: 14, // tgaa -> aatg
|
|
225: 30, // tgac -> actg
|
|
226: 46, // tgag -> agtg
|
|
227: 62, // tgat -> attg
|
|
228: 57, // tgca -> atgc
|
|
229: 94, // tgcc -> cctg
|
|
230: 110, // tgcg -> cgtg
|
|
231: 126, // tgct -> cttg
|
|
232: 58, // tgga -> atgg
|
|
233: 122, // tggc -> ctgg
|
|
234: 171, // tggg -> gggt
|
|
235: 175, // tggt -> ggtt
|
|
236: 59, // tgta -> atgt
|
|
237: 123, // tgtc -> ctgt
|
|
238: 187, // tgtg -> gtgt
|
|
239: 191, // tgtt -> gttt
|
|
240: 15, // ttaa -> aatt
|
|
241: 31, // ttac -> actt
|
|
242: 47, // ttag -> agtt
|
|
243: 63, // ttat -> attt
|
|
244: 61, // ttca -> attc
|
|
245: 95, // ttcc -> cctt
|
|
246: 111, // ttcg -> cgtt
|
|
247: 127, // ttct -> cttt
|
|
248: 62, // ttga -> attg
|
|
249: 126, // ttgc -> cttg
|
|
250: 175, // ttgg -> ggtt
|
|
251: 191, // ttgt -> gttt
|
|
252: 63, // ttta -> attt
|
|
253: 127, // tttc -> cttt
|
|
254: 191, // tttg -> gttt
|
|
255: 255, // tttt -> tttt
|
|
},
|
|
5: {
|
|
0: 0, // aaaaa -> aaaaa
|
|
1: 1, // aaaac -> aaaac
|
|
2: 2, // aaaag -> aaaag
|
|
3: 3, // aaaat -> aaaat
|
|
4: 1, // aaaca -> aaaac
|
|
5: 5, // aaacc -> aaacc
|
|
6: 6, // aaacg -> aaacg
|
|
7: 7, // aaact -> aaact
|
|
8: 2, // aaaga -> aaaag
|
|
9: 9, // aaagc -> aaagc
|
|
10: 10, // aaagg -> aaagg
|
|
11: 11, // aaagt -> aaagt
|
|
12: 3, // aaata -> aaaat
|
|
13: 13, // aaatc -> aaatc
|
|
14: 14, // aaatg -> aaatg
|
|
15: 15, // aaatt -> aaatt
|
|
16: 1, // aacaa -> aaaac
|
|
17: 17, // aacac -> aacac
|
|
18: 18, // aacag -> aacag
|
|
19: 19, // aacat -> aacat
|
|
20: 5, // aacca -> aaacc
|
|
21: 21, // aaccc -> aaccc
|
|
22: 22, // aaccg -> aaccg
|
|
23: 23, // aacct -> aacct
|
|
24: 6, // aacga -> aaacg
|
|
25: 25, // aacgc -> aacgc
|
|
26: 26, // aacgg -> aacgg
|
|
27: 27, // aacgt -> aacgt
|
|
28: 7, // aacta -> aaact
|
|
29: 29, // aactc -> aactc
|
|
30: 30, // aactg -> aactg
|
|
31: 31, // aactt -> aactt
|
|
32: 2, // aagaa -> aaaag
|
|
33: 33, // aagac -> aagac
|
|
34: 34, // aagag -> aagag
|
|
35: 35, // aagat -> aagat
|
|
36: 9, // aagca -> aaagc
|
|
37: 37, // aagcc -> aagcc
|
|
38: 38, // aagcg -> aagcg
|
|
39: 39, // aagct -> aagct
|
|
40: 10, // aagga -> aaagg
|
|
41: 41, // aaggc -> aaggc
|
|
42: 42, // aaggg -> aaggg
|
|
43: 43, // aaggt -> aaggt
|
|
44: 11, // aagta -> aaagt
|
|
45: 45, // aagtc -> aagtc
|
|
46: 46, // aagtg -> aagtg
|
|
47: 47, // aagtt -> aagtt
|
|
48: 3, // aataa -> aaaat
|
|
49: 49, // aatac -> aatac
|
|
50: 50, // aatag -> aatag
|
|
51: 51, // aatat -> aatat
|
|
52: 13, // aatca -> aaatc
|
|
53: 53, // aatcc -> aatcc
|
|
54: 54, // aatcg -> aatcg
|
|
55: 55, // aatct -> aatct
|
|
56: 14, // aatga -> aaatg
|
|
57: 57, // aatgc -> aatgc
|
|
58: 58, // aatgg -> aatgg
|
|
59: 59, // aatgt -> aatgt
|
|
60: 15, // aatta -> aaatt
|
|
61: 61, // aattc -> aattc
|
|
62: 62, // aattg -> aattg
|
|
63: 63, // aattt -> aattt
|
|
64: 1, // acaaa -> aaaac
|
|
65: 17, // acaac -> aacac
|
|
66: 33, // acaag -> aagac
|
|
67: 49, // acaat -> aatac
|
|
68: 17, // acaca -> aacac
|
|
69: 69, // acacc -> acacc
|
|
70: 70, // acacg -> acacg
|
|
71: 71, // acact -> acact
|
|
72: 18, // acaga -> aacag
|
|
73: 73, // acagc -> acagc
|
|
74: 74, // acagg -> acagg
|
|
75: 75, // acagt -> acagt
|
|
76: 19, // acata -> aacat
|
|
77: 77, // acatc -> acatc
|
|
78: 78, // acatg -> acatg
|
|
79: 79, // acatt -> acatt
|
|
80: 5, // accaa -> aaacc
|
|
81: 69, // accac -> acacc
|
|
82: 82, // accag -> accag
|
|
83: 83, // accat -> accat
|
|
84: 21, // accca -> aaccc
|
|
85: 85, // acccc -> acccc
|
|
86: 86, // acccg -> acccg
|
|
87: 87, // accct -> accct
|
|
88: 22, // accga -> aaccg
|
|
89: 89, // accgc -> accgc
|
|
90: 90, // accgg -> accgg
|
|
91: 91, // accgt -> accgt
|
|
92: 23, // accta -> aacct
|
|
93: 93, // acctc -> acctc
|
|
94: 94, // acctg -> acctg
|
|
95: 95, // acctt -> acctt
|
|
96: 6, // acgaa -> aaacg
|
|
97: 70, // acgac -> acacg
|
|
98: 98, // acgag -> acgag
|
|
99: 99, // acgat -> acgat
|
|
100: 25, // acgca -> aacgc
|
|
101: 101, // acgcc -> acgcc
|
|
102: 102, // acgcg -> acgcg
|
|
103: 103, // acgct -> acgct
|
|
104: 26, // acgga -> aacgg
|
|
105: 105, // acggc -> acggc
|
|
106: 106, // acggg -> acggg
|
|
107: 107, // acggt -> acggt
|
|
108: 27, // acgta -> aacgt
|
|
109: 109, // acgtc -> acgtc
|
|
110: 110, // acgtg -> acgtg
|
|
111: 111, // acgtt -> acgtt
|
|
112: 7, // actaa -> aaact
|
|
113: 71, // actac -> acact
|
|
114: 114, // actag -> actag
|
|
115: 115, // actat -> actat
|
|
116: 29, // actca -> aactc
|
|
117: 117, // actcc -> actcc
|
|
118: 118, // actcg -> actcg
|
|
119: 119, // actct -> actct
|
|
120: 30, // actga -> aactg
|
|
121: 121, // actgc -> actgc
|
|
122: 122, // actgg -> actgg
|
|
123: 123, // actgt -> actgt
|
|
124: 31, // actta -> aactt
|
|
125: 125, // acttc -> acttc
|
|
126: 126, // acttg -> acttg
|
|
127: 127, // acttt -> acttt
|
|
128: 2, // agaaa -> aaaag
|
|
129: 18, // agaac -> aacag
|
|
130: 34, // agaag -> aagag
|
|
131: 50, // agaat -> aatag
|
|
132: 33, // agaca -> aagac
|
|
133: 82, // agacc -> accag
|
|
134: 98, // agacg -> acgag
|
|
135: 114, // agact -> actag
|
|
136: 34, // agaga -> aagag
|
|
137: 137, // agagc -> agagc
|
|
138: 138, // agagg -> agagg
|
|
139: 139, // agagt -> agagt
|
|
140: 35, // agata -> aagat
|
|
141: 141, // agatc -> agatc
|
|
142: 142, // agatg -> agatg
|
|
143: 143, // agatt -> agatt
|
|
144: 9, // agcaa -> aaagc
|
|
145: 73, // agcac -> acagc
|
|
146: 137, // agcag -> agagc
|
|
147: 147, // agcat -> agcat
|
|
148: 37, // agcca -> aagcc
|
|
149: 149, // agccc -> agccc
|
|
150: 150, // agccg -> agccg
|
|
151: 151, // agcct -> agcct
|
|
152: 38, // agcga -> aagcg
|
|
153: 153, // agcgc -> agcgc
|
|
154: 154, // agcgg -> agcgg
|
|
155: 155, // agcgt -> agcgt
|
|
156: 39, // agcta -> aagct
|
|
157: 157, // agctc -> agctc
|
|
158: 158, // agctg -> agctg
|
|
159: 159, // agctt -> agctt
|
|
160: 10, // aggaa -> aaagg
|
|
161: 74, // aggac -> acagg
|
|
162: 138, // aggag -> agagg
|
|
163: 163, // aggat -> aggat
|
|
164: 41, // aggca -> aaggc
|
|
165: 165, // aggcc -> aggcc
|
|
166: 166, // aggcg -> aggcg
|
|
167: 167, // aggct -> aggct
|
|
168: 42, // aggga -> aaggg
|
|
169: 169, // agggc -> agggc
|
|
170: 170, // agggg -> agggg
|
|
171: 171, // agggt -> agggt
|
|
172: 43, // aggta -> aaggt
|
|
173: 173, // aggtc -> aggtc
|
|
174: 174, // aggtg -> aggtg
|
|
175: 175, // aggtt -> aggtt
|
|
176: 11, // agtaa -> aaagt
|
|
177: 75, // agtac -> acagt
|
|
178: 139, // agtag -> agagt
|
|
179: 179, // agtat -> agtat
|
|
180: 45, // agtca -> aagtc
|
|
181: 181, // agtcc -> agtcc
|
|
182: 182, // agtcg -> agtcg
|
|
183: 183, // agtct -> agtct
|
|
184: 46, // agtga -> aagtg
|
|
185: 185, // agtgc -> agtgc
|
|
186: 186, // agtgg -> agtgg
|
|
187: 187, // agtgt -> agtgt
|
|
188: 47, // agtta -> aagtt
|
|
189: 189, // agttc -> agttc
|
|
190: 190, // agttg -> agttg
|
|
191: 191, // agttt -> agttt
|
|
192: 3, // ataaa -> aaaat
|
|
193: 19, // ataac -> aacat
|
|
194: 35, // ataag -> aagat
|
|
195: 51, // ataat -> aatat
|
|
196: 49, // ataca -> aatac
|
|
197: 83, // atacc -> accat
|
|
198: 99, // atacg -> acgat
|
|
199: 115, // atact -> actat
|
|
200: 50, // ataga -> aatag
|
|
201: 147, // atagc -> agcat
|
|
202: 163, // atagg -> aggat
|
|
203: 179, // atagt -> agtat
|
|
204: 51, // atata -> aatat
|
|
205: 205, // atatc -> atatc
|
|
206: 206, // atatg -> atatg
|
|
207: 207, // atatt -> atatt
|
|
208: 13, // atcaa -> aaatc
|
|
209: 77, // atcac -> acatc
|
|
210: 141, // atcag -> agatc
|
|
211: 205, // atcat -> atatc
|
|
212: 53, // atcca -> aatcc
|
|
213: 213, // atccc -> atccc
|
|
214: 214, // atccg -> atccg
|
|
215: 215, // atcct -> atcct
|
|
216: 54, // atcga -> aatcg
|
|
217: 217, // atcgc -> atcgc
|
|
218: 218, // atcgg -> atcgg
|
|
219: 219, // atcgt -> atcgt
|
|
220: 55, // atcta -> aatct
|
|
221: 221, // atctc -> atctc
|
|
222: 222, // atctg -> atctg
|
|
223: 223, // atctt -> atctt
|
|
224: 14, // atgaa -> aaatg
|
|
225: 78, // atgac -> acatg
|
|
226: 142, // atgag -> agatg
|
|
227: 206, // atgat -> atatg
|
|
228: 57, // atgca -> aatgc
|
|
229: 229, // atgcc -> atgcc
|
|
230: 230, // atgcg -> atgcg
|
|
231: 231, // atgct -> atgct
|
|
232: 58, // atgga -> aatgg
|
|
233: 233, // atggc -> atggc
|
|
234: 234, // atggg -> atggg
|
|
235: 235, // atggt -> atggt
|
|
236: 59, // atgta -> aatgt
|
|
237: 237, // atgtc -> atgtc
|
|
238: 238, // atgtg -> atgtg
|
|
239: 239, // atgtt -> atgtt
|
|
240: 15, // attaa -> aaatt
|
|
241: 79, // attac -> acatt
|
|
242: 143, // attag -> agatt
|
|
243: 207, // attat -> atatt
|
|
244: 61, // attca -> aattc
|
|
245: 245, // attcc -> attcc
|
|
246: 246, // attcg -> attcg
|
|
247: 247, // attct -> attct
|
|
248: 62, // attga -> aattg
|
|
249: 249, // attgc -> attgc
|
|
250: 250, // attgg -> attgg
|
|
251: 251, // attgt -> attgt
|
|
252: 63, // attta -> aattt
|
|
253: 253, // atttc -> atttc
|
|
254: 254, // atttg -> atttg
|
|
255: 255, // atttt -> atttt
|
|
256: 1, // caaaa -> aaaac
|
|
257: 5, // caaac -> aaacc
|
|
258: 9, // caaag -> aaagc
|
|
259: 13, // caaat -> aaatc
|
|
260: 17, // caaca -> aacac
|
|
261: 21, // caacc -> aaccc
|
|
262: 25, // caacg -> aacgc
|
|
263: 29, // caact -> aactc
|
|
264: 33, // caaga -> aagac
|
|
265: 37, // caagc -> aagcc
|
|
266: 41, // caagg -> aaggc
|
|
267: 45, // caagt -> aagtc
|
|
268: 49, // caata -> aatac
|
|
269: 53, // caatc -> aatcc
|
|
270: 57, // caatg -> aatgc
|
|
271: 61, // caatt -> aattc
|
|
272: 17, // cacaa -> aacac
|
|
273: 69, // cacac -> acacc
|
|
274: 73, // cacag -> acagc
|
|
275: 77, // cacat -> acatc
|
|
276: 69, // cacca -> acacc
|
|
277: 85, // caccc -> acccc
|
|
278: 89, // caccg -> accgc
|
|
279: 93, // cacct -> acctc
|
|
280: 70, // cacga -> acacg
|
|
281: 101, // cacgc -> acgcc
|
|
282: 105, // cacgg -> acggc
|
|
283: 109, // cacgt -> acgtc
|
|
284: 71, // cacta -> acact
|
|
285: 117, // cactc -> actcc
|
|
286: 121, // cactg -> actgc
|
|
287: 125, // cactt -> acttc
|
|
288: 18, // cagaa -> aacag
|
|
289: 82, // cagac -> accag
|
|
290: 137, // cagag -> agagc
|
|
291: 141, // cagat -> agatc
|
|
292: 73, // cagca -> acagc
|
|
293: 149, // cagcc -> agccc
|
|
294: 153, // cagcg -> agcgc
|
|
295: 157, // cagct -> agctc
|
|
296: 74, // cagga -> acagg
|
|
297: 165, // caggc -> aggcc
|
|
298: 169, // caggg -> agggc
|
|
299: 173, // caggt -> aggtc
|
|
300: 75, // cagta -> acagt
|
|
301: 181, // cagtc -> agtcc
|
|
302: 185, // cagtg -> agtgc
|
|
303: 189, // cagtt -> agttc
|
|
304: 19, // cataa -> aacat
|
|
305: 83, // catac -> accat
|
|
306: 147, // catag -> agcat
|
|
307: 205, // catat -> atatc
|
|
308: 77, // catca -> acatc
|
|
309: 213, // catcc -> atccc
|
|
310: 217, // catcg -> atcgc
|
|
311: 221, // catct -> atctc
|
|
312: 78, // catga -> acatg
|
|
313: 229, // catgc -> atgcc
|
|
314: 233, // catgg -> atggc
|
|
315: 237, // catgt -> atgtc
|
|
316: 79, // catta -> acatt
|
|
317: 245, // cattc -> attcc
|
|
318: 249, // cattg -> attgc
|
|
319: 253, // cattt -> atttc
|
|
320: 5, // ccaaa -> aaacc
|
|
321: 21, // ccaac -> aaccc
|
|
322: 37, // ccaag -> aagcc
|
|
323: 53, // ccaat -> aatcc
|
|
324: 69, // ccaca -> acacc
|
|
325: 85, // ccacc -> acccc
|
|
326: 101, // ccacg -> acgcc
|
|
327: 117, // ccact -> actcc
|
|
328: 82, // ccaga -> accag
|
|
329: 149, // ccagc -> agccc
|
|
330: 165, // ccagg -> aggcc
|
|
331: 181, // ccagt -> agtcc
|
|
332: 83, // ccata -> accat
|
|
333: 213, // ccatc -> atccc
|
|
334: 229, // ccatg -> atgcc
|
|
335: 245, // ccatt -> attcc
|
|
336: 21, // cccaa -> aaccc
|
|
337: 85, // cccac -> acccc
|
|
338: 149, // cccag -> agccc
|
|
339: 213, // cccat -> atccc
|
|
340: 85, // cccca -> acccc
|
|
341: 341, // ccccc -> ccccc
|
|
342: 342, // ccccg -> ccccg
|
|
343: 343, // cccct -> cccct
|
|
344: 86, // cccga -> acccg
|
|
345: 342, // cccgc -> ccccg
|
|
346: 346, // cccgg -> cccgg
|
|
347: 347, // cccgt -> cccgt
|
|
348: 87, // cccta -> accct
|
|
349: 343, // ccctc -> cccct
|
|
350: 350, // ccctg -> ccctg
|
|
351: 351, // ccctt -> ccctt
|
|
352: 22, // ccgaa -> aaccg
|
|
353: 86, // ccgac -> acccg
|
|
354: 150, // ccgag -> agccg
|
|
355: 214, // ccgat -> atccg
|
|
356: 89, // ccgca -> accgc
|
|
357: 342, // ccgcc -> ccccg
|
|
358: 358, // ccgcg -> ccgcg
|
|
359: 359, // ccgct -> ccgct
|
|
360: 90, // ccgga -> accgg
|
|
361: 346, // ccggc -> cccgg
|
|
362: 362, // ccggg -> ccggg
|
|
363: 363, // ccggt -> ccggt
|
|
364: 91, // ccgta -> accgt
|
|
365: 347, // ccgtc -> cccgt
|
|
366: 366, // ccgtg -> ccgtg
|
|
367: 367, // ccgtt -> ccgtt
|
|
368: 23, // cctaa -> aacct
|
|
369: 87, // cctac -> accct
|
|
370: 151, // cctag -> agcct
|
|
371: 215, // cctat -> atcct
|
|
372: 93, // cctca -> acctc
|
|
373: 343, // cctcc -> cccct
|
|
374: 374, // cctcg -> cctcg
|
|
375: 375, // cctct -> cctct
|
|
376: 94, // cctga -> acctg
|
|
377: 350, // cctgc -> ccctg
|
|
378: 378, // cctgg -> cctgg
|
|
379: 379, // cctgt -> cctgt
|
|
380: 95, // cctta -> acctt
|
|
381: 351, // ccttc -> ccctt
|
|
382: 382, // ccttg -> ccttg
|
|
383: 383, // ccttt -> ccttt
|
|
384: 6, // cgaaa -> aaacg
|
|
385: 22, // cgaac -> aaccg
|
|
386: 38, // cgaag -> aagcg
|
|
387: 54, // cgaat -> aatcg
|
|
388: 70, // cgaca -> acacg
|
|
389: 86, // cgacc -> acccg
|
|
390: 102, // cgacg -> acgcg
|
|
391: 118, // cgact -> actcg
|
|
392: 98, // cgaga -> acgag
|
|
393: 150, // cgagc -> agccg
|
|
394: 166, // cgagg -> aggcg
|
|
395: 182, // cgagt -> agtcg
|
|
396: 99, // cgata -> acgat
|
|
397: 214, // cgatc -> atccg
|
|
398: 230, // cgatg -> atgcg
|
|
399: 246, // cgatt -> attcg
|
|
400: 25, // cgcaa -> aacgc
|
|
401: 89, // cgcac -> accgc
|
|
402: 153, // cgcag -> agcgc
|
|
403: 217, // cgcat -> atcgc
|
|
404: 101, // cgcca -> acgcc
|
|
405: 342, // cgccc -> ccccg
|
|
406: 358, // cgccg -> ccgcg
|
|
407: 374, // cgcct -> cctcg
|
|
408: 102, // cgcga -> acgcg
|
|
409: 358, // cgcgc -> ccgcg
|
|
410: 410, // cgcgg -> cgcgg
|
|
411: 411, // cgcgt -> cgcgt
|
|
412: 103, // cgcta -> acgct
|
|
413: 359, // cgctc -> ccgct
|
|
414: 414, // cgctg -> cgctg
|
|
415: 415, // cgctt -> cgctt
|
|
416: 26, // cggaa -> aacgg
|
|
417: 90, // cggac -> accgg
|
|
418: 154, // cggag -> agcgg
|
|
419: 218, // cggat -> atcgg
|
|
420: 105, // cggca -> acggc
|
|
421: 346, // cggcc -> cccgg
|
|
422: 410, // cggcg -> cgcgg
|
|
423: 423, // cggct -> cggct
|
|
424: 106, // cggga -> acggg
|
|
425: 362, // cgggc -> ccggg
|
|
426: 426, // cgggg -> cgggg
|
|
427: 427, // cgggt -> cgggt
|
|
428: 107, // cggta -> acggt
|
|
429: 363, // cggtc -> ccggt
|
|
430: 430, // cggtg -> cggtg
|
|
431: 431, // cggtt -> cggtt
|
|
432: 27, // cgtaa -> aacgt
|
|
433: 91, // cgtac -> accgt
|
|
434: 155, // cgtag -> agcgt
|
|
435: 219, // cgtat -> atcgt
|
|
436: 109, // cgtca -> acgtc
|
|
437: 347, // cgtcc -> cccgt
|
|
438: 411, // cgtcg -> cgcgt
|
|
439: 439, // cgtct -> cgtct
|
|
440: 110, // cgtga -> acgtg
|
|
441: 366, // cgtgc -> ccgtg
|
|
442: 442, // cgtgg -> cgtgg
|
|
443: 443, // cgtgt -> cgtgt
|
|
444: 111, // cgtta -> acgtt
|
|
445: 367, // cgttc -> ccgtt
|
|
446: 446, // cgttg -> cgttg
|
|
447: 447, // cgttt -> cgttt
|
|
448: 7, // ctaaa -> aaact
|
|
449: 23, // ctaac -> aacct
|
|
450: 39, // ctaag -> aagct
|
|
451: 55, // ctaat -> aatct
|
|
452: 71, // ctaca -> acact
|
|
453: 87, // ctacc -> accct
|
|
454: 103, // ctacg -> acgct
|
|
455: 119, // ctact -> actct
|
|
456: 114, // ctaga -> actag
|
|
457: 151, // ctagc -> agcct
|
|
458: 167, // ctagg -> aggct
|
|
459: 183, // ctagt -> agtct
|
|
460: 115, // ctata -> actat
|
|
461: 215, // ctatc -> atcct
|
|
462: 231, // ctatg -> atgct
|
|
463: 247, // ctatt -> attct
|
|
464: 29, // ctcaa -> aactc
|
|
465: 93, // ctcac -> acctc
|
|
466: 157, // ctcag -> agctc
|
|
467: 221, // ctcat -> atctc
|
|
468: 117, // ctcca -> actcc
|
|
469: 343, // ctccc -> cccct
|
|
470: 359, // ctccg -> ccgct
|
|
471: 375, // ctcct -> cctct
|
|
472: 118, // ctcga -> actcg
|
|
473: 374, // ctcgc -> cctcg
|
|
474: 423, // ctcgg -> cggct
|
|
475: 439, // ctcgt -> cgtct
|
|
476: 119, // ctcta -> actct
|
|
477: 375, // ctctc -> cctct
|
|
478: 478, // ctctg -> ctctg
|
|
479: 479, // ctctt -> ctctt
|
|
480: 30, // ctgaa -> aactg
|
|
481: 94, // ctgac -> acctg
|
|
482: 158, // ctgag -> agctg
|
|
483: 222, // ctgat -> atctg
|
|
484: 121, // ctgca -> actgc
|
|
485: 350, // ctgcc -> ccctg
|
|
486: 414, // ctgcg -> cgctg
|
|
487: 478, // ctgct -> ctctg
|
|
488: 122, // ctgga -> actgg
|
|
489: 378, // ctggc -> cctgg
|
|
490: 490, // ctggg -> ctggg
|
|
491: 491, // ctggt -> ctggt
|
|
492: 123, // ctgta -> actgt
|
|
493: 379, // ctgtc -> cctgt
|
|
494: 494, // ctgtg -> ctgtg
|
|
495: 495, // ctgtt -> ctgtt
|
|
496: 31, // cttaa -> aactt
|
|
497: 95, // cttac -> acctt
|
|
498: 159, // cttag -> agctt
|
|
499: 223, // cttat -> atctt
|
|
500: 125, // cttca -> acttc
|
|
501: 351, // cttcc -> ccctt
|
|
502: 415, // cttcg -> cgctt
|
|
503: 479, // cttct -> ctctt
|
|
504: 126, // cttga -> acttg
|
|
505: 382, // cttgc -> ccttg
|
|
506: 506, // cttgg -> cttgg
|
|
507: 507, // cttgt -> cttgt
|
|
508: 127, // cttta -> acttt
|
|
509: 383, // ctttc -> ccttt
|
|
510: 510, // ctttg -> ctttg
|
|
511: 511, // ctttt -> ctttt
|
|
512: 2, // gaaaa -> aaaag
|
|
513: 6, // gaaac -> aaacg
|
|
514: 10, // gaaag -> aaagg
|
|
515: 14, // gaaat -> aaatg
|
|
516: 18, // gaaca -> aacag
|
|
517: 22, // gaacc -> aaccg
|
|
518: 26, // gaacg -> aacgg
|
|
519: 30, // gaact -> aactg
|
|
520: 34, // gaaga -> aagag
|
|
521: 38, // gaagc -> aagcg
|
|
522: 42, // gaagg -> aaggg
|
|
523: 46, // gaagt -> aagtg
|
|
524: 50, // gaata -> aatag
|
|
525: 54, // gaatc -> aatcg
|
|
526: 58, // gaatg -> aatgg
|
|
527: 62, // gaatt -> aattg
|
|
528: 33, // gacaa -> aagac
|
|
529: 70, // gacac -> acacg
|
|
530: 74, // gacag -> acagg
|
|
531: 78, // gacat -> acatg
|
|
532: 82, // gacca -> accag
|
|
533: 86, // gaccc -> acccg
|
|
534: 90, // gaccg -> accgg
|
|
535: 94, // gacct -> acctg
|
|
536: 98, // gacga -> acgag
|
|
537: 102, // gacgc -> acgcg
|
|
538: 106, // gacgg -> acggg
|
|
539: 110, // gacgt -> acgtg
|
|
540: 114, // gacta -> actag
|
|
541: 118, // gactc -> actcg
|
|
542: 122, // gactg -> actgg
|
|
543: 126, // gactt -> acttg
|
|
544: 34, // gagaa -> aagag
|
|
545: 98, // gagac -> acgag
|
|
546: 138, // gagag -> agagg
|
|
547: 142, // gagat -> agatg
|
|
548: 137, // gagca -> agagc
|
|
549: 150, // gagcc -> agccg
|
|
550: 154, // gagcg -> agcgg
|
|
551: 158, // gagct -> agctg
|
|
552: 138, // gagga -> agagg
|
|
553: 166, // gaggc -> aggcg
|
|
554: 170, // gaggg -> agggg
|
|
555: 174, // gaggt -> aggtg
|
|
556: 139, // gagta -> agagt
|
|
557: 182, // gagtc -> agtcg
|
|
558: 186, // gagtg -> agtgg
|
|
559: 190, // gagtt -> agttg
|
|
560: 35, // gataa -> aagat
|
|
561: 99, // gatac -> acgat
|
|
562: 163, // gatag -> aggat
|
|
563: 206, // gatat -> atatg
|
|
564: 141, // gatca -> agatc
|
|
565: 214, // gatcc -> atccg
|
|
566: 218, // gatcg -> atcgg
|
|
567: 222, // gatct -> atctg
|
|
568: 142, // gatga -> agatg
|
|
569: 230, // gatgc -> atgcg
|
|
570: 234, // gatgg -> atggg
|
|
571: 238, // gatgt -> atgtg
|
|
572: 143, // gatta -> agatt
|
|
573: 246, // gattc -> attcg
|
|
574: 250, // gattg -> attgg
|
|
575: 254, // gattt -> atttg
|
|
576: 9, // gcaaa -> aaagc
|
|
577: 25, // gcaac -> aacgc
|
|
578: 41, // gcaag -> aaggc
|
|
579: 57, // gcaat -> aatgc
|
|
580: 73, // gcaca -> acagc
|
|
581: 89, // gcacc -> accgc
|
|
582: 105, // gcacg -> acggc
|
|
583: 121, // gcact -> actgc
|
|
584: 137, // gcaga -> agagc
|
|
585: 153, // gcagc -> agcgc
|
|
586: 169, // gcagg -> agggc
|
|
587: 185, // gcagt -> agtgc
|
|
588: 147, // gcata -> agcat
|
|
589: 217, // gcatc -> atcgc
|
|
590: 233, // gcatg -> atggc
|
|
591: 249, // gcatt -> attgc
|
|
592: 37, // gccaa -> aagcc
|
|
593: 101, // gccac -> acgcc
|
|
594: 165, // gccag -> aggcc
|
|
595: 229, // gccat -> atgcc
|
|
596: 149, // gccca -> agccc
|
|
597: 342, // gcccc -> ccccg
|
|
598: 346, // gcccg -> cccgg
|
|
599: 350, // gccct -> ccctg
|
|
600: 150, // gccga -> agccg
|
|
601: 358, // gccgc -> ccgcg
|
|
602: 362, // gccgg -> ccggg
|
|
603: 366, // gccgt -> ccgtg
|
|
604: 151, // gccta -> agcct
|
|
605: 374, // gcctc -> cctcg
|
|
606: 378, // gcctg -> cctgg
|
|
607: 382, // gcctt -> ccttg
|
|
608: 38, // gcgaa -> aagcg
|
|
609: 102, // gcgac -> acgcg
|
|
610: 166, // gcgag -> aggcg
|
|
611: 230, // gcgat -> atgcg
|
|
612: 153, // gcgca -> agcgc
|
|
613: 358, // gcgcc -> ccgcg
|
|
614: 410, // gcgcg -> cgcgg
|
|
615: 414, // gcgct -> cgctg
|
|
616: 154, // gcgga -> agcgg
|
|
617: 410, // gcggc -> cgcgg
|
|
618: 426, // gcggg -> cgggg
|
|
619: 430, // gcggt -> cggtg
|
|
620: 155, // gcgta -> agcgt
|
|
621: 411, // gcgtc -> cgcgt
|
|
622: 442, // gcgtg -> cgtgg
|
|
623: 446, // gcgtt -> cgttg
|
|
624: 39, // gctaa -> aagct
|
|
625: 103, // gctac -> acgct
|
|
626: 167, // gctag -> aggct
|
|
627: 231, // gctat -> atgct
|
|
628: 157, // gctca -> agctc
|
|
629: 359, // gctcc -> ccgct
|
|
630: 423, // gctcg -> cggct
|
|
631: 478, // gctct -> ctctg
|
|
632: 158, // gctga -> agctg
|
|
633: 414, // gctgc -> cgctg
|
|
634: 490, // gctgg -> ctggg
|
|
635: 494, // gctgt -> ctgtg
|
|
636: 159, // gctta -> agctt
|
|
637: 415, // gcttc -> cgctt
|
|
638: 506, // gcttg -> cttgg
|
|
639: 510, // gcttt -> ctttg
|
|
640: 10, // ggaaa -> aaagg
|
|
641: 26, // ggaac -> aacgg
|
|
642: 42, // ggaag -> aaggg
|
|
643: 58, // ggaat -> aatgg
|
|
644: 74, // ggaca -> acagg
|
|
645: 90, // ggacc -> accgg
|
|
646: 106, // ggacg -> acggg
|
|
647: 122, // ggact -> actgg
|
|
648: 138, // ggaga -> agagg
|
|
649: 154, // ggagc -> agcgg
|
|
650: 170, // ggagg -> agggg
|
|
651: 186, // ggagt -> agtgg
|
|
652: 163, // ggata -> aggat
|
|
653: 218, // ggatc -> atcgg
|
|
654: 234, // ggatg -> atggg
|
|
655: 250, // ggatt -> attgg
|
|
656: 41, // ggcaa -> aaggc
|
|
657: 105, // ggcac -> acggc
|
|
658: 169, // ggcag -> agggc
|
|
659: 233, // ggcat -> atggc
|
|
660: 165, // ggcca -> aggcc
|
|
661: 346, // ggccc -> cccgg
|
|
662: 362, // ggccg -> ccggg
|
|
663: 378, // ggcct -> cctgg
|
|
664: 166, // ggcga -> aggcg
|
|
665: 410, // ggcgc -> cgcgg
|
|
666: 426, // ggcgg -> cgggg
|
|
667: 442, // ggcgt -> cgtgg
|
|
668: 167, // ggcta -> aggct
|
|
669: 423, // ggctc -> cggct
|
|
670: 490, // ggctg -> ctggg
|
|
671: 506, // ggctt -> cttgg
|
|
672: 42, // gggaa -> aaggg
|
|
673: 106, // gggac -> acggg
|
|
674: 170, // gggag -> agggg
|
|
675: 234, // gggat -> atggg
|
|
676: 169, // gggca -> agggc
|
|
677: 362, // gggcc -> ccggg
|
|
678: 426, // gggcg -> cgggg
|
|
679: 490, // gggct -> ctggg
|
|
680: 170, // gggga -> agggg
|
|
681: 426, // ggggc -> cgggg
|
|
682: 682, // ggggg -> ggggg
|
|
683: 683, // ggggt -> ggggt
|
|
684: 171, // gggta -> agggt
|
|
685: 427, // gggtc -> cgggt
|
|
686: 683, // gggtg -> ggggt
|
|
687: 687, // gggtt -> gggtt
|
|
688: 43, // ggtaa -> aaggt
|
|
689: 107, // ggtac -> acggt
|
|
690: 171, // ggtag -> agggt
|
|
691: 235, // ggtat -> atggt
|
|
692: 173, // ggtca -> aggtc
|
|
693: 363, // ggtcc -> ccggt
|
|
694: 427, // ggtcg -> cgggt
|
|
695: 491, // ggtct -> ctggt
|
|
696: 174, // ggtga -> aggtg
|
|
697: 430, // ggtgc -> cggtg
|
|
698: 683, // ggtgg -> ggggt
|
|
699: 699, // ggtgt -> ggtgt
|
|
700: 175, // ggtta -> aggtt
|
|
701: 431, // ggttc -> cggtt
|
|
702: 687, // ggttg -> gggtt
|
|
703: 703, // ggttt -> ggttt
|
|
704: 11, // gtaaa -> aaagt
|
|
705: 27, // gtaac -> aacgt
|
|
706: 43, // gtaag -> aaggt
|
|
707: 59, // gtaat -> aatgt
|
|
708: 75, // gtaca -> acagt
|
|
709: 91, // gtacc -> accgt
|
|
710: 107, // gtacg -> acggt
|
|
711: 123, // gtact -> actgt
|
|
712: 139, // gtaga -> agagt
|
|
713: 155, // gtagc -> agcgt
|
|
714: 171, // gtagg -> agggt
|
|
715: 187, // gtagt -> agtgt
|
|
716: 179, // gtata -> agtat
|
|
717: 219, // gtatc -> atcgt
|
|
718: 235, // gtatg -> atggt
|
|
719: 251, // gtatt -> attgt
|
|
720: 45, // gtcaa -> aagtc
|
|
721: 109, // gtcac -> acgtc
|
|
722: 173, // gtcag -> aggtc
|
|
723: 237, // gtcat -> atgtc
|
|
724: 181, // gtcca -> agtcc
|
|
725: 347, // gtccc -> cccgt
|
|
726: 363, // gtccg -> ccggt
|
|
727: 379, // gtcct -> cctgt
|
|
728: 182, // gtcga -> agtcg
|
|
729: 411, // gtcgc -> cgcgt
|
|
730: 427, // gtcgg -> cgggt
|
|
731: 443, // gtcgt -> cgtgt
|
|
732: 183, // gtcta -> agtct
|
|
733: 439, // gtctc -> cgtct
|
|
734: 491, // gtctg -> ctggt
|
|
735: 507, // gtctt -> cttgt
|
|
736: 46, // gtgaa -> aagtg
|
|
737: 110, // gtgac -> acgtg
|
|
738: 174, // gtgag -> aggtg
|
|
739: 238, // gtgat -> atgtg
|
|
740: 185, // gtgca -> agtgc
|
|
741: 366, // gtgcc -> ccgtg
|
|
742: 430, // gtgcg -> cggtg
|
|
743: 494, // gtgct -> ctgtg
|
|
744: 186, // gtgga -> agtgg
|
|
745: 442, // gtggc -> cgtgg
|
|
746: 683, // gtggg -> ggggt
|
|
747: 699, // gtggt -> ggtgt
|
|
748: 187, // gtgta -> agtgt
|
|
749: 443, // gtgtc -> cgtgt
|
|
750: 699, // gtgtg -> ggtgt
|
|
751: 751, // gtgtt -> gtgtt
|
|
752: 47, // gttaa -> aagtt
|
|
753: 111, // gttac -> acgtt
|
|
754: 175, // gttag -> aggtt
|
|
755: 239, // gttat -> atgtt
|
|
756: 189, // gttca -> agttc
|
|
757: 367, // gttcc -> ccgtt
|
|
758: 431, // gttcg -> cggtt
|
|
759: 495, // gttct -> ctgtt
|
|
760: 190, // gttga -> agttg
|
|
761: 446, // gttgc -> cgttg
|
|
762: 687, // gttgg -> gggtt
|
|
763: 751, // gttgt -> gtgtt
|
|
764: 191, // gttta -> agttt
|
|
765: 447, // gtttc -> cgttt
|
|
766: 703, // gtttg -> ggttt
|
|
767: 767, // gtttt -> gtttt
|
|
768: 3, // taaaa -> aaaat
|
|
769: 7, // taaac -> aaact
|
|
770: 11, // taaag -> aaagt
|
|
771: 15, // taaat -> aaatt
|
|
772: 19, // taaca -> aacat
|
|
773: 23, // taacc -> aacct
|
|
774: 27, // taacg -> aacgt
|
|
775: 31, // taact -> aactt
|
|
776: 35, // taaga -> aagat
|
|
777: 39, // taagc -> aagct
|
|
778: 43, // taagg -> aaggt
|
|
779: 47, // taagt -> aagtt
|
|
780: 51, // taata -> aatat
|
|
781: 55, // taatc -> aatct
|
|
782: 59, // taatg -> aatgt
|
|
783: 63, // taatt -> aattt
|
|
784: 49, // tacaa -> aatac
|
|
785: 71, // tacac -> acact
|
|
786: 75, // tacag -> acagt
|
|
787: 79, // tacat -> acatt
|
|
788: 83, // tacca -> accat
|
|
789: 87, // taccc -> accct
|
|
790: 91, // taccg -> accgt
|
|
791: 95, // tacct -> acctt
|
|
792: 99, // tacga -> acgat
|
|
793: 103, // tacgc -> acgct
|
|
794: 107, // tacgg -> acggt
|
|
795: 111, // tacgt -> acgtt
|
|
796: 115, // tacta -> actat
|
|
797: 119, // tactc -> actct
|
|
798: 123, // tactg -> actgt
|
|
799: 127, // tactt -> acttt
|
|
800: 50, // tagaa -> aatag
|
|
801: 114, // tagac -> actag
|
|
802: 139, // tagag -> agagt
|
|
803: 143, // tagat -> agatt
|
|
804: 147, // tagca -> agcat
|
|
805: 151, // tagcc -> agcct
|
|
806: 155, // tagcg -> agcgt
|
|
807: 159, // tagct -> agctt
|
|
808: 163, // tagga -> aggat
|
|
809: 167, // taggc -> aggct
|
|
810: 171, // taggg -> agggt
|
|
811: 175, // taggt -> aggtt
|
|
812: 179, // tagta -> agtat
|
|
813: 183, // tagtc -> agtct
|
|
814: 187, // tagtg -> agtgt
|
|
815: 191, // tagtt -> agttt
|
|
816: 51, // tataa -> aatat
|
|
817: 115, // tatac -> actat
|
|
818: 179, // tatag -> agtat
|
|
819: 207, // tatat -> atatt
|
|
820: 205, // tatca -> atatc
|
|
821: 215, // tatcc -> atcct
|
|
822: 219, // tatcg -> atcgt
|
|
823: 223, // tatct -> atctt
|
|
824: 206, // tatga -> atatg
|
|
825: 231, // tatgc -> atgct
|
|
826: 235, // tatgg -> atggt
|
|
827: 239, // tatgt -> atgtt
|
|
828: 207, // tatta -> atatt
|
|
829: 247, // tattc -> attct
|
|
830: 251, // tattg -> attgt
|
|
831: 255, // tattt -> atttt
|
|
832: 13, // tcaaa -> aaatc
|
|
833: 29, // tcaac -> aactc
|
|
834: 45, // tcaag -> aagtc
|
|
835: 61, // tcaat -> aattc
|
|
836: 77, // tcaca -> acatc
|
|
837: 93, // tcacc -> acctc
|
|
838: 109, // tcacg -> acgtc
|
|
839: 125, // tcact -> acttc
|
|
840: 141, // tcaga -> agatc
|
|
841: 157, // tcagc -> agctc
|
|
842: 173, // tcagg -> aggtc
|
|
843: 189, // tcagt -> agttc
|
|
844: 205, // tcata -> atatc
|
|
845: 221, // tcatc -> atctc
|
|
846: 237, // tcatg -> atgtc
|
|
847: 253, // tcatt -> atttc
|
|
848: 53, // tccaa -> aatcc
|
|
849: 117, // tccac -> actcc
|
|
850: 181, // tccag -> agtcc
|
|
851: 245, // tccat -> attcc
|
|
852: 213, // tccca -> atccc
|
|
853: 343, // tcccc -> cccct
|
|
854: 347, // tcccg -> cccgt
|
|
855: 351, // tccct -> ccctt
|
|
856: 214, // tccga -> atccg
|
|
857: 359, // tccgc -> ccgct
|
|
858: 363, // tccgg -> ccggt
|
|
859: 367, // tccgt -> ccgtt
|
|
860: 215, // tccta -> atcct
|
|
861: 375, // tcctc -> cctct
|
|
862: 379, // tcctg -> cctgt
|
|
863: 383, // tcctt -> ccttt
|
|
864: 54, // tcgaa -> aatcg
|
|
865: 118, // tcgac -> actcg
|
|
866: 182, // tcgag -> agtcg
|
|
867: 246, // tcgat -> attcg
|
|
868: 217, // tcgca -> atcgc
|
|
869: 374, // tcgcc -> cctcg
|
|
870: 411, // tcgcg -> cgcgt
|
|
871: 415, // tcgct -> cgctt
|
|
872: 218, // tcgga -> atcgg
|
|
873: 423, // tcggc -> cggct
|
|
874: 427, // tcggg -> cgggt
|
|
875: 431, // tcggt -> cggtt
|
|
876: 219, // tcgta -> atcgt
|
|
877: 439, // tcgtc -> cgtct
|
|
878: 443, // tcgtg -> cgtgt
|
|
879: 447, // tcgtt -> cgttt
|
|
880: 55, // tctaa -> aatct
|
|
881: 119, // tctac -> actct
|
|
882: 183, // tctag -> agtct
|
|
883: 247, // tctat -> attct
|
|
884: 221, // tctca -> atctc
|
|
885: 375, // tctcc -> cctct
|
|
886: 439, // tctcg -> cgtct
|
|
887: 479, // tctct -> ctctt
|
|
888: 222, // tctga -> atctg
|
|
889: 478, // tctgc -> ctctg
|
|
890: 491, // tctgg -> ctggt
|
|
891: 495, // tctgt -> ctgtt
|
|
892: 223, // tctta -> atctt
|
|
893: 479, // tcttc -> ctctt
|
|
894: 507, // tcttg -> cttgt
|
|
895: 511, // tcttt -> ctttt
|
|
896: 14, // tgaaa -> aaatg
|
|
897: 30, // tgaac -> aactg
|
|
898: 46, // tgaag -> aagtg
|
|
899: 62, // tgaat -> aattg
|
|
900: 78, // tgaca -> acatg
|
|
901: 94, // tgacc -> acctg
|
|
902: 110, // tgacg -> acgtg
|
|
903: 126, // tgact -> acttg
|
|
904: 142, // tgaga -> agatg
|
|
905: 158, // tgagc -> agctg
|
|
906: 174, // tgagg -> aggtg
|
|
907: 190, // tgagt -> agttg
|
|
908: 206, // tgata -> atatg
|
|
909: 222, // tgatc -> atctg
|
|
910: 238, // tgatg -> atgtg
|
|
911: 254, // tgatt -> atttg
|
|
912: 57, // tgcaa -> aatgc
|
|
913: 121, // tgcac -> actgc
|
|
914: 185, // tgcag -> agtgc
|
|
915: 249, // tgcat -> attgc
|
|
916: 229, // tgcca -> atgcc
|
|
917: 350, // tgccc -> ccctg
|
|
918: 366, // tgccg -> ccgtg
|
|
919: 382, // tgcct -> ccttg
|
|
920: 230, // tgcga -> atgcg
|
|
921: 414, // tgcgc -> cgctg
|
|
922: 430, // tgcgg -> cggtg
|
|
923: 446, // tgcgt -> cgttg
|
|
924: 231, // tgcta -> atgct
|
|
925: 478, // tgctc -> ctctg
|
|
926: 494, // tgctg -> ctgtg
|
|
927: 510, // tgctt -> ctttg
|
|
928: 58, // tggaa -> aatgg
|
|
929: 122, // tggac -> actgg
|
|
930: 186, // tggag -> agtgg
|
|
931: 250, // tggat -> attgg
|
|
932: 233, // tggca -> atggc
|
|
933: 378, // tggcc -> cctgg
|
|
934: 442, // tggcg -> cgtgg
|
|
935: 506, // tggct -> cttgg
|
|
936: 234, // tggga -> atggg
|
|
937: 490, // tgggc -> ctggg
|
|
938: 683, // tgggg -> ggggt
|
|
939: 687, // tgggt -> gggtt
|
|
940: 235, // tggta -> atggt
|
|
941: 491, // tggtc -> ctggt
|
|
942: 699, // tggtg -> ggtgt
|
|
943: 703, // tggtt -> ggttt
|
|
944: 59, // tgtaa -> aatgt
|
|
945: 123, // tgtac -> actgt
|
|
946: 187, // tgtag -> agtgt
|
|
947: 251, // tgtat -> attgt
|
|
948: 237, // tgtca -> atgtc
|
|
949: 379, // tgtcc -> cctgt
|
|
950: 443, // tgtcg -> cgtgt
|
|
951: 507, // tgtct -> cttgt
|
|
952: 238, // tgtga -> atgtg
|
|
953: 494, // tgtgc -> ctgtg
|
|
954: 699, // tgtgg -> ggtgt
|
|
955: 751, // tgtgt -> gtgtt
|
|
956: 239, // tgtta -> atgtt
|
|
957: 495, // tgttc -> ctgtt
|
|
958: 751, // tgttg -> gtgtt
|
|
959: 767, // tgttt -> gtttt
|
|
960: 15, // ttaaa -> aaatt
|
|
961: 31, // ttaac -> aactt
|
|
962: 47, // ttaag -> aagtt
|
|
963: 63, // ttaat -> aattt
|
|
964: 79, // ttaca -> acatt
|
|
965: 95, // ttacc -> acctt
|
|
966: 111, // ttacg -> acgtt
|
|
967: 127, // ttact -> acttt
|
|
968: 143, // ttaga -> agatt
|
|
969: 159, // ttagc -> agctt
|
|
970: 175, // ttagg -> aggtt
|
|
971: 191, // ttagt -> agttt
|
|
972: 207, // ttata -> atatt
|
|
973: 223, // ttatc -> atctt
|
|
974: 239, // ttatg -> atgtt
|
|
975: 255, // ttatt -> atttt
|
|
976: 61, // ttcaa -> aattc
|
|
977: 125, // ttcac -> acttc
|
|
978: 189, // ttcag -> agttc
|
|
979: 253, // ttcat -> atttc
|
|
980: 245, // ttcca -> attcc
|
|
981: 351, // ttccc -> ccctt
|
|
982: 367, // ttccg -> ccgtt
|
|
983: 383, // ttcct -> ccttt
|
|
984: 246, // ttcga -> attcg
|
|
985: 415, // ttcgc -> cgctt
|
|
986: 431, // ttcgg -> cggtt
|
|
987: 447, // ttcgt -> cgttt
|
|
988: 247, // ttcta -> attct
|
|
989: 479, // ttctc -> ctctt
|
|
990: 495, // ttctg -> ctgtt
|
|
991: 511, // ttctt -> ctttt
|
|
992: 62, // ttgaa -> aattg
|
|
993: 126, // ttgac -> acttg
|
|
994: 190, // ttgag -> agttg
|
|
995: 254, // ttgat -> atttg
|
|
996: 249, // ttgca -> attgc
|
|
997: 382, // ttgcc -> ccttg
|
|
998: 446, // ttgcg -> cgttg
|
|
999: 510, // ttgct -> ctttg
|
|
1000: 250, // ttgga -> attgg
|
|
1001: 506, // ttggc -> cttgg
|
|
1002: 687, // ttggg -> gggtt
|
|
1003: 703, // ttggt -> ggttt
|
|
1004: 251, // ttgta -> attgt
|
|
1005: 507, // ttgtc -> cttgt
|
|
1006: 751, // ttgtg -> gtgtt
|
|
1007: 767, // ttgtt -> gtttt
|
|
1008: 63, // tttaa -> aattt
|
|
1009: 127, // tttac -> acttt
|
|
1010: 191, // tttag -> agttt
|
|
1011: 255, // tttat -> atttt
|
|
1012: 253, // tttca -> atttc
|
|
1013: 383, // tttcc -> ccttt
|
|
1014: 447, // tttcg -> cgttt
|
|
1015: 511, // tttct -> ctttt
|
|
1016: 254, // tttga -> atttg
|
|
1017: 510, // tttgc -> ctttg
|
|
1018: 703, // tttgg -> ggttt
|
|
1019: 767, // tttgt -> gtttt
|
|
1020: 255, // tttta -> atttt
|
|
1021: 511, // ttttc -> ctttt
|
|
1022: 767, // ttttg -> gtttt
|
|
1023: 1023, // ttttt -> ttttt
|
|
},
|
|
6: {
|
|
0: 0, // aaaaaa -> aaaaaa
|
|
1: 1, // aaaaac -> aaaaac
|
|
2: 2, // aaaaag -> aaaaag
|
|
3: 3, // aaaaat -> aaaaat
|
|
4: 1, // aaaaca -> aaaaac
|
|
5: 5, // aaaacc -> aaaacc
|
|
6: 6, // aaaacg -> aaaacg
|
|
7: 7, // aaaact -> aaaact
|
|
8: 2, // aaaaga -> aaaaag
|
|
9: 9, // aaaagc -> aaaagc
|
|
10: 10, // aaaagg -> aaaagg
|
|
11: 11, // aaaagt -> aaaagt
|
|
12: 3, // aaaata -> aaaaat
|
|
13: 13, // aaaatc -> aaaatc
|
|
14: 14, // aaaatg -> aaaatg
|
|
15: 15, // aaaatt -> aaaatt
|
|
16: 1, // aaacaa -> aaaaac
|
|
17: 17, // aaacac -> aaacac
|
|
18: 18, // aaacag -> aaacag
|
|
19: 19, // aaacat -> aaacat
|
|
20: 5, // aaacca -> aaaacc
|
|
21: 21, // aaaccc -> aaaccc
|
|
22: 22, // aaaccg -> aaaccg
|
|
23: 23, // aaacct -> aaacct
|
|
24: 6, // aaacga -> aaaacg
|
|
25: 25, // aaacgc -> aaacgc
|
|
26: 26, // aaacgg -> aaacgg
|
|
27: 27, // aaacgt -> aaacgt
|
|
28: 7, // aaacta -> aaaact
|
|
29: 29, // aaactc -> aaactc
|
|
30: 30, // aaactg -> aaactg
|
|
31: 31, // aaactt -> aaactt
|
|
32: 2, // aaagaa -> aaaaag
|
|
33: 33, // aaagac -> aaagac
|
|
34: 34, // aaagag -> aaagag
|
|
35: 35, // aaagat -> aaagat
|
|
36: 9, // aaagca -> aaaagc
|
|
37: 37, // aaagcc -> aaagcc
|
|
38: 38, // aaagcg -> aaagcg
|
|
39: 39, // aaagct -> aaagct
|
|
40: 10, // aaagga -> aaaagg
|
|
41: 41, // aaaggc -> aaaggc
|
|
42: 42, // aaaggg -> aaaggg
|
|
43: 43, // aaaggt -> aaaggt
|
|
44: 11, // aaagta -> aaaagt
|
|
45: 45, // aaagtc -> aaagtc
|
|
46: 46, // aaagtg -> aaagtg
|
|
47: 47, // aaagtt -> aaagtt
|
|
48: 3, // aaataa -> aaaaat
|
|
49: 49, // aaatac -> aaatac
|
|
50: 50, // aaatag -> aaatag
|
|
51: 51, // aaatat -> aaatat
|
|
52: 13, // aaatca -> aaaatc
|
|
53: 53, // aaatcc -> aaatcc
|
|
54: 54, // aaatcg -> aaatcg
|
|
55: 55, // aaatct -> aaatct
|
|
56: 14, // aaatga -> aaaatg
|
|
57: 57, // aaatgc -> aaatgc
|
|
58: 58, // aaatgg -> aaatgg
|
|
59: 59, // aaatgt -> aaatgt
|
|
60: 15, // aaatta -> aaaatt
|
|
61: 61, // aaattc -> aaattc
|
|
62: 62, // aaattg -> aaattg
|
|
63: 63, // aaattt -> aaattt
|
|
64: 1, // aacaaa -> aaaaac
|
|
65: 65, // aacaac -> aacaac
|
|
66: 66, // aacaag -> aacaag
|
|
67: 67, // aacaat -> aacaat
|
|
68: 17, // aacaca -> aaacac
|
|
69: 69, // aacacc -> aacacc
|
|
70: 70, // aacacg -> aacacg
|
|
71: 71, // aacact -> aacact
|
|
72: 18, // aacaga -> aaacag
|
|
73: 73, // aacagc -> aacagc
|
|
74: 74, // aacagg -> aacagg
|
|
75: 75, // aacagt -> aacagt
|
|
76: 19, // aacata -> aaacat
|
|
77: 77, // aacatc -> aacatc
|
|
78: 78, // aacatg -> aacatg
|
|
79: 79, // aacatt -> aacatt
|
|
80: 5, // aaccaa -> aaaacc
|
|
81: 81, // aaccac -> aaccac
|
|
82: 82, // aaccag -> aaccag
|
|
83: 83, // aaccat -> aaccat
|
|
84: 21, // aaccca -> aaaccc
|
|
85: 85, // aacccc -> aacccc
|
|
86: 86, // aacccg -> aacccg
|
|
87: 87, // aaccct -> aaccct
|
|
88: 22, // aaccga -> aaaccg
|
|
89: 89, // aaccgc -> aaccgc
|
|
90: 90, // aaccgg -> aaccgg
|
|
91: 91, // aaccgt -> aaccgt
|
|
92: 23, // aaccta -> aaacct
|
|
93: 93, // aacctc -> aacctc
|
|
94: 94, // aacctg -> aacctg
|
|
95: 95, // aacctt -> aacctt
|
|
96: 6, // aacgaa -> aaaacg
|
|
97: 97, // aacgac -> aacgac
|
|
98: 98, // aacgag -> aacgag
|
|
99: 99, // aacgat -> aacgat
|
|
100: 25, // aacgca -> aaacgc
|
|
101: 101, // aacgcc -> aacgcc
|
|
102: 102, // aacgcg -> aacgcg
|
|
103: 103, // aacgct -> aacgct
|
|
104: 26, // aacgga -> aaacgg
|
|
105: 105, // aacggc -> aacggc
|
|
106: 106, // aacggg -> aacggg
|
|
107: 107, // aacggt -> aacggt
|
|
108: 27, // aacgta -> aaacgt
|
|
109: 109, // aacgtc -> aacgtc
|
|
110: 110, // aacgtg -> aacgtg
|
|
111: 111, // aacgtt -> aacgtt
|
|
112: 7, // aactaa -> aaaact
|
|
113: 113, // aactac -> aactac
|
|
114: 114, // aactag -> aactag
|
|
115: 115, // aactat -> aactat
|
|
116: 29, // aactca -> aaactc
|
|
117: 117, // aactcc -> aactcc
|
|
118: 118, // aactcg -> aactcg
|
|
119: 119, // aactct -> aactct
|
|
120: 30, // aactga -> aaactg
|
|
121: 121, // aactgc -> aactgc
|
|
122: 122, // aactgg -> aactgg
|
|
123: 123, // aactgt -> aactgt
|
|
124: 31, // aactta -> aaactt
|
|
125: 125, // aacttc -> aacttc
|
|
126: 126, // aacttg -> aacttg
|
|
127: 127, // aacttt -> aacttt
|
|
128: 2, // aagaaa -> aaaaag
|
|
129: 66, // aagaac -> aacaag
|
|
130: 130, // aagaag -> aagaag
|
|
131: 131, // aagaat -> aagaat
|
|
132: 33, // aagaca -> aaagac
|
|
133: 133, // aagacc -> aagacc
|
|
134: 134, // aagacg -> aagacg
|
|
135: 135, // aagact -> aagact
|
|
136: 34, // aagaga -> aaagag
|
|
137: 137, // aagagc -> aagagc
|
|
138: 138, // aagagg -> aagagg
|
|
139: 139, // aagagt -> aagagt
|
|
140: 35, // aagata -> aaagat
|
|
141: 141, // aagatc -> aagatc
|
|
142: 142, // aagatg -> aagatg
|
|
143: 143, // aagatt -> aagatt
|
|
144: 9, // aagcaa -> aaaagc
|
|
145: 145, // aagcac -> aagcac
|
|
146: 146, // aagcag -> aagcag
|
|
147: 147, // aagcat -> aagcat
|
|
148: 37, // aagcca -> aaagcc
|
|
149: 149, // aagccc -> aagccc
|
|
150: 150, // aagccg -> aagccg
|
|
151: 151, // aagcct -> aagcct
|
|
152: 38, // aagcga -> aaagcg
|
|
153: 153, // aagcgc -> aagcgc
|
|
154: 154, // aagcgg -> aagcgg
|
|
155: 155, // aagcgt -> aagcgt
|
|
156: 39, // aagcta -> aaagct
|
|
157: 157, // aagctc -> aagctc
|
|
158: 158, // aagctg -> aagctg
|
|
159: 159, // aagctt -> aagctt
|
|
160: 10, // aaggaa -> aaaagg
|
|
161: 161, // aaggac -> aaggac
|
|
162: 162, // aaggag -> aaggag
|
|
163: 163, // aaggat -> aaggat
|
|
164: 41, // aaggca -> aaaggc
|
|
165: 165, // aaggcc -> aaggcc
|
|
166: 166, // aaggcg -> aaggcg
|
|
167: 167, // aaggct -> aaggct
|
|
168: 42, // aaggga -> aaaggg
|
|
169: 169, // aagggc -> aagggc
|
|
170: 170, // aagggg -> aagggg
|
|
171: 171, // aagggt -> aagggt
|
|
172: 43, // aaggta -> aaaggt
|
|
173: 173, // aaggtc -> aaggtc
|
|
174: 174, // aaggtg -> aaggtg
|
|
175: 175, // aaggtt -> aaggtt
|
|
176: 11, // aagtaa -> aaaagt
|
|
177: 177, // aagtac -> aagtac
|
|
178: 178, // aagtag -> aagtag
|
|
179: 179, // aagtat -> aagtat
|
|
180: 45, // aagtca -> aaagtc
|
|
181: 181, // aagtcc -> aagtcc
|
|
182: 182, // aagtcg -> aagtcg
|
|
183: 183, // aagtct -> aagtct
|
|
184: 46, // aagtga -> aaagtg
|
|
185: 185, // aagtgc -> aagtgc
|
|
186: 186, // aagtgg -> aagtgg
|
|
187: 187, // aagtgt -> aagtgt
|
|
188: 47, // aagtta -> aaagtt
|
|
189: 189, // aagttc -> aagttc
|
|
190: 190, // aagttg -> aagttg
|
|
191: 191, // aagttt -> aagttt
|
|
192: 3, // aataaa -> aaaaat
|
|
193: 67, // aataac -> aacaat
|
|
194: 131, // aataag -> aagaat
|
|
195: 195, // aataat -> aataat
|
|
196: 49, // aataca -> aaatac
|
|
197: 197, // aatacc -> aatacc
|
|
198: 198, // aatacg -> aatacg
|
|
199: 199, // aatact -> aatact
|
|
200: 50, // aataga -> aaatag
|
|
201: 201, // aatagc -> aatagc
|
|
202: 202, // aatagg -> aatagg
|
|
203: 203, // aatagt -> aatagt
|
|
204: 51, // aatata -> aaatat
|
|
205: 205, // aatatc -> aatatc
|
|
206: 206, // aatatg -> aatatg
|
|
207: 207, // aatatt -> aatatt
|
|
208: 13, // aatcaa -> aaaatc
|
|
209: 209, // aatcac -> aatcac
|
|
210: 210, // aatcag -> aatcag
|
|
211: 211, // aatcat -> aatcat
|
|
212: 53, // aatcca -> aaatcc
|
|
213: 213, // aatccc -> aatccc
|
|
214: 214, // aatccg -> aatccg
|
|
215: 215, // aatcct -> aatcct
|
|
216: 54, // aatcga -> aaatcg
|
|
217: 217, // aatcgc -> aatcgc
|
|
218: 218, // aatcgg -> aatcgg
|
|
219: 219, // aatcgt -> aatcgt
|
|
220: 55, // aatcta -> aaatct
|
|
221: 221, // aatctc -> aatctc
|
|
222: 222, // aatctg -> aatctg
|
|
223: 223, // aatctt -> aatctt
|
|
224: 14, // aatgaa -> aaaatg
|
|
225: 225, // aatgac -> aatgac
|
|
226: 226, // aatgag -> aatgag
|
|
227: 227, // aatgat -> aatgat
|
|
228: 57, // aatgca -> aaatgc
|
|
229: 229, // aatgcc -> aatgcc
|
|
230: 230, // aatgcg -> aatgcg
|
|
231: 231, // aatgct -> aatgct
|
|
232: 58, // aatgga -> aaatgg
|
|
233: 233, // aatggc -> aatggc
|
|
234: 234, // aatggg -> aatggg
|
|
235: 235, // aatggt -> aatggt
|
|
236: 59, // aatgta -> aaatgt
|
|
237: 237, // aatgtc -> aatgtc
|
|
238: 238, // aatgtg -> aatgtg
|
|
239: 239, // aatgtt -> aatgtt
|
|
240: 15, // aattaa -> aaaatt
|
|
241: 241, // aattac -> aattac
|
|
242: 242, // aattag -> aattag
|
|
243: 243, // aattat -> aattat
|
|
244: 61, // aattca -> aaattc
|
|
245: 245, // aattcc -> aattcc
|
|
246: 246, // aattcg -> aattcg
|
|
247: 247, // aattct -> aattct
|
|
248: 62, // aattga -> aaattg
|
|
249: 249, // aattgc -> aattgc
|
|
250: 250, // aattgg -> aattgg
|
|
251: 251, // aattgt -> aattgt
|
|
252: 63, // aattta -> aaattt
|
|
253: 253, // aatttc -> aatttc
|
|
254: 254, // aatttg -> aatttg
|
|
255: 255, // aatttt -> aatttt
|
|
256: 1, // acaaaa -> aaaaac
|
|
257: 17, // acaaac -> aaacac
|
|
258: 33, // acaaag -> aaagac
|
|
259: 49, // acaaat -> aaatac
|
|
260: 65, // acaaca -> aacaac
|
|
261: 81, // acaacc -> aaccac
|
|
262: 97, // acaacg -> aacgac
|
|
263: 113, // acaact -> aactac
|
|
264: 66, // acaaga -> aacaag
|
|
265: 145, // acaagc -> aagcac
|
|
266: 161, // acaagg -> aaggac
|
|
267: 177, // acaagt -> aagtac
|
|
268: 67, // acaata -> aacaat
|
|
269: 209, // acaatc -> aatcac
|
|
270: 225, // acaatg -> aatgac
|
|
271: 241, // acaatt -> aattac
|
|
272: 17, // acacaa -> aaacac
|
|
273: 273, // acacac -> acacac
|
|
274: 274, // acacag -> acacag
|
|
275: 275, // acacat -> acacat
|
|
276: 69, // acacca -> aacacc
|
|
277: 277, // acaccc -> acaccc
|
|
278: 278, // acaccg -> acaccg
|
|
279: 279, // acacct -> acacct
|
|
280: 70, // acacga -> aacacg
|
|
281: 281, // acacgc -> acacgc
|
|
282: 282, // acacgg -> acacgg
|
|
283: 283, // acacgt -> acacgt
|
|
284: 71, // acacta -> aacact
|
|
285: 285, // acactc -> acactc
|
|
286: 286, // acactg -> acactg
|
|
287: 287, // acactt -> acactt
|
|
288: 18, // acagaa -> aaacag
|
|
289: 274, // acagac -> acacag
|
|
290: 290, // acagag -> acagag
|
|
291: 291, // acagat -> acagat
|
|
292: 73, // acagca -> aacagc
|
|
293: 293, // acagcc -> acagcc
|
|
294: 294, // acagcg -> acagcg
|
|
295: 295, // acagct -> acagct
|
|
296: 74, // acagga -> aacagg
|
|
297: 297, // acaggc -> acaggc
|
|
298: 298, // acaggg -> acaggg
|
|
299: 299, // acaggt -> acaggt
|
|
300: 75, // acagta -> aacagt
|
|
301: 301, // acagtc -> acagtc
|
|
302: 302, // acagtg -> acagtg
|
|
303: 303, // acagtt -> acagtt
|
|
304: 19, // acataa -> aaacat
|
|
305: 275, // acatac -> acacat
|
|
306: 306, // acatag -> acatag
|
|
307: 307, // acatat -> acatat
|
|
308: 77, // acatca -> aacatc
|
|
309: 309, // acatcc -> acatcc
|
|
310: 310, // acatcg -> acatcg
|
|
311: 311, // acatct -> acatct
|
|
312: 78, // acatga -> aacatg
|
|
313: 313, // acatgc -> acatgc
|
|
314: 314, // acatgg -> acatgg
|
|
315: 315, // acatgt -> acatgt
|
|
316: 79, // acatta -> aacatt
|
|
317: 317, // acattc -> acattc
|
|
318: 318, // acattg -> acattg
|
|
319: 319, // acattt -> acattt
|
|
320: 5, // accaaa -> aaaacc
|
|
321: 69, // accaac -> aacacc
|
|
322: 133, // accaag -> aagacc
|
|
323: 197, // accaat -> aatacc
|
|
324: 81, // accaca -> aaccac
|
|
325: 325, // accacc -> accacc
|
|
326: 326, // accacg -> accacg
|
|
327: 327, // accact -> accact
|
|
328: 82, // accaga -> aaccag
|
|
329: 329, // accagc -> accagc
|
|
330: 330, // accagg -> accagg
|
|
331: 331, // accagt -> accagt
|
|
332: 83, // accata -> aaccat
|
|
333: 333, // accatc -> accatc
|
|
334: 334, // accatg -> accatg
|
|
335: 335, // accatt -> accatt
|
|
336: 21, // acccaa -> aaaccc
|
|
337: 277, // acccac -> acaccc
|
|
338: 338, // acccag -> acccag
|
|
339: 339, // acccat -> acccat
|
|
340: 85, // acccca -> aacccc
|
|
341: 341, // accccc -> accccc
|
|
342: 342, // accccg -> accccg
|
|
343: 343, // acccct -> acccct
|
|
344: 86, // acccga -> aacccg
|
|
345: 345, // acccgc -> acccgc
|
|
346: 346, // acccgg -> acccgg
|
|
347: 347, // acccgt -> acccgt
|
|
348: 87, // acccta -> aaccct
|
|
349: 349, // accctc -> accctc
|
|
350: 350, // accctg -> accctg
|
|
351: 351, // accctt -> accctt
|
|
352: 22, // accgaa -> aaaccg
|
|
353: 278, // accgac -> acaccg
|
|
354: 354, // accgag -> accgag
|
|
355: 355, // accgat -> accgat
|
|
356: 89, // accgca -> aaccgc
|
|
357: 357, // accgcc -> accgcc
|
|
358: 358, // accgcg -> accgcg
|
|
359: 359, // accgct -> accgct
|
|
360: 90, // accgga -> aaccgg
|
|
361: 361, // accggc -> accggc
|
|
362: 362, // accggg -> accggg
|
|
363: 363, // accggt -> accggt
|
|
364: 91, // accgta -> aaccgt
|
|
365: 365, // accgtc -> accgtc
|
|
366: 366, // accgtg -> accgtg
|
|
367: 367, // accgtt -> accgtt
|
|
368: 23, // acctaa -> aaacct
|
|
369: 279, // acctac -> acacct
|
|
370: 370, // acctag -> acctag
|
|
371: 371, // acctat -> acctat
|
|
372: 93, // acctca -> aacctc
|
|
373: 373, // acctcc -> acctcc
|
|
374: 374, // acctcg -> acctcg
|
|
375: 375, // acctct -> acctct
|
|
376: 94, // acctga -> aacctg
|
|
377: 377, // acctgc -> acctgc
|
|
378: 378, // acctgg -> acctgg
|
|
379: 379, // acctgt -> acctgt
|
|
380: 95, // acctta -> aacctt
|
|
381: 381, // accttc -> accttc
|
|
382: 382, // accttg -> accttg
|
|
383: 383, // accttt -> accttt
|
|
384: 6, // acgaaa -> aaaacg
|
|
385: 70, // acgaac -> aacacg
|
|
386: 134, // acgaag -> aagacg
|
|
387: 198, // acgaat -> aatacg
|
|
388: 97, // acgaca -> aacgac
|
|
389: 326, // acgacc -> accacg
|
|
390: 390, // acgacg -> acgacg
|
|
391: 391, // acgact -> acgact
|
|
392: 98, // acgaga -> aacgag
|
|
393: 393, // acgagc -> acgagc
|
|
394: 394, // acgagg -> acgagg
|
|
395: 395, // acgagt -> acgagt
|
|
396: 99, // acgata -> aacgat
|
|
397: 397, // acgatc -> acgatc
|
|
398: 398, // acgatg -> acgatg
|
|
399: 399, // acgatt -> acgatt
|
|
400: 25, // acgcaa -> aaacgc
|
|
401: 281, // acgcac -> acacgc
|
|
402: 402, // acgcag -> acgcag
|
|
403: 403, // acgcat -> acgcat
|
|
404: 101, // acgcca -> aacgcc
|
|
405: 405, // acgccc -> acgccc
|
|
406: 406, // acgccg -> acgccg
|
|
407: 407, // acgcct -> acgcct
|
|
408: 102, // acgcga -> aacgcg
|
|
409: 409, // acgcgc -> acgcgc
|
|
410: 410, // acgcgg -> acgcgg
|
|
411: 411, // acgcgt -> acgcgt
|
|
412: 103, // acgcta -> aacgct
|
|
413: 413, // acgctc -> acgctc
|
|
414: 414, // acgctg -> acgctg
|
|
415: 415, // acgctt -> acgctt
|
|
416: 26, // acggaa -> aaacgg
|
|
417: 282, // acggac -> acacgg
|
|
418: 418, // acggag -> acggag
|
|
419: 419, // acggat -> acggat
|
|
420: 105, // acggca -> aacggc
|
|
421: 421, // acggcc -> acggcc
|
|
422: 422, // acggcg -> acggcg
|
|
423: 423, // acggct -> acggct
|
|
424: 106, // acggga -> aacggg
|
|
425: 425, // acgggc -> acgggc
|
|
426: 426, // acgggg -> acgggg
|
|
427: 427, // acgggt -> acgggt
|
|
428: 107, // acggta -> aacggt
|
|
429: 429, // acggtc -> acggtc
|
|
430: 430, // acggtg -> acggtg
|
|
431: 431, // acggtt -> acggtt
|
|
432: 27, // acgtaa -> aaacgt
|
|
433: 283, // acgtac -> acacgt
|
|
434: 434, // acgtag -> acgtag
|
|
435: 435, // acgtat -> acgtat
|
|
436: 109, // acgtca -> aacgtc
|
|
437: 437, // acgtcc -> acgtcc
|
|
438: 438, // acgtcg -> acgtcg
|
|
439: 439, // acgtct -> acgtct
|
|
440: 110, // acgtga -> aacgtg
|
|
441: 441, // acgtgc -> acgtgc
|
|
442: 442, // acgtgg -> acgtgg
|
|
443: 443, // acgtgt -> acgtgt
|
|
444: 111, // acgtta -> aacgtt
|
|
445: 445, // acgttc -> acgttc
|
|
446: 446, // acgttg -> acgttg
|
|
447: 447, // acgttt -> acgttt
|
|
448: 7, // actaaa -> aaaact
|
|
449: 71, // actaac -> aacact
|
|
450: 135, // actaag -> aagact
|
|
451: 199, // actaat -> aatact
|
|
452: 113, // actaca -> aactac
|
|
453: 327, // actacc -> accact
|
|
454: 391, // actacg -> acgact
|
|
455: 455, // actact -> actact
|
|
456: 114, // actaga -> aactag
|
|
457: 457, // actagc -> actagc
|
|
458: 458, // actagg -> actagg
|
|
459: 459, // actagt -> actagt
|
|
460: 115, // actata -> aactat
|
|
461: 461, // actatc -> actatc
|
|
462: 462, // actatg -> actatg
|
|
463: 463, // actatt -> actatt
|
|
464: 29, // actcaa -> aaactc
|
|
465: 285, // actcac -> acactc
|
|
466: 466, // actcag -> actcag
|
|
467: 467, // actcat -> actcat
|
|
468: 117, // actcca -> aactcc
|
|
469: 469, // actccc -> actccc
|
|
470: 470, // actccg -> actccg
|
|
471: 471, // actcct -> actcct
|
|
472: 118, // actcga -> aactcg
|
|
473: 473, // actcgc -> actcgc
|
|
474: 474, // actcgg -> actcgg
|
|
475: 475, // actcgt -> actcgt
|
|
476: 119, // actcta -> aactct
|
|
477: 477, // actctc -> actctc
|
|
478: 478, // actctg -> actctg
|
|
479: 479, // actctt -> actctt
|
|
480: 30, // actgaa -> aaactg
|
|
481: 286, // actgac -> acactg
|
|
482: 482, // actgag -> actgag
|
|
483: 483, // actgat -> actgat
|
|
484: 121, // actgca -> aactgc
|
|
485: 485, // actgcc -> actgcc
|
|
486: 486, // actgcg -> actgcg
|
|
487: 487, // actgct -> actgct
|
|
488: 122, // actgga -> aactgg
|
|
489: 489, // actggc -> actggc
|
|
490: 490, // actggg -> actggg
|
|
491: 491, // actggt -> actggt
|
|
492: 123, // actgta -> aactgt
|
|
493: 493, // actgtc -> actgtc
|
|
494: 494, // actgtg -> actgtg
|
|
495: 495, // actgtt -> actgtt
|
|
496: 31, // acttaa -> aaactt
|
|
497: 287, // acttac -> acactt
|
|
498: 498, // acttag -> acttag
|
|
499: 499, // acttat -> acttat
|
|
500: 125, // acttca -> aacttc
|
|
501: 501, // acttcc -> acttcc
|
|
502: 502, // acttcg -> acttcg
|
|
503: 503, // acttct -> acttct
|
|
504: 126, // acttga -> aacttg
|
|
505: 505, // acttgc -> acttgc
|
|
506: 506, // acttgg -> acttgg
|
|
507: 507, // acttgt -> acttgt
|
|
508: 127, // acttta -> aacttt
|
|
509: 509, // actttc -> actttc
|
|
510: 510, // actttg -> actttg
|
|
511: 511, // actttt -> actttt
|
|
512: 2, // agaaaa -> aaaaag
|
|
513: 18, // agaaac -> aaacag
|
|
514: 34, // agaaag -> aaagag
|
|
515: 50, // agaaat -> aaatag
|
|
516: 66, // agaaca -> aacaag
|
|
517: 82, // agaacc -> aaccag
|
|
518: 98, // agaacg -> aacgag
|
|
519: 114, // agaact -> aactag
|
|
520: 130, // agaaga -> aagaag
|
|
521: 146, // agaagc -> aagcag
|
|
522: 162, // agaagg -> aaggag
|
|
523: 178, // agaagt -> aagtag
|
|
524: 131, // agaata -> aagaat
|
|
525: 210, // agaatc -> aatcag
|
|
526: 226, // agaatg -> aatgag
|
|
527: 242, // agaatt -> aattag
|
|
528: 33, // agacaa -> aaagac
|
|
529: 274, // agacac -> acacag
|
|
530: 290, // agacag -> acagag
|
|
531: 306, // agacat -> acatag
|
|
532: 133, // agacca -> aagacc
|
|
533: 338, // agaccc -> acccag
|
|
534: 354, // agaccg -> accgag
|
|
535: 370, // agacct -> acctag
|
|
536: 134, // agacga -> aagacg
|
|
537: 402, // agacgc -> acgcag
|
|
538: 418, // agacgg -> acggag
|
|
539: 434, // agacgt -> acgtag
|
|
540: 135, // agacta -> aagact
|
|
541: 466, // agactc -> actcag
|
|
542: 482, // agactg -> actgag
|
|
543: 498, // agactt -> acttag
|
|
544: 34, // agagaa -> aaagag
|
|
545: 290, // agagac -> acagag
|
|
546: 546, // agagag -> agagag
|
|
547: 547, // agagat -> agagat
|
|
548: 137, // agagca -> aagagc
|
|
549: 549, // agagcc -> agagcc
|
|
550: 550, // agagcg -> agagcg
|
|
551: 551, // agagct -> agagct
|
|
552: 138, // agagga -> aagagg
|
|
553: 553, // agaggc -> agaggc
|
|
554: 554, // agaggg -> agaggg
|
|
555: 555, // agaggt -> agaggt
|
|
556: 139, // agagta -> aagagt
|
|
557: 557, // agagtc -> agagtc
|
|
558: 558, // agagtg -> agagtg
|
|
559: 559, // agagtt -> agagtt
|
|
560: 35, // agataa -> aaagat
|
|
561: 291, // agatac -> acagat
|
|
562: 547, // agatag -> agagat
|
|
563: 563, // agatat -> agatat
|
|
564: 141, // agatca -> aagatc
|
|
565: 565, // agatcc -> agatcc
|
|
566: 566, // agatcg -> agatcg
|
|
567: 567, // agatct -> agatct
|
|
568: 142, // agatga -> aagatg
|
|
569: 569, // agatgc -> agatgc
|
|
570: 570, // agatgg -> agatgg
|
|
571: 571, // agatgt -> agatgt
|
|
572: 143, // agatta -> aagatt
|
|
573: 573, // agattc -> agattc
|
|
574: 574, // agattg -> agattg
|
|
575: 575, // agattt -> agattt
|
|
576: 9, // agcaaa -> aaaagc
|
|
577: 73, // agcaac -> aacagc
|
|
578: 137, // agcaag -> aagagc
|
|
579: 201, // agcaat -> aatagc
|
|
580: 145, // agcaca -> aagcac
|
|
581: 329, // agcacc -> accagc
|
|
582: 393, // agcacg -> acgagc
|
|
583: 457, // agcact -> actagc
|
|
584: 146, // agcaga -> aagcag
|
|
585: 585, // agcagc -> agcagc
|
|
586: 586, // agcagg -> agcagg
|
|
587: 587, // agcagt -> agcagt
|
|
588: 147, // agcata -> aagcat
|
|
589: 589, // agcatc -> agcatc
|
|
590: 590, // agcatg -> agcatg
|
|
591: 591, // agcatt -> agcatt
|
|
592: 37, // agccaa -> aaagcc
|
|
593: 293, // agccac -> acagcc
|
|
594: 549, // agccag -> agagcc
|
|
595: 595, // agccat -> agccat
|
|
596: 149, // agccca -> aagccc
|
|
597: 597, // agcccc -> agcccc
|
|
598: 598, // agcccg -> agcccg
|
|
599: 599, // agccct -> agccct
|
|
600: 150, // agccga -> aagccg
|
|
601: 601, // agccgc -> agccgc
|
|
602: 602, // agccgg -> agccgg
|
|
603: 603, // agccgt -> agccgt
|
|
604: 151, // agccta -> aagcct
|
|
605: 605, // agcctc -> agcctc
|
|
606: 606, // agcctg -> agcctg
|
|
607: 607, // agcctt -> agcctt
|
|
608: 38, // agcgaa -> aaagcg
|
|
609: 294, // agcgac -> acagcg
|
|
610: 550, // agcgag -> agagcg
|
|
611: 611, // agcgat -> agcgat
|
|
612: 153, // agcgca -> aagcgc
|
|
613: 613, // agcgcc -> agcgcc
|
|
614: 614, // agcgcg -> agcgcg
|
|
615: 615, // agcgct -> agcgct
|
|
616: 154, // agcgga -> aagcgg
|
|
617: 617, // agcggc -> agcggc
|
|
618: 618, // agcggg -> agcggg
|
|
619: 619, // agcggt -> agcggt
|
|
620: 155, // agcgta -> aagcgt
|
|
621: 621, // agcgtc -> agcgtc
|
|
622: 622, // agcgtg -> agcgtg
|
|
623: 623, // agcgtt -> agcgtt
|
|
624: 39, // agctaa -> aaagct
|
|
625: 295, // agctac -> acagct
|
|
626: 551, // agctag -> agagct
|
|
627: 627, // agctat -> agctat
|
|
628: 157, // agctca -> aagctc
|
|
629: 629, // agctcc -> agctcc
|
|
630: 630, // agctcg -> agctcg
|
|
631: 631, // agctct -> agctct
|
|
632: 158, // agctga -> aagctg
|
|
633: 633, // agctgc -> agctgc
|
|
634: 634, // agctgg -> agctgg
|
|
635: 635, // agctgt -> agctgt
|
|
636: 159, // agctta -> aagctt
|
|
637: 637, // agcttc -> agcttc
|
|
638: 638, // agcttg -> agcttg
|
|
639: 639, // agcttt -> agcttt
|
|
640: 10, // aggaaa -> aaaagg
|
|
641: 74, // aggaac -> aacagg
|
|
642: 138, // aggaag -> aagagg
|
|
643: 202, // aggaat -> aatagg
|
|
644: 161, // aggaca -> aaggac
|
|
645: 330, // aggacc -> accagg
|
|
646: 394, // aggacg -> acgagg
|
|
647: 458, // aggact -> actagg
|
|
648: 162, // aggaga -> aaggag
|
|
649: 586, // aggagc -> agcagg
|
|
650: 650, // aggagg -> aggagg
|
|
651: 651, // aggagt -> aggagt
|
|
652: 163, // aggata -> aaggat
|
|
653: 653, // aggatc -> aggatc
|
|
654: 654, // aggatg -> aggatg
|
|
655: 655, // aggatt -> aggatt
|
|
656: 41, // aggcaa -> aaaggc
|
|
657: 297, // aggcac -> acaggc
|
|
658: 553, // aggcag -> agaggc
|
|
659: 659, // aggcat -> aggcat
|
|
660: 165, // aggcca -> aaggcc
|
|
661: 661, // aggccc -> aggccc
|
|
662: 662, // aggccg -> aggccg
|
|
663: 663, // aggcct -> aggcct
|
|
664: 166, // aggcga -> aaggcg
|
|
665: 665, // aggcgc -> aggcgc
|
|
666: 666, // aggcgg -> aggcgg
|
|
667: 667, // aggcgt -> aggcgt
|
|
668: 167, // aggcta -> aaggct
|
|
669: 669, // aggctc -> aggctc
|
|
670: 670, // aggctg -> aggctg
|
|
671: 671, // aggctt -> aggctt
|
|
672: 42, // agggaa -> aaaggg
|
|
673: 298, // agggac -> acaggg
|
|
674: 554, // agggag -> agaggg
|
|
675: 675, // agggat -> agggat
|
|
676: 169, // agggca -> aagggc
|
|
677: 677, // agggcc -> agggcc
|
|
678: 678, // agggcg -> agggcg
|
|
679: 679, // agggct -> agggct
|
|
680: 170, // agggga -> aagggg
|
|
681: 681, // aggggc -> aggggc
|
|
682: 682, // aggggg -> aggggg
|
|
683: 683, // aggggt -> aggggt
|
|
684: 171, // agggta -> aagggt
|
|
685: 685, // agggtc -> agggtc
|
|
686: 686, // agggtg -> agggtg
|
|
687: 687, // agggtt -> agggtt
|
|
688: 43, // aggtaa -> aaaggt
|
|
689: 299, // aggtac -> acaggt
|
|
690: 555, // aggtag -> agaggt
|
|
691: 691, // aggtat -> aggtat
|
|
692: 173, // aggtca -> aaggtc
|
|
693: 693, // aggtcc -> aggtcc
|
|
694: 694, // aggtcg -> aggtcg
|
|
695: 695, // aggtct -> aggtct
|
|
696: 174, // aggtga -> aaggtg
|
|
697: 697, // aggtgc -> aggtgc
|
|
698: 698, // aggtgg -> aggtgg
|
|
699: 699, // aggtgt -> aggtgt
|
|
700: 175, // aggtta -> aaggtt
|
|
701: 701, // aggttc -> aggttc
|
|
702: 702, // aggttg -> aggttg
|
|
703: 703, // aggttt -> aggttt
|
|
704: 11, // agtaaa -> aaaagt
|
|
705: 75, // agtaac -> aacagt
|
|
706: 139, // agtaag -> aagagt
|
|
707: 203, // agtaat -> aatagt
|
|
708: 177, // agtaca -> aagtac
|
|
709: 331, // agtacc -> accagt
|
|
710: 395, // agtacg -> acgagt
|
|
711: 459, // agtact -> actagt
|
|
712: 178, // agtaga -> aagtag
|
|
713: 587, // agtagc -> agcagt
|
|
714: 651, // agtagg -> aggagt
|
|
715: 715, // agtagt -> agtagt
|
|
716: 179, // agtata -> aagtat
|
|
717: 717, // agtatc -> agtatc
|
|
718: 718, // agtatg -> agtatg
|
|
719: 719, // agtatt -> agtatt
|
|
720: 45, // agtcaa -> aaagtc
|
|
721: 301, // agtcac -> acagtc
|
|
722: 557, // agtcag -> agagtc
|
|
723: 723, // agtcat -> agtcat
|
|
724: 181, // agtcca -> aagtcc
|
|
725: 725, // agtccc -> agtccc
|
|
726: 726, // agtccg -> agtccg
|
|
727: 727, // agtcct -> agtcct
|
|
728: 182, // agtcga -> aagtcg
|
|
729: 729, // agtcgc -> agtcgc
|
|
730: 730, // agtcgg -> agtcgg
|
|
731: 731, // agtcgt -> agtcgt
|
|
732: 183, // agtcta -> aagtct
|
|
733: 733, // agtctc -> agtctc
|
|
734: 734, // agtctg -> agtctg
|
|
735: 735, // agtctt -> agtctt
|
|
736: 46, // agtgaa -> aaagtg
|
|
737: 302, // agtgac -> acagtg
|
|
738: 558, // agtgag -> agagtg
|
|
739: 739, // agtgat -> agtgat
|
|
740: 185, // agtgca -> aagtgc
|
|
741: 741, // agtgcc -> agtgcc
|
|
742: 742, // agtgcg -> agtgcg
|
|
743: 743, // agtgct -> agtgct
|
|
744: 186, // agtgga -> aagtgg
|
|
745: 745, // agtggc -> agtggc
|
|
746: 746, // agtggg -> agtggg
|
|
747: 747, // agtggt -> agtggt
|
|
748: 187, // agtgta -> aagtgt
|
|
749: 749, // agtgtc -> agtgtc
|
|
750: 750, // agtgtg -> agtgtg
|
|
751: 751, // agtgtt -> agtgtt
|
|
752: 47, // agttaa -> aaagtt
|
|
753: 303, // agttac -> acagtt
|
|
754: 559, // agttag -> agagtt
|
|
755: 755, // agttat -> agttat
|
|
756: 189, // agttca -> aagttc
|
|
757: 757, // agttcc -> agttcc
|
|
758: 758, // agttcg -> agttcg
|
|
759: 759, // agttct -> agttct
|
|
760: 190, // agttga -> aagttg
|
|
761: 761, // agttgc -> agttgc
|
|
762: 762, // agttgg -> agttgg
|
|
763: 763, // agttgt -> agttgt
|
|
764: 191, // agttta -> aagttt
|
|
765: 765, // agtttc -> agtttc
|
|
766: 766, // agtttg -> agtttg
|
|
767: 767, // agtttt -> agtttt
|
|
768: 3, // ataaaa -> aaaaat
|
|
769: 19, // ataaac -> aaacat
|
|
770: 35, // ataaag -> aaagat
|
|
771: 51, // ataaat -> aaatat
|
|
772: 67, // ataaca -> aacaat
|
|
773: 83, // ataacc -> aaccat
|
|
774: 99, // ataacg -> aacgat
|
|
775: 115, // ataact -> aactat
|
|
776: 131, // ataaga -> aagaat
|
|
777: 147, // ataagc -> aagcat
|
|
778: 163, // ataagg -> aaggat
|
|
779: 179, // ataagt -> aagtat
|
|
780: 195, // ataata -> aataat
|
|
781: 211, // ataatc -> aatcat
|
|
782: 227, // ataatg -> aatgat
|
|
783: 243, // ataatt -> aattat
|
|
784: 49, // atacaa -> aaatac
|
|
785: 275, // atacac -> acacat
|
|
786: 291, // atacag -> acagat
|
|
787: 307, // atacat -> acatat
|
|
788: 197, // atacca -> aatacc
|
|
789: 339, // ataccc -> acccat
|
|
790: 355, // ataccg -> accgat
|
|
791: 371, // atacct -> acctat
|
|
792: 198, // atacga -> aatacg
|
|
793: 403, // atacgc -> acgcat
|
|
794: 419, // atacgg -> acggat
|
|
795: 435, // atacgt -> acgtat
|
|
796: 199, // atacta -> aatact
|
|
797: 467, // atactc -> actcat
|
|
798: 483, // atactg -> actgat
|
|
799: 499, // atactt -> acttat
|
|
800: 50, // atagaa -> aaatag
|
|
801: 306, // atagac -> acatag
|
|
802: 547, // atagag -> agagat
|
|
803: 563, // atagat -> agatat
|
|
804: 201, // atagca -> aatagc
|
|
805: 595, // atagcc -> agccat
|
|
806: 611, // atagcg -> agcgat
|
|
807: 627, // atagct -> agctat
|
|
808: 202, // atagga -> aatagg
|
|
809: 659, // ataggc -> aggcat
|
|
810: 675, // ataggg -> agggat
|
|
811: 691, // ataggt -> aggtat
|
|
812: 203, // atagta -> aatagt
|
|
813: 723, // atagtc -> agtcat
|
|
814: 739, // atagtg -> agtgat
|
|
815: 755, // atagtt -> agttat
|
|
816: 51, // atataa -> aaatat
|
|
817: 307, // atatac -> acatat
|
|
818: 563, // atatag -> agatat
|
|
819: 819, // atatat -> atatat
|
|
820: 205, // atatca -> aatatc
|
|
821: 821, // atatcc -> atatcc
|
|
822: 822, // atatcg -> atatcg
|
|
823: 823, // atatct -> atatct
|
|
824: 206, // atatga -> aatatg
|
|
825: 825, // atatgc -> atatgc
|
|
826: 826, // atatgg -> atatgg
|
|
827: 827, // atatgt -> atatgt
|
|
828: 207, // atatta -> aatatt
|
|
829: 829, // atattc -> atattc
|
|
830: 830, // atattg -> atattg
|
|
831: 831, // atattt -> atattt
|
|
832: 13, // atcaaa -> aaaatc
|
|
833: 77, // atcaac -> aacatc
|
|
834: 141, // atcaag -> aagatc
|
|
835: 205, // atcaat -> aatatc
|
|
836: 209, // atcaca -> aatcac
|
|
837: 333, // atcacc -> accatc
|
|
838: 397, // atcacg -> acgatc
|
|
839: 461, // atcact -> actatc
|
|
840: 210, // atcaga -> aatcag
|
|
841: 589, // atcagc -> agcatc
|
|
842: 653, // atcagg -> aggatc
|
|
843: 717, // atcagt -> agtatc
|
|
844: 211, // atcata -> aatcat
|
|
845: 845, // atcatc -> atcatc
|
|
846: 846, // atcatg -> atcatg
|
|
847: 847, // atcatt -> atcatt
|
|
848: 53, // atccaa -> aaatcc
|
|
849: 309, // atccac -> acatcc
|
|
850: 565, // atccag -> agatcc
|
|
851: 821, // atccat -> atatcc
|
|
852: 213, // atccca -> aatccc
|
|
853: 853, // atcccc -> atcccc
|
|
854: 854, // atcccg -> atcccg
|
|
855: 855, // atccct -> atccct
|
|
856: 214, // atccga -> aatccg
|
|
857: 857, // atccgc -> atccgc
|
|
858: 858, // atccgg -> atccgg
|
|
859: 859, // atccgt -> atccgt
|
|
860: 215, // atccta -> aatcct
|
|
861: 861, // atcctc -> atcctc
|
|
862: 862, // atcctg -> atcctg
|
|
863: 863, // atcctt -> atcctt
|
|
864: 54, // atcgaa -> aaatcg
|
|
865: 310, // atcgac -> acatcg
|
|
866: 566, // atcgag -> agatcg
|
|
867: 822, // atcgat -> atatcg
|
|
868: 217, // atcgca -> aatcgc
|
|
869: 869, // atcgcc -> atcgcc
|
|
870: 870, // atcgcg -> atcgcg
|
|
871: 871, // atcgct -> atcgct
|
|
872: 218, // atcgga -> aatcgg
|
|
873: 873, // atcggc -> atcggc
|
|
874: 874, // atcggg -> atcggg
|
|
875: 875, // atcggt -> atcggt
|
|
876: 219, // atcgta -> aatcgt
|
|
877: 877, // atcgtc -> atcgtc
|
|
878: 878, // atcgtg -> atcgtg
|
|
879: 879, // atcgtt -> atcgtt
|
|
880: 55, // atctaa -> aaatct
|
|
881: 311, // atctac -> acatct
|
|
882: 567, // atctag -> agatct
|
|
883: 823, // atctat -> atatct
|
|
884: 221, // atctca -> aatctc
|
|
885: 885, // atctcc -> atctcc
|
|
886: 886, // atctcg -> atctcg
|
|
887: 887, // atctct -> atctct
|
|
888: 222, // atctga -> aatctg
|
|
889: 889, // atctgc -> atctgc
|
|
890: 890, // atctgg -> atctgg
|
|
891: 891, // atctgt -> atctgt
|
|
892: 223, // atctta -> aatctt
|
|
893: 893, // atcttc -> atcttc
|
|
894: 894, // atcttg -> atcttg
|
|
895: 895, // atcttt -> atcttt
|
|
896: 14, // atgaaa -> aaaatg
|
|
897: 78, // atgaac -> aacatg
|
|
898: 142, // atgaag -> aagatg
|
|
899: 206, // atgaat -> aatatg
|
|
900: 225, // atgaca -> aatgac
|
|
901: 334, // atgacc -> accatg
|
|
902: 398, // atgacg -> acgatg
|
|
903: 462, // atgact -> actatg
|
|
904: 226, // atgaga -> aatgag
|
|
905: 590, // atgagc -> agcatg
|
|
906: 654, // atgagg -> aggatg
|
|
907: 718, // atgagt -> agtatg
|
|
908: 227, // atgata -> aatgat
|
|
909: 846, // atgatc -> atcatg
|
|
910: 910, // atgatg -> atgatg
|
|
911: 911, // atgatt -> atgatt
|
|
912: 57, // atgcaa -> aaatgc
|
|
913: 313, // atgcac -> acatgc
|
|
914: 569, // atgcag -> agatgc
|
|
915: 825, // atgcat -> atatgc
|
|
916: 229, // atgcca -> aatgcc
|
|
917: 917, // atgccc -> atgccc
|
|
918: 918, // atgccg -> atgccg
|
|
919: 919, // atgcct -> atgcct
|
|
920: 230, // atgcga -> aatgcg
|
|
921: 921, // atgcgc -> atgcgc
|
|
922: 922, // atgcgg -> atgcgg
|
|
923: 923, // atgcgt -> atgcgt
|
|
924: 231, // atgcta -> aatgct
|
|
925: 925, // atgctc -> atgctc
|
|
926: 926, // atgctg -> atgctg
|
|
927: 927, // atgctt -> atgctt
|
|
928: 58, // atggaa -> aaatgg
|
|
929: 314, // atggac -> acatgg
|
|
930: 570, // atggag -> agatgg
|
|
931: 826, // atggat -> atatgg
|
|
932: 233, // atggca -> aatggc
|
|
933: 933, // atggcc -> atggcc
|
|
934: 934, // atggcg -> atggcg
|
|
935: 935, // atggct -> atggct
|
|
936: 234, // atggga -> aatggg
|
|
937: 937, // atgggc -> atgggc
|
|
938: 938, // atgggg -> atgggg
|
|
939: 939, // atgggt -> atgggt
|
|
940: 235, // atggta -> aatggt
|
|
941: 941, // atggtc -> atggtc
|
|
942: 942, // atggtg -> atggtg
|
|
943: 943, // atggtt -> atggtt
|
|
944: 59, // atgtaa -> aaatgt
|
|
945: 315, // atgtac -> acatgt
|
|
946: 571, // atgtag -> agatgt
|
|
947: 827, // atgtat -> atatgt
|
|
948: 237, // atgtca -> aatgtc
|
|
949: 949, // atgtcc -> atgtcc
|
|
950: 950, // atgtcg -> atgtcg
|
|
951: 951, // atgtct -> atgtct
|
|
952: 238, // atgtga -> aatgtg
|
|
953: 953, // atgtgc -> atgtgc
|
|
954: 954, // atgtgg -> atgtgg
|
|
955: 955, // atgtgt -> atgtgt
|
|
956: 239, // atgtta -> aatgtt
|
|
957: 957, // atgttc -> atgttc
|
|
958: 958, // atgttg -> atgttg
|
|
959: 959, // atgttt -> atgttt
|
|
960: 15, // attaaa -> aaaatt
|
|
961: 79, // attaac -> aacatt
|
|
962: 143, // attaag -> aagatt
|
|
963: 207, // attaat -> aatatt
|
|
964: 241, // attaca -> aattac
|
|
965: 335, // attacc -> accatt
|
|
966: 399, // attacg -> acgatt
|
|
967: 463, // attact -> actatt
|
|
968: 242, // attaga -> aattag
|
|
969: 591, // attagc -> agcatt
|
|
970: 655, // attagg -> aggatt
|
|
971: 719, // attagt -> agtatt
|
|
972: 243, // attata -> aattat
|
|
973: 847, // attatc -> atcatt
|
|
974: 911, // attatg -> atgatt
|
|
975: 975, // attatt -> attatt
|
|
976: 61, // attcaa -> aaattc
|
|
977: 317, // attcac -> acattc
|
|
978: 573, // attcag -> agattc
|
|
979: 829, // attcat -> atattc
|
|
980: 245, // attcca -> aattcc
|
|
981: 981, // attccc -> attccc
|
|
982: 982, // attccg -> attccg
|
|
983: 983, // attcct -> attcct
|
|
984: 246, // attcga -> aattcg
|
|
985: 985, // attcgc -> attcgc
|
|
986: 986, // attcgg -> attcgg
|
|
987: 987, // attcgt -> attcgt
|
|
988: 247, // attcta -> aattct
|
|
989: 989, // attctc -> attctc
|
|
990: 990, // attctg -> attctg
|
|
991: 991, // attctt -> attctt
|
|
992: 62, // attgaa -> aaattg
|
|
993: 318, // attgac -> acattg
|
|
994: 574, // attgag -> agattg
|
|
995: 830, // attgat -> atattg
|
|
996: 249, // attgca -> aattgc
|
|
997: 997, // attgcc -> attgcc
|
|
998: 998, // attgcg -> attgcg
|
|
999: 999, // attgct -> attgct
|
|
1000: 250, // attgga -> aattgg
|
|
1001: 1001, // attggc -> attggc
|
|
1002: 1002, // attggg -> attggg
|
|
1003: 1003, // attggt -> attggt
|
|
1004: 251, // attgta -> aattgt
|
|
1005: 1005, // attgtc -> attgtc
|
|
1006: 1006, // attgtg -> attgtg
|
|
1007: 1007, // attgtt -> attgtt
|
|
1008: 63, // atttaa -> aaattt
|
|
1009: 319, // atttac -> acattt
|
|
1010: 575, // atttag -> agattt
|
|
1011: 831, // atttat -> atattt
|
|
1012: 253, // atttca -> aatttc
|
|
1013: 1013, // atttcc -> atttcc
|
|
1014: 1014, // atttcg -> atttcg
|
|
1015: 1015, // atttct -> atttct
|
|
1016: 254, // atttga -> aatttg
|
|
1017: 1017, // atttgc -> atttgc
|
|
1018: 1018, // atttgg -> atttgg
|
|
1019: 1019, // atttgt -> atttgt
|
|
1020: 255, // atttta -> aatttt
|
|
1021: 1021, // attttc -> attttc
|
|
1022: 1022, // attttg -> attttg
|
|
1023: 1023, // attttt -> attttt
|
|
1024: 1, // caaaaa -> aaaaac
|
|
1025: 5, // caaaac -> aaaacc
|
|
1026: 9, // caaaag -> aaaagc
|
|
1027: 13, // caaaat -> aaaatc
|
|
1028: 17, // caaaca -> aaacac
|
|
1029: 21, // caaacc -> aaaccc
|
|
1030: 25, // caaacg -> aaacgc
|
|
1031: 29, // caaact -> aaactc
|
|
1032: 33, // caaaga -> aaagac
|
|
1033: 37, // caaagc -> aaagcc
|
|
1034: 41, // caaagg -> aaaggc
|
|
1035: 45, // caaagt -> aaagtc
|
|
1036: 49, // caaata -> aaatac
|
|
1037: 53, // caaatc -> aaatcc
|
|
1038: 57, // caaatg -> aaatgc
|
|
1039: 61, // caaatt -> aaattc
|
|
1040: 65, // caacaa -> aacaac
|
|
1041: 69, // caacac -> aacacc
|
|
1042: 73, // caacag -> aacagc
|
|
1043: 77, // caacat -> aacatc
|
|
1044: 81, // caacca -> aaccac
|
|
1045: 85, // caaccc -> aacccc
|
|
1046: 89, // caaccg -> aaccgc
|
|
1047: 93, // caacct -> aacctc
|
|
1048: 97, // caacga -> aacgac
|
|
1049: 101, // caacgc -> aacgcc
|
|
1050: 105, // caacgg -> aacggc
|
|
1051: 109, // caacgt -> aacgtc
|
|
1052: 113, // caacta -> aactac
|
|
1053: 117, // caactc -> aactcc
|
|
1054: 121, // caactg -> aactgc
|
|
1055: 125, // caactt -> aacttc
|
|
1056: 66, // caagaa -> aacaag
|
|
1057: 133, // caagac -> aagacc
|
|
1058: 137, // caagag -> aagagc
|
|
1059: 141, // caagat -> aagatc
|
|
1060: 145, // caagca -> aagcac
|
|
1061: 149, // caagcc -> aagccc
|
|
1062: 153, // caagcg -> aagcgc
|
|
1063: 157, // caagct -> aagctc
|
|
1064: 161, // caagga -> aaggac
|
|
1065: 165, // caaggc -> aaggcc
|
|
1066: 169, // caaggg -> aagggc
|
|
1067: 173, // caaggt -> aaggtc
|
|
1068: 177, // caagta -> aagtac
|
|
1069: 181, // caagtc -> aagtcc
|
|
1070: 185, // caagtg -> aagtgc
|
|
1071: 189, // caagtt -> aagttc
|
|
1072: 67, // caataa -> aacaat
|
|
1073: 197, // caatac -> aatacc
|
|
1074: 201, // caatag -> aatagc
|
|
1075: 205, // caatat -> aatatc
|
|
1076: 209, // caatca -> aatcac
|
|
1077: 213, // caatcc -> aatccc
|
|
1078: 217, // caatcg -> aatcgc
|
|
1079: 221, // caatct -> aatctc
|
|
1080: 225, // caatga -> aatgac
|
|
1081: 229, // caatgc -> aatgcc
|
|
1082: 233, // caatgg -> aatggc
|
|
1083: 237, // caatgt -> aatgtc
|
|
1084: 241, // caatta -> aattac
|
|
1085: 245, // caattc -> aattcc
|
|
1086: 249, // caattg -> aattgc
|
|
1087: 253, // caattt -> aatttc
|
|
1088: 17, // cacaaa -> aaacac
|
|
1089: 81, // cacaac -> aaccac
|
|
1090: 145, // cacaag -> aagcac
|
|
1091: 209, // cacaat -> aatcac
|
|
1092: 273, // cacaca -> acacac
|
|
1093: 277, // cacacc -> acaccc
|
|
1094: 281, // cacacg -> acacgc
|
|
1095: 285, // cacact -> acactc
|
|
1096: 274, // cacaga -> acacag
|
|
1097: 293, // cacagc -> acagcc
|
|
1098: 297, // cacagg -> acaggc
|
|
1099: 301, // cacagt -> acagtc
|
|
1100: 275, // cacata -> acacat
|
|
1101: 309, // cacatc -> acatcc
|
|
1102: 313, // cacatg -> acatgc
|
|
1103: 317, // cacatt -> acattc
|
|
1104: 69, // caccaa -> aacacc
|
|
1105: 325, // caccac -> accacc
|
|
1106: 329, // caccag -> accagc
|
|
1107: 333, // caccat -> accatc
|
|
1108: 277, // caccca -> acaccc
|
|
1109: 341, // cacccc -> accccc
|
|
1110: 345, // cacccg -> acccgc
|
|
1111: 349, // caccct -> accctc
|
|
1112: 278, // caccga -> acaccg
|
|
1113: 357, // caccgc -> accgcc
|
|
1114: 361, // caccgg -> accggc
|
|
1115: 365, // caccgt -> accgtc
|
|
1116: 279, // caccta -> acacct
|
|
1117: 373, // cacctc -> acctcc
|
|
1118: 377, // cacctg -> acctgc
|
|
1119: 381, // cacctt -> accttc
|
|
1120: 70, // cacgaa -> aacacg
|
|
1121: 326, // cacgac -> accacg
|
|
1122: 393, // cacgag -> acgagc
|
|
1123: 397, // cacgat -> acgatc
|
|
1124: 281, // cacgca -> acacgc
|
|
1125: 405, // cacgcc -> acgccc
|
|
1126: 409, // cacgcg -> acgcgc
|
|
1127: 413, // cacgct -> acgctc
|
|
1128: 282, // cacgga -> acacgg
|
|
1129: 421, // cacggc -> acggcc
|
|
1130: 425, // cacggg -> acgggc
|
|
1131: 429, // cacggt -> acggtc
|
|
1132: 283, // cacgta -> acacgt
|
|
1133: 437, // cacgtc -> acgtcc
|
|
1134: 441, // cacgtg -> acgtgc
|
|
1135: 445, // cacgtt -> acgttc
|
|
1136: 71, // cactaa -> aacact
|
|
1137: 327, // cactac -> accact
|
|
1138: 457, // cactag -> actagc
|
|
1139: 461, // cactat -> actatc
|
|
1140: 285, // cactca -> acactc
|
|
1141: 469, // cactcc -> actccc
|
|
1142: 473, // cactcg -> actcgc
|
|
1143: 477, // cactct -> actctc
|
|
1144: 286, // cactga -> acactg
|
|
1145: 485, // cactgc -> actgcc
|
|
1146: 489, // cactgg -> actggc
|
|
1147: 493, // cactgt -> actgtc
|
|
1148: 287, // cactta -> acactt
|
|
1149: 501, // cacttc -> acttcc
|
|
1150: 505, // cacttg -> acttgc
|
|
1151: 509, // cacttt -> actttc
|
|
1152: 18, // cagaaa -> aaacag
|
|
1153: 82, // cagaac -> aaccag
|
|
1154: 146, // cagaag -> aagcag
|
|
1155: 210, // cagaat -> aatcag
|
|
1156: 274, // cagaca -> acacag
|
|
1157: 338, // cagacc -> acccag
|
|
1158: 402, // cagacg -> acgcag
|
|
1159: 466, // cagact -> actcag
|
|
1160: 290, // cagaga -> acagag
|
|
1161: 549, // cagagc -> agagcc
|
|
1162: 553, // cagagg -> agaggc
|
|
1163: 557, // cagagt -> agagtc
|
|
1164: 291, // cagata -> acagat
|
|
1165: 565, // cagatc -> agatcc
|
|
1166: 569, // cagatg -> agatgc
|
|
1167: 573, // cagatt -> agattc
|
|
1168: 73, // cagcaa -> aacagc
|
|
1169: 329, // cagcac -> accagc
|
|
1170: 585, // cagcag -> agcagc
|
|
1171: 589, // cagcat -> agcatc
|
|
1172: 293, // cagcca -> acagcc
|
|
1173: 597, // cagccc -> agcccc
|
|
1174: 601, // cagccg -> agccgc
|
|
1175: 605, // cagcct -> agcctc
|
|
1176: 294, // cagcga -> acagcg
|
|
1177: 613, // cagcgc -> agcgcc
|
|
1178: 617, // cagcgg -> agcggc
|
|
1179: 621, // cagcgt -> agcgtc
|
|
1180: 295, // cagcta -> acagct
|
|
1181: 629, // cagctc -> agctcc
|
|
1182: 633, // cagctg -> agctgc
|
|
1183: 637, // cagctt -> agcttc
|
|
1184: 74, // caggaa -> aacagg
|
|
1185: 330, // caggac -> accagg
|
|
1186: 586, // caggag -> agcagg
|
|
1187: 653, // caggat -> aggatc
|
|
1188: 297, // caggca -> acaggc
|
|
1189: 661, // caggcc -> aggccc
|
|
1190: 665, // caggcg -> aggcgc
|
|
1191: 669, // caggct -> aggctc
|
|
1192: 298, // caggga -> acaggg
|
|
1193: 677, // cagggc -> agggcc
|
|
1194: 681, // cagggg -> aggggc
|
|
1195: 685, // cagggt -> agggtc
|
|
1196: 299, // caggta -> acaggt
|
|
1197: 693, // caggtc -> aggtcc
|
|
1198: 697, // caggtg -> aggtgc
|
|
1199: 701, // caggtt -> aggttc
|
|
1200: 75, // cagtaa -> aacagt
|
|
1201: 331, // cagtac -> accagt
|
|
1202: 587, // cagtag -> agcagt
|
|
1203: 717, // cagtat -> agtatc
|
|
1204: 301, // cagtca -> acagtc
|
|
1205: 725, // cagtcc -> agtccc
|
|
1206: 729, // cagtcg -> agtcgc
|
|
1207: 733, // cagtct -> agtctc
|
|
1208: 302, // cagtga -> acagtg
|
|
1209: 741, // cagtgc -> agtgcc
|
|
1210: 745, // cagtgg -> agtggc
|
|
1211: 749, // cagtgt -> agtgtc
|
|
1212: 303, // cagtta -> acagtt
|
|
1213: 757, // cagttc -> agttcc
|
|
1214: 761, // cagttg -> agttgc
|
|
1215: 765, // cagttt -> agtttc
|
|
1216: 19, // cataaa -> aaacat
|
|
1217: 83, // cataac -> aaccat
|
|
1218: 147, // cataag -> aagcat
|
|
1219: 211, // cataat -> aatcat
|
|
1220: 275, // cataca -> acacat
|
|
1221: 339, // catacc -> acccat
|
|
1222: 403, // catacg -> acgcat
|
|
1223: 467, // catact -> actcat
|
|
1224: 306, // cataga -> acatag
|
|
1225: 595, // catagc -> agccat
|
|
1226: 659, // catagg -> aggcat
|
|
1227: 723, // catagt -> agtcat
|
|
1228: 307, // catata -> acatat
|
|
1229: 821, // catatc -> atatcc
|
|
1230: 825, // catatg -> atatgc
|
|
1231: 829, // catatt -> atattc
|
|
1232: 77, // catcaa -> aacatc
|
|
1233: 333, // catcac -> accatc
|
|
1234: 589, // catcag -> agcatc
|
|
1235: 845, // catcat -> atcatc
|
|
1236: 309, // catcca -> acatcc
|
|
1237: 853, // catccc -> atcccc
|
|
1238: 857, // catccg -> atccgc
|
|
1239: 861, // catcct -> atcctc
|
|
1240: 310, // catcga -> acatcg
|
|
1241: 869, // catcgc -> atcgcc
|
|
1242: 873, // catcgg -> atcggc
|
|
1243: 877, // catcgt -> atcgtc
|
|
1244: 311, // catcta -> acatct
|
|
1245: 885, // catctc -> atctcc
|
|
1246: 889, // catctg -> atctgc
|
|
1247: 893, // catctt -> atcttc
|
|
1248: 78, // catgaa -> aacatg
|
|
1249: 334, // catgac -> accatg
|
|
1250: 590, // catgag -> agcatg
|
|
1251: 846, // catgat -> atcatg
|
|
1252: 313, // catgca -> acatgc
|
|
1253: 917, // catgcc -> atgccc
|
|
1254: 921, // catgcg -> atgcgc
|
|
1255: 925, // catgct -> atgctc
|
|
1256: 314, // catgga -> acatgg
|
|
1257: 933, // catggc -> atggcc
|
|
1258: 937, // catggg -> atgggc
|
|
1259: 941, // catggt -> atggtc
|
|
1260: 315, // catgta -> acatgt
|
|
1261: 949, // catgtc -> atgtcc
|
|
1262: 953, // catgtg -> atgtgc
|
|
1263: 957, // catgtt -> atgttc
|
|
1264: 79, // cattaa -> aacatt
|
|
1265: 335, // cattac -> accatt
|
|
1266: 591, // cattag -> agcatt
|
|
1267: 847, // cattat -> atcatt
|
|
1268: 317, // cattca -> acattc
|
|
1269: 981, // cattcc -> attccc
|
|
1270: 985, // cattcg -> attcgc
|
|
1271: 989, // cattct -> attctc
|
|
1272: 318, // cattga -> acattg
|
|
1273: 997, // cattgc -> attgcc
|
|
1274: 1001, // cattgg -> attggc
|
|
1275: 1005, // cattgt -> attgtc
|
|
1276: 319, // cattta -> acattt
|
|
1277: 1013, // catttc -> atttcc
|
|
1278: 1017, // catttg -> atttgc
|
|
1279: 1021, // catttt -> attttc
|
|
1280: 5, // ccaaaa -> aaaacc
|
|
1281: 21, // ccaaac -> aaaccc
|
|
1282: 37, // ccaaag -> aaagcc
|
|
1283: 53, // ccaaat -> aaatcc
|
|
1284: 69, // ccaaca -> aacacc
|
|
1285: 85, // ccaacc -> aacccc
|
|
1286: 101, // ccaacg -> aacgcc
|
|
1287: 117, // ccaact -> aactcc
|
|
1288: 133, // ccaaga -> aagacc
|
|
1289: 149, // ccaagc -> aagccc
|
|
1290: 165, // ccaagg -> aaggcc
|
|
1291: 181, // ccaagt -> aagtcc
|
|
1292: 197, // ccaata -> aatacc
|
|
1293: 213, // ccaatc -> aatccc
|
|
1294: 229, // ccaatg -> aatgcc
|
|
1295: 245, // ccaatt -> aattcc
|
|
1296: 81, // ccacaa -> aaccac
|
|
1297: 277, // ccacac -> acaccc
|
|
1298: 293, // ccacag -> acagcc
|
|
1299: 309, // ccacat -> acatcc
|
|
1300: 325, // ccacca -> accacc
|
|
1301: 341, // ccaccc -> accccc
|
|
1302: 357, // ccaccg -> accgcc
|
|
1303: 373, // ccacct -> acctcc
|
|
1304: 326, // ccacga -> accacg
|
|
1305: 405, // ccacgc -> acgccc
|
|
1306: 421, // ccacgg -> acggcc
|
|
1307: 437, // ccacgt -> acgtcc
|
|
1308: 327, // ccacta -> accact
|
|
1309: 469, // ccactc -> actccc
|
|
1310: 485, // ccactg -> actgcc
|
|
1311: 501, // ccactt -> acttcc
|
|
1312: 82, // ccagaa -> aaccag
|
|
1313: 338, // ccagac -> acccag
|
|
1314: 549, // ccagag -> agagcc
|
|
1315: 565, // ccagat -> agatcc
|
|
1316: 329, // ccagca -> accagc
|
|
1317: 597, // ccagcc -> agcccc
|
|
1318: 613, // ccagcg -> agcgcc
|
|
1319: 629, // ccagct -> agctcc
|
|
1320: 330, // ccagga -> accagg
|
|
1321: 661, // ccaggc -> aggccc
|
|
1322: 677, // ccaggg -> agggcc
|
|
1323: 693, // ccaggt -> aggtcc
|
|
1324: 331, // ccagta -> accagt
|
|
1325: 725, // ccagtc -> agtccc
|
|
1326: 741, // ccagtg -> agtgcc
|
|
1327: 757, // ccagtt -> agttcc
|
|
1328: 83, // ccataa -> aaccat
|
|
1329: 339, // ccatac -> acccat
|
|
1330: 595, // ccatag -> agccat
|
|
1331: 821, // ccatat -> atatcc
|
|
1332: 333, // ccatca -> accatc
|
|
1333: 853, // ccatcc -> atcccc
|
|
1334: 869, // ccatcg -> atcgcc
|
|
1335: 885, // ccatct -> atctcc
|
|
1336: 334, // ccatga -> accatg
|
|
1337: 917, // ccatgc -> atgccc
|
|
1338: 933, // ccatgg -> atggcc
|
|
1339: 949, // ccatgt -> atgtcc
|
|
1340: 335, // ccatta -> accatt
|
|
1341: 981, // ccattc -> attccc
|
|
1342: 997, // ccattg -> attgcc
|
|
1343: 1013, // ccattt -> atttcc
|
|
1344: 21, // cccaaa -> aaaccc
|
|
1345: 85, // cccaac -> aacccc
|
|
1346: 149, // cccaag -> aagccc
|
|
1347: 213, // cccaat -> aatccc
|
|
1348: 277, // cccaca -> acaccc
|
|
1349: 341, // cccacc -> accccc
|
|
1350: 405, // cccacg -> acgccc
|
|
1351: 469, // cccact -> actccc
|
|
1352: 338, // cccaga -> acccag
|
|
1353: 597, // cccagc -> agcccc
|
|
1354: 661, // cccagg -> aggccc
|
|
1355: 725, // cccagt -> agtccc
|
|
1356: 339, // cccata -> acccat
|
|
1357: 853, // cccatc -> atcccc
|
|
1358: 917, // cccatg -> atgccc
|
|
1359: 981, // cccatt -> attccc
|
|
1360: 85, // ccccaa -> aacccc
|
|
1361: 341, // ccccac -> accccc
|
|
1362: 597, // ccccag -> agcccc
|
|
1363: 853, // ccccat -> atcccc
|
|
1364: 341, // ccccca -> accccc
|
|
1365: 1365, // cccccc -> cccccc
|
|
1366: 1366, // cccccg -> cccccg
|
|
1367: 1367, // ccccct -> ccccct
|
|
1368: 342, // ccccga -> accccg
|
|
1369: 1366, // ccccgc -> cccccg
|
|
1370: 1370, // ccccgg -> ccccgg
|
|
1371: 1371, // ccccgt -> ccccgt
|
|
1372: 343, // ccccta -> acccct
|
|
1373: 1367, // cccctc -> ccccct
|
|
1374: 1374, // cccctg -> cccctg
|
|
1375: 1375, // cccctt -> cccctt
|
|
1376: 86, // cccgaa -> aacccg
|
|
1377: 342, // cccgac -> accccg
|
|
1378: 598, // cccgag -> agcccg
|
|
1379: 854, // cccgat -> atcccg
|
|
1380: 345, // cccgca -> acccgc
|
|
1381: 1366, // cccgcc -> cccccg
|
|
1382: 1382, // cccgcg -> cccgcg
|
|
1383: 1383, // cccgct -> cccgct
|
|
1384: 346, // cccgga -> acccgg
|
|
1385: 1370, // cccggc -> ccccgg
|
|
1386: 1386, // cccggg -> cccggg
|
|
1387: 1387, // cccggt -> cccggt
|
|
1388: 347, // cccgta -> acccgt
|
|
1389: 1371, // cccgtc -> ccccgt
|
|
1390: 1390, // cccgtg -> cccgtg
|
|
1391: 1391, // cccgtt -> cccgtt
|
|
1392: 87, // ccctaa -> aaccct
|
|
1393: 343, // ccctac -> acccct
|
|
1394: 599, // ccctag -> agccct
|
|
1395: 855, // ccctat -> atccct
|
|
1396: 349, // ccctca -> accctc
|
|
1397: 1367, // ccctcc -> ccccct
|
|
1398: 1398, // ccctcg -> ccctcg
|
|
1399: 1399, // ccctct -> ccctct
|
|
1400: 350, // ccctga -> accctg
|
|
1401: 1374, // ccctgc -> cccctg
|
|
1402: 1402, // ccctgg -> ccctgg
|
|
1403: 1403, // ccctgt -> ccctgt
|
|
1404: 351, // ccctta -> accctt
|
|
1405: 1375, // cccttc -> cccctt
|
|
1406: 1406, // cccttg -> cccttg
|
|
1407: 1407, // cccttt -> cccttt
|
|
1408: 22, // ccgaaa -> aaaccg
|
|
1409: 86, // ccgaac -> aacccg
|
|
1410: 150, // ccgaag -> aagccg
|
|
1411: 214, // ccgaat -> aatccg
|
|
1412: 278, // ccgaca -> acaccg
|
|
1413: 342, // ccgacc -> accccg
|
|
1414: 406, // ccgacg -> acgccg
|
|
1415: 470, // ccgact -> actccg
|
|
1416: 354, // ccgaga -> accgag
|
|
1417: 598, // ccgagc -> agcccg
|
|
1418: 662, // ccgagg -> aggccg
|
|
1419: 726, // ccgagt -> agtccg
|
|
1420: 355, // ccgata -> accgat
|
|
1421: 854, // ccgatc -> atcccg
|
|
1422: 918, // ccgatg -> atgccg
|
|
1423: 982, // ccgatt -> attccg
|
|
1424: 89, // ccgcaa -> aaccgc
|
|
1425: 345, // ccgcac -> acccgc
|
|
1426: 601, // ccgcag -> agccgc
|
|
1427: 857, // ccgcat -> atccgc
|
|
1428: 357, // ccgcca -> accgcc
|
|
1429: 1366, // ccgccc -> cccccg
|
|
1430: 1430, // ccgccg -> ccgccg
|
|
1431: 1431, // ccgcct -> ccgcct
|
|
1432: 358, // ccgcga -> accgcg
|
|
1433: 1382, // ccgcgc -> cccgcg
|
|
1434: 1434, // ccgcgg -> ccgcgg
|
|
1435: 1435, // ccgcgt -> ccgcgt
|
|
1436: 359, // ccgcta -> accgct
|
|
1437: 1383, // ccgctc -> cccgct
|
|
1438: 1438, // ccgctg -> ccgctg
|
|
1439: 1439, // ccgctt -> ccgctt
|
|
1440: 90, // ccggaa -> aaccgg
|
|
1441: 346, // ccggac -> acccgg
|
|
1442: 602, // ccggag -> agccgg
|
|
1443: 858, // ccggat -> atccgg
|
|
1444: 361, // ccggca -> accggc
|
|
1445: 1370, // ccggcc -> ccccgg
|
|
1446: 1446, // ccggcg -> ccggcg
|
|
1447: 1447, // ccggct -> ccggct
|
|
1448: 362, // ccggga -> accggg
|
|
1449: 1386, // ccgggc -> cccggg
|
|
1450: 1450, // ccgggg -> ccgggg
|
|
1451: 1451, // ccgggt -> ccgggt
|
|
1452: 363, // ccggta -> accggt
|
|
1453: 1387, // ccggtc -> cccggt
|
|
1454: 1454, // ccggtg -> ccggtg
|
|
1455: 1455, // ccggtt -> ccggtt
|
|
1456: 91, // ccgtaa -> aaccgt
|
|
1457: 347, // ccgtac -> acccgt
|
|
1458: 603, // ccgtag -> agccgt
|
|
1459: 859, // ccgtat -> atccgt
|
|
1460: 365, // ccgtca -> accgtc
|
|
1461: 1371, // ccgtcc -> ccccgt
|
|
1462: 1462, // ccgtcg -> ccgtcg
|
|
1463: 1463, // ccgtct -> ccgtct
|
|
1464: 366, // ccgtga -> accgtg
|
|
1465: 1390, // ccgtgc -> cccgtg
|
|
1466: 1466, // ccgtgg -> ccgtgg
|
|
1467: 1467, // ccgtgt -> ccgtgt
|
|
1468: 367, // ccgtta -> accgtt
|
|
1469: 1391, // ccgttc -> cccgtt
|
|
1470: 1470, // ccgttg -> ccgttg
|
|
1471: 1471, // ccgttt -> ccgttt
|
|
1472: 23, // cctaaa -> aaacct
|
|
1473: 87, // cctaac -> aaccct
|
|
1474: 151, // cctaag -> aagcct
|
|
1475: 215, // cctaat -> aatcct
|
|
1476: 279, // cctaca -> acacct
|
|
1477: 343, // cctacc -> acccct
|
|
1478: 407, // cctacg -> acgcct
|
|
1479: 471, // cctact -> actcct
|
|
1480: 370, // cctaga -> acctag
|
|
1481: 599, // cctagc -> agccct
|
|
1482: 663, // cctagg -> aggcct
|
|
1483: 727, // cctagt -> agtcct
|
|
1484: 371, // cctata -> acctat
|
|
1485: 855, // cctatc -> atccct
|
|
1486: 919, // cctatg -> atgcct
|
|
1487: 983, // cctatt -> attcct
|
|
1488: 93, // cctcaa -> aacctc
|
|
1489: 349, // cctcac -> accctc
|
|
1490: 605, // cctcag -> agcctc
|
|
1491: 861, // cctcat -> atcctc
|
|
1492: 373, // cctcca -> acctcc
|
|
1493: 1367, // cctccc -> ccccct
|
|
1494: 1431, // cctccg -> ccgcct
|
|
1495: 1495, // cctcct -> cctcct
|
|
1496: 374, // cctcga -> acctcg
|
|
1497: 1398, // cctcgc -> ccctcg
|
|
1498: 1498, // cctcgg -> cctcgg
|
|
1499: 1499, // cctcgt -> cctcgt
|
|
1500: 375, // cctcta -> acctct
|
|
1501: 1399, // cctctc -> ccctct
|
|
1502: 1502, // cctctg -> cctctg
|
|
1503: 1503, // cctctt -> cctctt
|
|
1504: 94, // cctgaa -> aacctg
|
|
1505: 350, // cctgac -> accctg
|
|
1506: 606, // cctgag -> agcctg
|
|
1507: 862, // cctgat -> atcctg
|
|
1508: 377, // cctgca -> acctgc
|
|
1509: 1374, // cctgcc -> cccctg
|
|
1510: 1510, // cctgcg -> cctgcg
|
|
1511: 1511, // cctgct -> cctgct
|
|
1512: 378, // cctgga -> acctgg
|
|
1513: 1402, // cctggc -> ccctgg
|
|
1514: 1514, // cctggg -> cctggg
|
|
1515: 1515, // cctggt -> cctggt
|
|
1516: 379, // cctgta -> acctgt
|
|
1517: 1403, // cctgtc -> ccctgt
|
|
1518: 1518, // cctgtg -> cctgtg
|
|
1519: 1519, // cctgtt -> cctgtt
|
|
1520: 95, // ccttaa -> aacctt
|
|
1521: 351, // ccttac -> accctt
|
|
1522: 607, // ccttag -> agcctt
|
|
1523: 863, // ccttat -> atcctt
|
|
1524: 381, // ccttca -> accttc
|
|
1525: 1375, // ccttcc -> cccctt
|
|
1526: 1526, // ccttcg -> ccttcg
|
|
1527: 1527, // ccttct -> ccttct
|
|
1528: 382, // ccttga -> accttg
|
|
1529: 1406, // ccttgc -> cccttg
|
|
1530: 1530, // ccttgg -> ccttgg
|
|
1531: 1531, // ccttgt -> ccttgt
|
|
1532: 383, // ccttta -> accttt
|
|
1533: 1407, // cctttc -> cccttt
|
|
1534: 1534, // cctttg -> cctttg
|
|
1535: 1535, // cctttt -> cctttt
|
|
1536: 6, // cgaaaa -> aaaacg
|
|
1537: 22, // cgaaac -> aaaccg
|
|
1538: 38, // cgaaag -> aaagcg
|
|
1539: 54, // cgaaat -> aaatcg
|
|
1540: 70, // cgaaca -> aacacg
|
|
1541: 86, // cgaacc -> aacccg
|
|
1542: 102, // cgaacg -> aacgcg
|
|
1543: 118, // cgaact -> aactcg
|
|
1544: 134, // cgaaga -> aagacg
|
|
1545: 150, // cgaagc -> aagccg
|
|
1546: 166, // cgaagg -> aaggcg
|
|
1547: 182, // cgaagt -> aagtcg
|
|
1548: 198, // cgaata -> aatacg
|
|
1549: 214, // cgaatc -> aatccg
|
|
1550: 230, // cgaatg -> aatgcg
|
|
1551: 246, // cgaatt -> aattcg
|
|
1552: 97, // cgacaa -> aacgac
|
|
1553: 278, // cgacac -> acaccg
|
|
1554: 294, // cgacag -> acagcg
|
|
1555: 310, // cgacat -> acatcg
|
|
1556: 326, // cgacca -> accacg
|
|
1557: 342, // cgaccc -> accccg
|
|
1558: 358, // cgaccg -> accgcg
|
|
1559: 374, // cgacct -> acctcg
|
|
1560: 390, // cgacga -> acgacg
|
|
1561: 406, // cgacgc -> acgccg
|
|
1562: 422, // cgacgg -> acggcg
|
|
1563: 438, // cgacgt -> acgtcg
|
|
1564: 391, // cgacta -> acgact
|
|
1565: 470, // cgactc -> actccg
|
|
1566: 486, // cgactg -> actgcg
|
|
1567: 502, // cgactt -> acttcg
|
|
1568: 98, // cgagaa -> aacgag
|
|
1569: 354, // cgagac -> accgag
|
|
1570: 550, // cgagag -> agagcg
|
|
1571: 566, // cgagat -> agatcg
|
|
1572: 393, // cgagca -> acgagc
|
|
1573: 598, // cgagcc -> agcccg
|
|
1574: 614, // cgagcg -> agcgcg
|
|
1575: 630, // cgagct -> agctcg
|
|
1576: 394, // cgagga -> acgagg
|
|
1577: 662, // cgaggc -> aggccg
|
|
1578: 678, // cgaggg -> agggcg
|
|
1579: 694, // cgaggt -> aggtcg
|
|
1580: 395, // cgagta -> acgagt
|
|
1581: 726, // cgagtc -> agtccg
|
|
1582: 742, // cgagtg -> agtgcg
|
|
1583: 758, // cgagtt -> agttcg
|
|
1584: 99, // cgataa -> aacgat
|
|
1585: 355, // cgatac -> accgat
|
|
1586: 611, // cgatag -> agcgat
|
|
1587: 822, // cgatat -> atatcg
|
|
1588: 397, // cgatca -> acgatc
|
|
1589: 854, // cgatcc -> atcccg
|
|
1590: 870, // cgatcg -> atcgcg
|
|
1591: 886, // cgatct -> atctcg
|
|
1592: 398, // cgatga -> acgatg
|
|
1593: 918, // cgatgc -> atgccg
|
|
1594: 934, // cgatgg -> atggcg
|
|
1595: 950, // cgatgt -> atgtcg
|
|
1596: 399, // cgatta -> acgatt
|
|
1597: 982, // cgattc -> attccg
|
|
1598: 998, // cgattg -> attgcg
|
|
1599: 1014, // cgattt -> atttcg
|
|
1600: 25, // cgcaaa -> aaacgc
|
|
1601: 89, // cgcaac -> aaccgc
|
|
1602: 153, // cgcaag -> aagcgc
|
|
1603: 217, // cgcaat -> aatcgc
|
|
1604: 281, // cgcaca -> acacgc
|
|
1605: 345, // cgcacc -> acccgc
|
|
1606: 409, // cgcacg -> acgcgc
|
|
1607: 473, // cgcact -> actcgc
|
|
1608: 402, // cgcaga -> acgcag
|
|
1609: 601, // cgcagc -> agccgc
|
|
1610: 665, // cgcagg -> aggcgc
|
|
1611: 729, // cgcagt -> agtcgc
|
|
1612: 403, // cgcata -> acgcat
|
|
1613: 857, // cgcatc -> atccgc
|
|
1614: 921, // cgcatg -> atgcgc
|
|
1615: 985, // cgcatt -> attcgc
|
|
1616: 101, // cgccaa -> aacgcc
|
|
1617: 357, // cgccac -> accgcc
|
|
1618: 613, // cgccag -> agcgcc
|
|
1619: 869, // cgccat -> atcgcc
|
|
1620: 405, // cgccca -> acgccc
|
|
1621: 1366, // cgcccc -> cccccg
|
|
1622: 1382, // cgcccg -> cccgcg
|
|
1623: 1398, // cgccct -> ccctcg
|
|
1624: 406, // cgccga -> acgccg
|
|
1625: 1430, // cgccgc -> ccgccg
|
|
1626: 1446, // cgccgg -> ccggcg
|
|
1627: 1462, // cgccgt -> ccgtcg
|
|
1628: 407, // cgccta -> acgcct
|
|
1629: 1431, // cgcctc -> ccgcct
|
|
1630: 1510, // cgcctg -> cctgcg
|
|
1631: 1526, // cgcctt -> ccttcg
|
|
1632: 102, // cgcgaa -> aacgcg
|
|
1633: 358, // cgcgac -> accgcg
|
|
1634: 614, // cgcgag -> agcgcg
|
|
1635: 870, // cgcgat -> atcgcg
|
|
1636: 409, // cgcgca -> acgcgc
|
|
1637: 1382, // cgcgcc -> cccgcg
|
|
1638: 1638, // cgcgcg -> cgcgcg
|
|
1639: 1639, // cgcgct -> cgcgct
|
|
1640: 410, // cgcgga -> acgcgg
|
|
1641: 1434, // cgcggc -> ccgcgg
|
|
1642: 1642, // cgcggg -> cgcggg
|
|
1643: 1643, // cgcggt -> cgcggt
|
|
1644: 411, // cgcgta -> acgcgt
|
|
1645: 1435, // cgcgtc -> ccgcgt
|
|
1646: 1646, // cgcgtg -> cgcgtg
|
|
1647: 1647, // cgcgtt -> cgcgtt
|
|
1648: 103, // cgctaa -> aacgct
|
|
1649: 359, // cgctac -> accgct
|
|
1650: 615, // cgctag -> agcgct
|
|
1651: 871, // cgctat -> atcgct
|
|
1652: 413, // cgctca -> acgctc
|
|
1653: 1383, // cgctcc -> cccgct
|
|
1654: 1639, // cgctcg -> cgcgct
|
|
1655: 1655, // cgctct -> cgctct
|
|
1656: 414, // cgctga -> acgctg
|
|
1657: 1438, // cgctgc -> ccgctg
|
|
1658: 1658, // cgctgg -> cgctgg
|
|
1659: 1659, // cgctgt -> cgctgt
|
|
1660: 415, // cgctta -> acgctt
|
|
1661: 1439, // cgcttc -> ccgctt
|
|
1662: 1662, // cgcttg -> cgcttg
|
|
1663: 1663, // cgcttt -> cgcttt
|
|
1664: 26, // cggaaa -> aaacgg
|
|
1665: 90, // cggaac -> aaccgg
|
|
1666: 154, // cggaag -> aagcgg
|
|
1667: 218, // cggaat -> aatcgg
|
|
1668: 282, // cggaca -> acacgg
|
|
1669: 346, // cggacc -> acccgg
|
|
1670: 410, // cggacg -> acgcgg
|
|
1671: 474, // cggact -> actcgg
|
|
1672: 418, // cggaga -> acggag
|
|
1673: 602, // cggagc -> agccgg
|
|
1674: 666, // cggagg -> aggcgg
|
|
1675: 730, // cggagt -> agtcgg
|
|
1676: 419, // cggata -> acggat
|
|
1677: 858, // cggatc -> atccgg
|
|
1678: 922, // cggatg -> atgcgg
|
|
1679: 986, // cggatt -> attcgg
|
|
1680: 105, // cggcaa -> aacggc
|
|
1681: 361, // cggcac -> accggc
|
|
1682: 617, // cggcag -> agcggc
|
|
1683: 873, // cggcat -> atcggc
|
|
1684: 421, // cggcca -> acggcc
|
|
1685: 1370, // cggccc -> ccccgg
|
|
1686: 1434, // cggccg -> ccgcgg
|
|
1687: 1498, // cggcct -> cctcgg
|
|
1688: 422, // cggcga -> acggcg
|
|
1689: 1446, // cggcgc -> ccggcg
|
|
1690: 1690, // cggcgg -> cggcgg
|
|
1691: 1691, // cggcgt -> cggcgt
|
|
1692: 423, // cggcta -> acggct
|
|
1693: 1447, // cggctc -> ccggct
|
|
1694: 1694, // cggctg -> cggctg
|
|
1695: 1695, // cggctt -> cggctt
|
|
1696: 106, // cgggaa -> aacggg
|
|
1697: 362, // cgggac -> accggg
|
|
1698: 618, // cgggag -> agcggg
|
|
1699: 874, // cgggat -> atcggg
|
|
1700: 425, // cgggca -> acgggc
|
|
1701: 1386, // cgggcc -> cccggg
|
|
1702: 1642, // cgggcg -> cgcggg
|
|
1703: 1703, // cgggct -> cgggct
|
|
1704: 426, // cgggga -> acgggg
|
|
1705: 1450, // cggggc -> ccgggg
|
|
1706: 1706, // cggggg -> cggggg
|
|
1707: 1707, // cggggt -> cggggt
|
|
1708: 427, // cgggta -> acgggt
|
|
1709: 1451, // cgggtc -> ccgggt
|
|
1710: 1710, // cgggtg -> cgggtg
|
|
1711: 1711, // cgggtt -> cgggtt
|
|
1712: 107, // cggtaa -> aacggt
|
|
1713: 363, // cggtac -> accggt
|
|
1714: 619, // cggtag -> agcggt
|
|
1715: 875, // cggtat -> atcggt
|
|
1716: 429, // cggtca -> acggtc
|
|
1717: 1387, // cggtcc -> cccggt
|
|
1718: 1643, // cggtcg -> cgcggt
|
|
1719: 1719, // cggtct -> cggtct
|
|
1720: 430, // cggtga -> acggtg
|
|
1721: 1454, // cggtgc -> ccggtg
|
|
1722: 1722, // cggtgg -> cggtgg
|
|
1723: 1723, // cggtgt -> cggtgt
|
|
1724: 431, // cggtta -> acggtt
|
|
1725: 1455, // cggttc -> ccggtt
|
|
1726: 1726, // cggttg -> cggttg
|
|
1727: 1727, // cggttt -> cggttt
|
|
1728: 27, // cgtaaa -> aaacgt
|
|
1729: 91, // cgtaac -> aaccgt
|
|
1730: 155, // cgtaag -> aagcgt
|
|
1731: 219, // cgtaat -> aatcgt
|
|
1732: 283, // cgtaca -> acacgt
|
|
1733: 347, // cgtacc -> acccgt
|
|
1734: 411, // cgtacg -> acgcgt
|
|
1735: 475, // cgtact -> actcgt
|
|
1736: 434, // cgtaga -> acgtag
|
|
1737: 603, // cgtagc -> agccgt
|
|
1738: 667, // cgtagg -> aggcgt
|
|
1739: 731, // cgtagt -> agtcgt
|
|
1740: 435, // cgtata -> acgtat
|
|
1741: 859, // cgtatc -> atccgt
|
|
1742: 923, // cgtatg -> atgcgt
|
|
1743: 987, // cgtatt -> attcgt
|
|
1744: 109, // cgtcaa -> aacgtc
|
|
1745: 365, // cgtcac -> accgtc
|
|
1746: 621, // cgtcag -> agcgtc
|
|
1747: 877, // cgtcat -> atcgtc
|
|
1748: 437, // cgtcca -> acgtcc
|
|
1749: 1371, // cgtccc -> ccccgt
|
|
1750: 1435, // cgtccg -> ccgcgt
|
|
1751: 1499, // cgtcct -> cctcgt
|
|
1752: 438, // cgtcga -> acgtcg
|
|
1753: 1462, // cgtcgc -> ccgtcg
|
|
1754: 1691, // cgtcgg -> cggcgt
|
|
1755: 1755, // cgtcgt -> cgtcgt
|
|
1756: 439, // cgtcta -> acgtct
|
|
1757: 1463, // cgtctc -> ccgtct
|
|
1758: 1758, // cgtctg -> cgtctg
|
|
1759: 1759, // cgtctt -> cgtctt
|
|
1760: 110, // cgtgaa -> aacgtg
|
|
1761: 366, // cgtgac -> accgtg
|
|
1762: 622, // cgtgag -> agcgtg
|
|
1763: 878, // cgtgat -> atcgtg
|
|
1764: 441, // cgtgca -> acgtgc
|
|
1765: 1390, // cgtgcc -> cccgtg
|
|
1766: 1646, // cgtgcg -> cgcgtg
|
|
1767: 1767, // cgtgct -> cgtgct
|
|
1768: 442, // cgtgga -> acgtgg
|
|
1769: 1466, // cgtggc -> ccgtgg
|
|
1770: 1770, // cgtggg -> cgtggg
|
|
1771: 1771, // cgtggt -> cgtggt
|
|
1772: 443, // cgtgta -> acgtgt
|
|
1773: 1467, // cgtgtc -> ccgtgt
|
|
1774: 1774, // cgtgtg -> cgtgtg
|
|
1775: 1775, // cgtgtt -> cgtgtt
|
|
1776: 111, // cgttaa -> aacgtt
|
|
1777: 367, // cgttac -> accgtt
|
|
1778: 623, // cgttag -> agcgtt
|
|
1779: 879, // cgttat -> atcgtt
|
|
1780: 445, // cgttca -> acgttc
|
|
1781: 1391, // cgttcc -> cccgtt
|
|
1782: 1647, // cgttcg -> cgcgtt
|
|
1783: 1783, // cgttct -> cgttct
|
|
1784: 446, // cgttga -> acgttg
|
|
1785: 1470, // cgttgc -> ccgttg
|
|
1786: 1786, // cgttgg -> cgttgg
|
|
1787: 1787, // cgttgt -> cgttgt
|
|
1788: 447, // cgttta -> acgttt
|
|
1789: 1471, // cgtttc -> ccgttt
|
|
1790: 1790, // cgtttg -> cgtttg
|
|
1791: 1791, // cgtttt -> cgtttt
|
|
1792: 7, // ctaaaa -> aaaact
|
|
1793: 23, // ctaaac -> aaacct
|
|
1794: 39, // ctaaag -> aaagct
|
|
1795: 55, // ctaaat -> aaatct
|
|
1796: 71, // ctaaca -> aacact
|
|
1797: 87, // ctaacc -> aaccct
|
|
1798: 103, // ctaacg -> aacgct
|
|
1799: 119, // ctaact -> aactct
|
|
1800: 135, // ctaaga -> aagact
|
|
1801: 151, // ctaagc -> aagcct
|
|
1802: 167, // ctaagg -> aaggct
|
|
1803: 183, // ctaagt -> aagtct
|
|
1804: 199, // ctaata -> aatact
|
|
1805: 215, // ctaatc -> aatcct
|
|
1806: 231, // ctaatg -> aatgct
|
|
1807: 247, // ctaatt -> aattct
|
|
1808: 113, // ctacaa -> aactac
|
|
1809: 279, // ctacac -> acacct
|
|
1810: 295, // ctacag -> acagct
|
|
1811: 311, // ctacat -> acatct
|
|
1812: 327, // ctacca -> accact
|
|
1813: 343, // ctaccc -> acccct
|
|
1814: 359, // ctaccg -> accgct
|
|
1815: 375, // ctacct -> acctct
|
|
1816: 391, // ctacga -> acgact
|
|
1817: 407, // ctacgc -> acgcct
|
|
1818: 423, // ctacgg -> acggct
|
|
1819: 439, // ctacgt -> acgtct
|
|
1820: 455, // ctacta -> actact
|
|
1821: 471, // ctactc -> actcct
|
|
1822: 487, // ctactg -> actgct
|
|
1823: 503, // ctactt -> acttct
|
|
1824: 114, // ctagaa -> aactag
|
|
1825: 370, // ctagac -> acctag
|
|
1826: 551, // ctagag -> agagct
|
|
1827: 567, // ctagat -> agatct
|
|
1828: 457, // ctagca -> actagc
|
|
1829: 599, // ctagcc -> agccct
|
|
1830: 615, // ctagcg -> agcgct
|
|
1831: 631, // ctagct -> agctct
|
|
1832: 458, // ctagga -> actagg
|
|
1833: 663, // ctaggc -> aggcct
|
|
1834: 679, // ctaggg -> agggct
|
|
1835: 695, // ctaggt -> aggtct
|
|
1836: 459, // ctagta -> actagt
|
|
1837: 727, // ctagtc -> agtcct
|
|
1838: 743, // ctagtg -> agtgct
|
|
1839: 759, // ctagtt -> agttct
|
|
1840: 115, // ctataa -> aactat
|
|
1841: 371, // ctatac -> acctat
|
|
1842: 627, // ctatag -> agctat
|
|
1843: 823, // ctatat -> atatct
|
|
1844: 461, // ctatca -> actatc
|
|
1845: 855, // ctatcc -> atccct
|
|
1846: 871, // ctatcg -> atcgct
|
|
1847: 887, // ctatct -> atctct
|
|
1848: 462, // ctatga -> actatg
|
|
1849: 919, // ctatgc -> atgcct
|
|
1850: 935, // ctatgg -> atggct
|
|
1851: 951, // ctatgt -> atgtct
|
|
1852: 463, // ctatta -> actatt
|
|
1853: 983, // ctattc -> attcct
|
|
1854: 999, // ctattg -> attgct
|
|
1855: 1015, // ctattt -> atttct
|
|
1856: 29, // ctcaaa -> aaactc
|
|
1857: 93, // ctcaac -> aacctc
|
|
1858: 157, // ctcaag -> aagctc
|
|
1859: 221, // ctcaat -> aatctc
|
|
1860: 285, // ctcaca -> acactc
|
|
1861: 349, // ctcacc -> accctc
|
|
1862: 413, // ctcacg -> acgctc
|
|
1863: 477, // ctcact -> actctc
|
|
1864: 466, // ctcaga -> actcag
|
|
1865: 605, // ctcagc -> agcctc
|
|
1866: 669, // ctcagg -> aggctc
|
|
1867: 733, // ctcagt -> agtctc
|
|
1868: 467, // ctcata -> actcat
|
|
1869: 861, // ctcatc -> atcctc
|
|
1870: 925, // ctcatg -> atgctc
|
|
1871: 989, // ctcatt -> attctc
|
|
1872: 117, // ctccaa -> aactcc
|
|
1873: 373, // ctccac -> acctcc
|
|
1874: 629, // ctccag -> agctcc
|
|
1875: 885, // ctccat -> atctcc
|
|
1876: 469, // ctccca -> actccc
|
|
1877: 1367, // ctcccc -> ccccct
|
|
1878: 1383, // ctcccg -> cccgct
|
|
1879: 1399, // ctccct -> ccctct
|
|
1880: 470, // ctccga -> actccg
|
|
1881: 1431, // ctccgc -> ccgcct
|
|
1882: 1447, // ctccgg -> ccggct
|
|
1883: 1463, // ctccgt -> ccgtct
|
|
1884: 471, // ctccta -> actcct
|
|
1885: 1495, // ctcctc -> cctcct
|
|
1886: 1511, // ctcctg -> cctgct
|
|
1887: 1527, // ctcctt -> ccttct
|
|
1888: 118, // ctcgaa -> aactcg
|
|
1889: 374, // ctcgac -> acctcg
|
|
1890: 630, // ctcgag -> agctcg
|
|
1891: 886, // ctcgat -> atctcg
|
|
1892: 473, // ctcgca -> actcgc
|
|
1893: 1398, // ctcgcc -> ccctcg
|
|
1894: 1639, // ctcgcg -> cgcgct
|
|
1895: 1655, // ctcgct -> cgctct
|
|
1896: 474, // ctcgga -> actcgg
|
|
1897: 1498, // ctcggc -> cctcgg
|
|
1898: 1703, // ctcggg -> cgggct
|
|
1899: 1719, // ctcggt -> cggtct
|
|
1900: 475, // ctcgta -> actcgt
|
|
1901: 1499, // ctcgtc -> cctcgt
|
|
1902: 1767, // ctcgtg -> cgtgct
|
|
1903: 1783, // ctcgtt -> cgttct
|
|
1904: 119, // ctctaa -> aactct
|
|
1905: 375, // ctctac -> acctct
|
|
1906: 631, // ctctag -> agctct
|
|
1907: 887, // ctctat -> atctct
|
|
1908: 477, // ctctca -> actctc
|
|
1909: 1399, // ctctcc -> ccctct
|
|
1910: 1655, // ctctcg -> cgctct
|
|
1911: 1911, // ctctct -> ctctct
|
|
1912: 478, // ctctga -> actctg
|
|
1913: 1502, // ctctgc -> cctctg
|
|
1914: 1914, // ctctgg -> ctctgg
|
|
1915: 1915, // ctctgt -> ctctgt
|
|
1916: 479, // ctctta -> actctt
|
|
1917: 1503, // ctcttc -> cctctt
|
|
1918: 1918, // ctcttg -> ctcttg
|
|
1919: 1919, // ctcttt -> ctcttt
|
|
1920: 30, // ctgaaa -> aaactg
|
|
1921: 94, // ctgaac -> aacctg
|
|
1922: 158, // ctgaag -> aagctg
|
|
1923: 222, // ctgaat -> aatctg
|
|
1924: 286, // ctgaca -> acactg
|
|
1925: 350, // ctgacc -> accctg
|
|
1926: 414, // ctgacg -> acgctg
|
|
1927: 478, // ctgact -> actctg
|
|
1928: 482, // ctgaga -> actgag
|
|
1929: 606, // ctgagc -> agcctg
|
|
1930: 670, // ctgagg -> aggctg
|
|
1931: 734, // ctgagt -> agtctg
|
|
1932: 483, // ctgata -> actgat
|
|
1933: 862, // ctgatc -> atcctg
|
|
1934: 926, // ctgatg -> atgctg
|
|
1935: 990, // ctgatt -> attctg
|
|
1936: 121, // ctgcaa -> aactgc
|
|
1937: 377, // ctgcac -> acctgc
|
|
1938: 633, // ctgcag -> agctgc
|
|
1939: 889, // ctgcat -> atctgc
|
|
1940: 485, // ctgcca -> actgcc
|
|
1941: 1374, // ctgccc -> cccctg
|
|
1942: 1438, // ctgccg -> ccgctg
|
|
1943: 1502, // ctgcct -> cctctg
|
|
1944: 486, // ctgcga -> actgcg
|
|
1945: 1510, // ctgcgc -> cctgcg
|
|
1946: 1694, // ctgcgg -> cggctg
|
|
1947: 1758, // ctgcgt -> cgtctg
|
|
1948: 487, // ctgcta -> actgct
|
|
1949: 1511, // ctgctc -> cctgct
|
|
1950: 1950, // ctgctg -> ctgctg
|
|
1951: 1951, // ctgctt -> ctgctt
|
|
1952: 122, // ctggaa -> aactgg
|
|
1953: 378, // ctggac -> acctgg
|
|
1954: 634, // ctggag -> agctgg
|
|
1955: 890, // ctggat -> atctgg
|
|
1956: 489, // ctggca -> actggc
|
|
1957: 1402, // ctggcc -> ccctgg
|
|
1958: 1658, // ctggcg -> cgctgg
|
|
1959: 1914, // ctggct -> ctctgg
|
|
1960: 490, // ctggga -> actggg
|
|
1961: 1514, // ctgggc -> cctggg
|
|
1962: 1962, // ctgggg -> ctgggg
|
|
1963: 1963, // ctgggt -> ctgggt
|
|
1964: 491, // ctggta -> actggt
|
|
1965: 1515, // ctggtc -> cctggt
|
|
1966: 1966, // ctggtg -> ctggtg
|
|
1967: 1967, // ctggtt -> ctggtt
|
|
1968: 123, // ctgtaa -> aactgt
|
|
1969: 379, // ctgtac -> acctgt
|
|
1970: 635, // ctgtag -> agctgt
|
|
1971: 891, // ctgtat -> atctgt
|
|
1972: 493, // ctgtca -> actgtc
|
|
1973: 1403, // ctgtcc -> ccctgt
|
|
1974: 1659, // ctgtcg -> cgctgt
|
|
1975: 1915, // ctgtct -> ctctgt
|
|
1976: 494, // ctgtga -> actgtg
|
|
1977: 1518, // ctgtgc -> cctgtg
|
|
1978: 1978, // ctgtgg -> ctgtgg
|
|
1979: 1979, // ctgtgt -> ctgtgt
|
|
1980: 495, // ctgtta -> actgtt
|
|
1981: 1519, // ctgttc -> cctgtt
|
|
1982: 1982, // ctgttg -> ctgttg
|
|
1983: 1983, // ctgttt -> ctgttt
|
|
1984: 31, // cttaaa -> aaactt
|
|
1985: 95, // cttaac -> aacctt
|
|
1986: 159, // cttaag -> aagctt
|
|
1987: 223, // cttaat -> aatctt
|
|
1988: 287, // cttaca -> acactt
|
|
1989: 351, // cttacc -> accctt
|
|
1990: 415, // cttacg -> acgctt
|
|
1991: 479, // cttact -> actctt
|
|
1992: 498, // cttaga -> acttag
|
|
1993: 607, // cttagc -> agcctt
|
|
1994: 671, // cttagg -> aggctt
|
|
1995: 735, // cttagt -> agtctt
|
|
1996: 499, // cttata -> acttat
|
|
1997: 863, // cttatc -> atcctt
|
|
1998: 927, // cttatg -> atgctt
|
|
1999: 991, // cttatt -> attctt
|
|
2000: 125, // cttcaa -> aacttc
|
|
2001: 381, // cttcac -> accttc
|
|
2002: 637, // cttcag -> agcttc
|
|
2003: 893, // cttcat -> atcttc
|
|
2004: 501, // cttcca -> acttcc
|
|
2005: 1375, // cttccc -> cccctt
|
|
2006: 1439, // cttccg -> ccgctt
|
|
2007: 1503, // cttcct -> cctctt
|
|
2008: 502, // cttcga -> acttcg
|
|
2009: 1526, // cttcgc -> ccttcg
|
|
2010: 1695, // cttcgg -> cggctt
|
|
2011: 1759, // cttcgt -> cgtctt
|
|
2012: 503, // cttcta -> acttct
|
|
2013: 1527, // cttctc -> ccttct
|
|
2014: 1951, // cttctg -> ctgctt
|
|
2015: 2015, // cttctt -> cttctt
|
|
2016: 126, // cttgaa -> aacttg
|
|
2017: 382, // cttgac -> accttg
|
|
2018: 638, // cttgag -> agcttg
|
|
2019: 894, // cttgat -> atcttg
|
|
2020: 505, // cttgca -> acttgc
|
|
2021: 1406, // cttgcc -> cccttg
|
|
2022: 1662, // cttgcg -> cgcttg
|
|
2023: 1918, // cttgct -> ctcttg
|
|
2024: 506, // cttgga -> acttgg
|
|
2025: 1530, // cttggc -> ccttgg
|
|
2026: 2026, // cttggg -> cttggg
|
|
2027: 2027, // cttggt -> cttggt
|
|
2028: 507, // cttgta -> acttgt
|
|
2029: 1531, // cttgtc -> ccttgt
|
|
2030: 2030, // cttgtg -> cttgtg
|
|
2031: 2031, // cttgtt -> cttgtt
|
|
2032: 127, // ctttaa -> aacttt
|
|
2033: 383, // ctttac -> accttt
|
|
2034: 639, // ctttag -> agcttt
|
|
2035: 895, // ctttat -> atcttt
|
|
2036: 509, // ctttca -> actttc
|
|
2037: 1407, // ctttcc -> cccttt
|
|
2038: 1663, // ctttcg -> cgcttt
|
|
2039: 1919, // ctttct -> ctcttt
|
|
2040: 510, // ctttga -> actttg
|
|
2041: 1534, // ctttgc -> cctttg
|
|
2042: 2042, // ctttgg -> ctttgg
|
|
2043: 2043, // ctttgt -> ctttgt
|
|
2044: 511, // ctttta -> actttt
|
|
2045: 1535, // cttttc -> cctttt
|
|
2046: 2046, // cttttg -> cttttg
|
|
2047: 2047, // cttttt -> cttttt
|
|
2048: 2, // gaaaaa -> aaaaag
|
|
2049: 6, // gaaaac -> aaaacg
|
|
2050: 10, // gaaaag -> aaaagg
|
|
2051: 14, // gaaaat -> aaaatg
|
|
2052: 18, // gaaaca -> aaacag
|
|
2053: 22, // gaaacc -> aaaccg
|
|
2054: 26, // gaaacg -> aaacgg
|
|
2055: 30, // gaaact -> aaactg
|
|
2056: 34, // gaaaga -> aaagag
|
|
2057: 38, // gaaagc -> aaagcg
|
|
2058: 42, // gaaagg -> aaaggg
|
|
2059: 46, // gaaagt -> aaagtg
|
|
2060: 50, // gaaata -> aaatag
|
|
2061: 54, // gaaatc -> aaatcg
|
|
2062: 58, // gaaatg -> aaatgg
|
|
2063: 62, // gaaatt -> aaattg
|
|
2064: 66, // gaacaa -> aacaag
|
|
2065: 70, // gaacac -> aacacg
|
|
2066: 74, // gaacag -> aacagg
|
|
2067: 78, // gaacat -> aacatg
|
|
2068: 82, // gaacca -> aaccag
|
|
2069: 86, // gaaccc -> aacccg
|
|
2070: 90, // gaaccg -> aaccgg
|
|
2071: 94, // gaacct -> aacctg
|
|
2072: 98, // gaacga -> aacgag
|
|
2073: 102, // gaacgc -> aacgcg
|
|
2074: 106, // gaacgg -> aacggg
|
|
2075: 110, // gaacgt -> aacgtg
|
|
2076: 114, // gaacta -> aactag
|
|
2077: 118, // gaactc -> aactcg
|
|
2078: 122, // gaactg -> aactgg
|
|
2079: 126, // gaactt -> aacttg
|
|
2080: 130, // gaagaa -> aagaag
|
|
2081: 134, // gaagac -> aagacg
|
|
2082: 138, // gaagag -> aagagg
|
|
2083: 142, // gaagat -> aagatg
|
|
2084: 146, // gaagca -> aagcag
|
|
2085: 150, // gaagcc -> aagccg
|
|
2086: 154, // gaagcg -> aagcgg
|
|
2087: 158, // gaagct -> aagctg
|
|
2088: 162, // gaagga -> aaggag
|
|
2089: 166, // gaaggc -> aaggcg
|
|
2090: 170, // gaaggg -> aagggg
|
|
2091: 174, // gaaggt -> aaggtg
|
|
2092: 178, // gaagta -> aagtag
|
|
2093: 182, // gaagtc -> aagtcg
|
|
2094: 186, // gaagtg -> aagtgg
|
|
2095: 190, // gaagtt -> aagttg
|
|
2096: 131, // gaataa -> aagaat
|
|
2097: 198, // gaatac -> aatacg
|
|
2098: 202, // gaatag -> aatagg
|
|
2099: 206, // gaatat -> aatatg
|
|
2100: 210, // gaatca -> aatcag
|
|
2101: 214, // gaatcc -> aatccg
|
|
2102: 218, // gaatcg -> aatcgg
|
|
2103: 222, // gaatct -> aatctg
|
|
2104: 226, // gaatga -> aatgag
|
|
2105: 230, // gaatgc -> aatgcg
|
|
2106: 234, // gaatgg -> aatggg
|
|
2107: 238, // gaatgt -> aatgtg
|
|
2108: 242, // gaatta -> aattag
|
|
2109: 246, // gaattc -> aattcg
|
|
2110: 250, // gaattg -> aattgg
|
|
2111: 254, // gaattt -> aatttg
|
|
2112: 33, // gacaaa -> aaagac
|
|
2113: 97, // gacaac -> aacgac
|
|
2114: 161, // gacaag -> aaggac
|
|
2115: 225, // gacaat -> aatgac
|
|
2116: 274, // gacaca -> acacag
|
|
2117: 278, // gacacc -> acaccg
|
|
2118: 282, // gacacg -> acacgg
|
|
2119: 286, // gacact -> acactg
|
|
2120: 290, // gacaga -> acagag
|
|
2121: 294, // gacagc -> acagcg
|
|
2122: 298, // gacagg -> acaggg
|
|
2123: 302, // gacagt -> acagtg
|
|
2124: 306, // gacata -> acatag
|
|
2125: 310, // gacatc -> acatcg
|
|
2126: 314, // gacatg -> acatgg
|
|
2127: 318, // gacatt -> acattg
|
|
2128: 133, // gaccaa -> aagacc
|
|
2129: 326, // gaccac -> accacg
|
|
2130: 330, // gaccag -> accagg
|
|
2131: 334, // gaccat -> accatg
|
|
2132: 338, // gaccca -> acccag
|
|
2133: 342, // gacccc -> accccg
|
|
2134: 346, // gacccg -> acccgg
|
|
2135: 350, // gaccct -> accctg
|
|
2136: 354, // gaccga -> accgag
|
|
2137: 358, // gaccgc -> accgcg
|
|
2138: 362, // gaccgg -> accggg
|
|
2139: 366, // gaccgt -> accgtg
|
|
2140: 370, // gaccta -> acctag
|
|
2141: 374, // gacctc -> acctcg
|
|
2142: 378, // gacctg -> acctgg
|
|
2143: 382, // gacctt -> accttg
|
|
2144: 134, // gacgaa -> aagacg
|
|
2145: 390, // gacgac -> acgacg
|
|
2146: 394, // gacgag -> acgagg
|
|
2147: 398, // gacgat -> acgatg
|
|
2148: 402, // gacgca -> acgcag
|
|
2149: 406, // gacgcc -> acgccg
|
|
2150: 410, // gacgcg -> acgcgg
|
|
2151: 414, // gacgct -> acgctg
|
|
2152: 418, // gacgga -> acggag
|
|
2153: 422, // gacggc -> acggcg
|
|
2154: 426, // gacggg -> acgggg
|
|
2155: 430, // gacggt -> acggtg
|
|
2156: 434, // gacgta -> acgtag
|
|
2157: 438, // gacgtc -> acgtcg
|
|
2158: 442, // gacgtg -> acgtgg
|
|
2159: 446, // gacgtt -> acgttg
|
|
2160: 135, // gactaa -> aagact
|
|
2161: 391, // gactac -> acgact
|
|
2162: 458, // gactag -> actagg
|
|
2163: 462, // gactat -> actatg
|
|
2164: 466, // gactca -> actcag
|
|
2165: 470, // gactcc -> actccg
|
|
2166: 474, // gactcg -> actcgg
|
|
2167: 478, // gactct -> actctg
|
|
2168: 482, // gactga -> actgag
|
|
2169: 486, // gactgc -> actgcg
|
|
2170: 490, // gactgg -> actggg
|
|
2171: 494, // gactgt -> actgtg
|
|
2172: 498, // gactta -> acttag
|
|
2173: 502, // gacttc -> acttcg
|
|
2174: 506, // gacttg -> acttgg
|
|
2175: 510, // gacttt -> actttg
|
|
2176: 34, // gagaaa -> aaagag
|
|
2177: 98, // gagaac -> aacgag
|
|
2178: 162, // gagaag -> aaggag
|
|
2179: 226, // gagaat -> aatgag
|
|
2180: 290, // gagaca -> acagag
|
|
2181: 354, // gagacc -> accgag
|
|
2182: 418, // gagacg -> acggag
|
|
2183: 482, // gagact -> actgag
|
|
2184: 546, // gagaga -> agagag
|
|
2185: 550, // gagagc -> agagcg
|
|
2186: 554, // gagagg -> agaggg
|
|
2187: 558, // gagagt -> agagtg
|
|
2188: 547, // gagata -> agagat
|
|
2189: 566, // gagatc -> agatcg
|
|
2190: 570, // gagatg -> agatgg
|
|
2191: 574, // gagatt -> agattg
|
|
2192: 137, // gagcaa -> aagagc
|
|
2193: 393, // gagcac -> acgagc
|
|
2194: 586, // gagcag -> agcagg
|
|
2195: 590, // gagcat -> agcatg
|
|
2196: 549, // gagcca -> agagcc
|
|
2197: 598, // gagccc -> agcccg
|
|
2198: 602, // gagccg -> agccgg
|
|
2199: 606, // gagcct -> agcctg
|
|
2200: 550, // gagcga -> agagcg
|
|
2201: 614, // gagcgc -> agcgcg
|
|
2202: 618, // gagcgg -> agcggg
|
|
2203: 622, // gagcgt -> agcgtg
|
|
2204: 551, // gagcta -> agagct
|
|
2205: 630, // gagctc -> agctcg
|
|
2206: 634, // gagctg -> agctgg
|
|
2207: 638, // gagctt -> agcttg
|
|
2208: 138, // gaggaa -> aagagg
|
|
2209: 394, // gaggac -> acgagg
|
|
2210: 650, // gaggag -> aggagg
|
|
2211: 654, // gaggat -> aggatg
|
|
2212: 553, // gaggca -> agaggc
|
|
2213: 662, // gaggcc -> aggccg
|
|
2214: 666, // gaggcg -> aggcgg
|
|
2215: 670, // gaggct -> aggctg
|
|
2216: 554, // gaggga -> agaggg
|
|
2217: 678, // gagggc -> agggcg
|
|
2218: 682, // gagggg -> aggggg
|
|
2219: 686, // gagggt -> agggtg
|
|
2220: 555, // gaggta -> agaggt
|
|
2221: 694, // gaggtc -> aggtcg
|
|
2222: 698, // gaggtg -> aggtgg
|
|
2223: 702, // gaggtt -> aggttg
|
|
2224: 139, // gagtaa -> aagagt
|
|
2225: 395, // gagtac -> acgagt
|
|
2226: 651, // gagtag -> aggagt
|
|
2227: 718, // gagtat -> agtatg
|
|
2228: 557, // gagtca -> agagtc
|
|
2229: 726, // gagtcc -> agtccg
|
|
2230: 730, // gagtcg -> agtcgg
|
|
2231: 734, // gagtct -> agtctg
|
|
2232: 558, // gagtga -> agagtg
|
|
2233: 742, // gagtgc -> agtgcg
|
|
2234: 746, // gagtgg -> agtggg
|
|
2235: 750, // gagtgt -> agtgtg
|
|
2236: 559, // gagtta -> agagtt
|
|
2237: 758, // gagttc -> agttcg
|
|
2238: 762, // gagttg -> agttgg
|
|
2239: 766, // gagttt -> agtttg
|
|
2240: 35, // gataaa -> aaagat
|
|
2241: 99, // gataac -> aacgat
|
|
2242: 163, // gataag -> aaggat
|
|
2243: 227, // gataat -> aatgat
|
|
2244: 291, // gataca -> acagat
|
|
2245: 355, // gatacc -> accgat
|
|
2246: 419, // gatacg -> acggat
|
|
2247: 483, // gatact -> actgat
|
|
2248: 547, // gataga -> agagat
|
|
2249: 611, // gatagc -> agcgat
|
|
2250: 675, // gatagg -> agggat
|
|
2251: 739, // gatagt -> agtgat
|
|
2252: 563, // gatata -> agatat
|
|
2253: 822, // gatatc -> atatcg
|
|
2254: 826, // gatatg -> atatgg
|
|
2255: 830, // gatatt -> atattg
|
|
2256: 141, // gatcaa -> aagatc
|
|
2257: 397, // gatcac -> acgatc
|
|
2258: 653, // gatcag -> aggatc
|
|
2259: 846, // gatcat -> atcatg
|
|
2260: 565, // gatcca -> agatcc
|
|
2261: 854, // gatccc -> atcccg
|
|
2262: 858, // gatccg -> atccgg
|
|
2263: 862, // gatcct -> atcctg
|
|
2264: 566, // gatcga -> agatcg
|
|
2265: 870, // gatcgc -> atcgcg
|
|
2266: 874, // gatcgg -> atcggg
|
|
2267: 878, // gatcgt -> atcgtg
|
|
2268: 567, // gatcta -> agatct
|
|
2269: 886, // gatctc -> atctcg
|
|
2270: 890, // gatctg -> atctgg
|
|
2271: 894, // gatctt -> atcttg
|
|
2272: 142, // gatgaa -> aagatg
|
|
2273: 398, // gatgac -> acgatg
|
|
2274: 654, // gatgag -> aggatg
|
|
2275: 910, // gatgat -> atgatg
|
|
2276: 569, // gatgca -> agatgc
|
|
2277: 918, // gatgcc -> atgccg
|
|
2278: 922, // gatgcg -> atgcgg
|
|
2279: 926, // gatgct -> atgctg
|
|
2280: 570, // gatgga -> agatgg
|
|
2281: 934, // gatggc -> atggcg
|
|
2282: 938, // gatggg -> atgggg
|
|
2283: 942, // gatggt -> atggtg
|
|
2284: 571, // gatgta -> agatgt
|
|
2285: 950, // gatgtc -> atgtcg
|
|
2286: 954, // gatgtg -> atgtgg
|
|
2287: 958, // gatgtt -> atgttg
|
|
2288: 143, // gattaa -> aagatt
|
|
2289: 399, // gattac -> acgatt
|
|
2290: 655, // gattag -> aggatt
|
|
2291: 911, // gattat -> atgatt
|
|
2292: 573, // gattca -> agattc
|
|
2293: 982, // gattcc -> attccg
|
|
2294: 986, // gattcg -> attcgg
|
|
2295: 990, // gattct -> attctg
|
|
2296: 574, // gattga -> agattg
|
|
2297: 998, // gattgc -> attgcg
|
|
2298: 1002, // gattgg -> attggg
|
|
2299: 1006, // gattgt -> attgtg
|
|
2300: 575, // gattta -> agattt
|
|
2301: 1014, // gatttc -> atttcg
|
|
2302: 1018, // gatttg -> atttgg
|
|
2303: 1022, // gatttt -> attttg
|
|
2304: 9, // gcaaaa -> aaaagc
|
|
2305: 25, // gcaaac -> aaacgc
|
|
2306: 41, // gcaaag -> aaaggc
|
|
2307: 57, // gcaaat -> aaatgc
|
|
2308: 73, // gcaaca -> aacagc
|
|
2309: 89, // gcaacc -> aaccgc
|
|
2310: 105, // gcaacg -> aacggc
|
|
2311: 121, // gcaact -> aactgc
|
|
2312: 137, // gcaaga -> aagagc
|
|
2313: 153, // gcaagc -> aagcgc
|
|
2314: 169, // gcaagg -> aagggc
|
|
2315: 185, // gcaagt -> aagtgc
|
|
2316: 201, // gcaata -> aatagc
|
|
2317: 217, // gcaatc -> aatcgc
|
|
2318: 233, // gcaatg -> aatggc
|
|
2319: 249, // gcaatt -> aattgc
|
|
2320: 145, // gcacaa -> aagcac
|
|
2321: 281, // gcacac -> acacgc
|
|
2322: 297, // gcacag -> acaggc
|
|
2323: 313, // gcacat -> acatgc
|
|
2324: 329, // gcacca -> accagc
|
|
2325: 345, // gcaccc -> acccgc
|
|
2326: 361, // gcaccg -> accggc
|
|
2327: 377, // gcacct -> acctgc
|
|
2328: 393, // gcacga -> acgagc
|
|
2329: 409, // gcacgc -> acgcgc
|
|
2330: 425, // gcacgg -> acgggc
|
|
2331: 441, // gcacgt -> acgtgc
|
|
2332: 457, // gcacta -> actagc
|
|
2333: 473, // gcactc -> actcgc
|
|
2334: 489, // gcactg -> actggc
|
|
2335: 505, // gcactt -> acttgc
|
|
2336: 146, // gcagaa -> aagcag
|
|
2337: 402, // gcagac -> acgcag
|
|
2338: 553, // gcagag -> agaggc
|
|
2339: 569, // gcagat -> agatgc
|
|
2340: 585, // gcagca -> agcagc
|
|
2341: 601, // gcagcc -> agccgc
|
|
2342: 617, // gcagcg -> agcggc
|
|
2343: 633, // gcagct -> agctgc
|
|
2344: 586, // gcagga -> agcagg
|
|
2345: 665, // gcaggc -> aggcgc
|
|
2346: 681, // gcaggg -> aggggc
|
|
2347: 697, // gcaggt -> aggtgc
|
|
2348: 587, // gcagta -> agcagt
|
|
2349: 729, // gcagtc -> agtcgc
|
|
2350: 745, // gcagtg -> agtggc
|
|
2351: 761, // gcagtt -> agttgc
|
|
2352: 147, // gcataa -> aagcat
|
|
2353: 403, // gcatac -> acgcat
|
|
2354: 659, // gcatag -> aggcat
|
|
2355: 825, // gcatat -> atatgc
|
|
2356: 589, // gcatca -> agcatc
|
|
2357: 857, // gcatcc -> atccgc
|
|
2358: 873, // gcatcg -> atcggc
|
|
2359: 889, // gcatct -> atctgc
|
|
2360: 590, // gcatga -> agcatg
|
|
2361: 921, // gcatgc -> atgcgc
|
|
2362: 937, // gcatgg -> atgggc
|
|
2363: 953, // gcatgt -> atgtgc
|
|
2364: 591, // gcatta -> agcatt
|
|
2365: 985, // gcattc -> attcgc
|
|
2366: 1001, // gcattg -> attggc
|
|
2367: 1017, // gcattt -> atttgc
|
|
2368: 37, // gccaaa -> aaagcc
|
|
2369: 101, // gccaac -> aacgcc
|
|
2370: 165, // gccaag -> aaggcc
|
|
2371: 229, // gccaat -> aatgcc
|
|
2372: 293, // gccaca -> acagcc
|
|
2373: 357, // gccacc -> accgcc
|
|
2374: 421, // gccacg -> acggcc
|
|
2375: 485, // gccact -> actgcc
|
|
2376: 549, // gccaga -> agagcc
|
|
2377: 613, // gccagc -> agcgcc
|
|
2378: 677, // gccagg -> agggcc
|
|
2379: 741, // gccagt -> agtgcc
|
|
2380: 595, // gccata -> agccat
|
|
2381: 869, // gccatc -> atcgcc
|
|
2382: 933, // gccatg -> atggcc
|
|
2383: 997, // gccatt -> attgcc
|
|
2384: 149, // gcccaa -> aagccc
|
|
2385: 405, // gcccac -> acgccc
|
|
2386: 661, // gcccag -> aggccc
|
|
2387: 917, // gcccat -> atgccc
|
|
2388: 597, // gcccca -> agcccc
|
|
2389: 1366, // gccccc -> cccccg
|
|
2390: 1370, // gccccg -> ccccgg
|
|
2391: 1374, // gcccct -> cccctg
|
|
2392: 598, // gcccga -> agcccg
|
|
2393: 1382, // gcccgc -> cccgcg
|
|
2394: 1386, // gcccgg -> cccggg
|
|
2395: 1390, // gcccgt -> cccgtg
|
|
2396: 599, // gcccta -> agccct
|
|
2397: 1398, // gccctc -> ccctcg
|
|
2398: 1402, // gccctg -> ccctgg
|
|
2399: 1406, // gccctt -> cccttg
|
|
2400: 150, // gccgaa -> aagccg
|
|
2401: 406, // gccgac -> acgccg
|
|
2402: 662, // gccgag -> aggccg
|
|
2403: 918, // gccgat -> atgccg
|
|
2404: 601, // gccgca -> agccgc
|
|
2405: 1430, // gccgcc -> ccgccg
|
|
2406: 1434, // gccgcg -> ccgcgg
|
|
2407: 1438, // gccgct -> ccgctg
|
|
2408: 602, // gccgga -> agccgg
|
|
2409: 1446, // gccggc -> ccggcg
|
|
2410: 1450, // gccggg -> ccgggg
|
|
2411: 1454, // gccggt -> ccggtg
|
|
2412: 603, // gccgta -> agccgt
|
|
2413: 1462, // gccgtc -> ccgtcg
|
|
2414: 1466, // gccgtg -> ccgtgg
|
|
2415: 1470, // gccgtt -> ccgttg
|
|
2416: 151, // gcctaa -> aagcct
|
|
2417: 407, // gcctac -> acgcct
|
|
2418: 663, // gcctag -> aggcct
|
|
2419: 919, // gcctat -> atgcct
|
|
2420: 605, // gcctca -> agcctc
|
|
2421: 1431, // gcctcc -> ccgcct
|
|
2422: 1498, // gcctcg -> cctcgg
|
|
2423: 1502, // gcctct -> cctctg
|
|
2424: 606, // gcctga -> agcctg
|
|
2425: 1510, // gcctgc -> cctgcg
|
|
2426: 1514, // gcctgg -> cctggg
|
|
2427: 1518, // gcctgt -> cctgtg
|
|
2428: 607, // gcctta -> agcctt
|
|
2429: 1526, // gccttc -> ccttcg
|
|
2430: 1530, // gccttg -> ccttgg
|
|
2431: 1534, // gccttt -> cctttg
|
|
2432: 38, // gcgaaa -> aaagcg
|
|
2433: 102, // gcgaac -> aacgcg
|
|
2434: 166, // gcgaag -> aaggcg
|
|
2435: 230, // gcgaat -> aatgcg
|
|
2436: 294, // gcgaca -> acagcg
|
|
2437: 358, // gcgacc -> accgcg
|
|
2438: 422, // gcgacg -> acggcg
|
|
2439: 486, // gcgact -> actgcg
|
|
2440: 550, // gcgaga -> agagcg
|
|
2441: 614, // gcgagc -> agcgcg
|
|
2442: 678, // gcgagg -> agggcg
|
|
2443: 742, // gcgagt -> agtgcg
|
|
2444: 611, // gcgata -> agcgat
|
|
2445: 870, // gcgatc -> atcgcg
|
|
2446: 934, // gcgatg -> atggcg
|
|
2447: 998, // gcgatt -> attgcg
|
|
2448: 153, // gcgcaa -> aagcgc
|
|
2449: 409, // gcgcac -> acgcgc
|
|
2450: 665, // gcgcag -> aggcgc
|
|
2451: 921, // gcgcat -> atgcgc
|
|
2452: 613, // gcgcca -> agcgcc
|
|
2453: 1382, // gcgccc -> cccgcg
|
|
2454: 1446, // gcgccg -> ccggcg
|
|
2455: 1510, // gcgcct -> cctgcg
|
|
2456: 614, // gcgcga -> agcgcg
|
|
2457: 1638, // gcgcgc -> cgcgcg
|
|
2458: 1642, // gcgcgg -> cgcggg
|
|
2459: 1646, // gcgcgt -> cgcgtg
|
|
2460: 615, // gcgcta -> agcgct
|
|
2461: 1639, // gcgctc -> cgcgct
|
|
2462: 1658, // gcgctg -> cgctgg
|
|
2463: 1662, // gcgctt -> cgcttg
|
|
2464: 154, // gcggaa -> aagcgg
|
|
2465: 410, // gcggac -> acgcgg
|
|
2466: 666, // gcggag -> aggcgg
|
|
2467: 922, // gcggat -> atgcgg
|
|
2468: 617, // gcggca -> agcggc
|
|
2469: 1434, // gcggcc -> ccgcgg
|
|
2470: 1690, // gcggcg -> cggcgg
|
|
2471: 1694, // gcggct -> cggctg
|
|
2472: 618, // gcggga -> agcggg
|
|
2473: 1642, // gcgggc -> cgcggg
|
|
2474: 1706, // gcgggg -> cggggg
|
|
2475: 1710, // gcgggt -> cgggtg
|
|
2476: 619, // gcggta -> agcggt
|
|
2477: 1643, // gcggtc -> cgcggt
|
|
2478: 1722, // gcggtg -> cggtgg
|
|
2479: 1726, // gcggtt -> cggttg
|
|
2480: 155, // gcgtaa -> aagcgt
|
|
2481: 411, // gcgtac -> acgcgt
|
|
2482: 667, // gcgtag -> aggcgt
|
|
2483: 923, // gcgtat -> atgcgt
|
|
2484: 621, // gcgtca -> agcgtc
|
|
2485: 1435, // gcgtcc -> ccgcgt
|
|
2486: 1691, // gcgtcg -> cggcgt
|
|
2487: 1758, // gcgtct -> cgtctg
|
|
2488: 622, // gcgtga -> agcgtg
|
|
2489: 1646, // gcgtgc -> cgcgtg
|
|
2490: 1770, // gcgtgg -> cgtggg
|
|
2491: 1774, // gcgtgt -> cgtgtg
|
|
2492: 623, // gcgtta -> agcgtt
|
|
2493: 1647, // gcgttc -> cgcgtt
|
|
2494: 1786, // gcgttg -> cgttgg
|
|
2495: 1790, // gcgttt -> cgtttg
|
|
2496: 39, // gctaaa -> aaagct
|
|
2497: 103, // gctaac -> aacgct
|
|
2498: 167, // gctaag -> aaggct
|
|
2499: 231, // gctaat -> aatgct
|
|
2500: 295, // gctaca -> acagct
|
|
2501: 359, // gctacc -> accgct
|
|
2502: 423, // gctacg -> acggct
|
|
2503: 487, // gctact -> actgct
|
|
2504: 551, // gctaga -> agagct
|
|
2505: 615, // gctagc -> agcgct
|
|
2506: 679, // gctagg -> agggct
|
|
2507: 743, // gctagt -> agtgct
|
|
2508: 627, // gctata -> agctat
|
|
2509: 871, // gctatc -> atcgct
|
|
2510: 935, // gctatg -> atggct
|
|
2511: 999, // gctatt -> attgct
|
|
2512: 157, // gctcaa -> aagctc
|
|
2513: 413, // gctcac -> acgctc
|
|
2514: 669, // gctcag -> aggctc
|
|
2515: 925, // gctcat -> atgctc
|
|
2516: 629, // gctcca -> agctcc
|
|
2517: 1383, // gctccc -> cccgct
|
|
2518: 1447, // gctccg -> ccggct
|
|
2519: 1511, // gctcct -> cctgct
|
|
2520: 630, // gctcga -> agctcg
|
|
2521: 1639, // gctcgc -> cgcgct
|
|
2522: 1703, // gctcgg -> cgggct
|
|
2523: 1767, // gctcgt -> cgtgct
|
|
2524: 631, // gctcta -> agctct
|
|
2525: 1655, // gctctc -> cgctct
|
|
2526: 1914, // gctctg -> ctctgg
|
|
2527: 1918, // gctctt -> ctcttg
|
|
2528: 158, // gctgaa -> aagctg
|
|
2529: 414, // gctgac -> acgctg
|
|
2530: 670, // gctgag -> aggctg
|
|
2531: 926, // gctgat -> atgctg
|
|
2532: 633, // gctgca -> agctgc
|
|
2533: 1438, // gctgcc -> ccgctg
|
|
2534: 1694, // gctgcg -> cggctg
|
|
2535: 1950, // gctgct -> ctgctg
|
|
2536: 634, // gctgga -> agctgg
|
|
2537: 1658, // gctggc -> cgctgg
|
|
2538: 1962, // gctggg -> ctgggg
|
|
2539: 1966, // gctggt -> ctggtg
|
|
2540: 635, // gctgta -> agctgt
|
|
2541: 1659, // gctgtc -> cgctgt
|
|
2542: 1978, // gctgtg -> ctgtgg
|
|
2543: 1982, // gctgtt -> ctgttg
|
|
2544: 159, // gcttaa -> aagctt
|
|
2545: 415, // gcttac -> acgctt
|
|
2546: 671, // gcttag -> aggctt
|
|
2547: 927, // gcttat -> atgctt
|
|
2548: 637, // gcttca -> agcttc
|
|
2549: 1439, // gcttcc -> ccgctt
|
|
2550: 1695, // gcttcg -> cggctt
|
|
2551: 1951, // gcttct -> ctgctt
|
|
2552: 638, // gcttga -> agcttg
|
|
2553: 1662, // gcttgc -> cgcttg
|
|
2554: 2026, // gcttgg -> cttggg
|
|
2555: 2030, // gcttgt -> cttgtg
|
|
2556: 639, // gcttta -> agcttt
|
|
2557: 1663, // gctttc -> cgcttt
|
|
2558: 2042, // gctttg -> ctttgg
|
|
2559: 2046, // gctttt -> cttttg
|
|
2560: 10, // ggaaaa -> aaaagg
|
|
2561: 26, // ggaaac -> aaacgg
|
|
2562: 42, // ggaaag -> aaaggg
|
|
2563: 58, // ggaaat -> aaatgg
|
|
2564: 74, // ggaaca -> aacagg
|
|
2565: 90, // ggaacc -> aaccgg
|
|
2566: 106, // ggaacg -> aacggg
|
|
2567: 122, // ggaact -> aactgg
|
|
2568: 138, // ggaaga -> aagagg
|
|
2569: 154, // ggaagc -> aagcgg
|
|
2570: 170, // ggaagg -> aagggg
|
|
2571: 186, // ggaagt -> aagtgg
|
|
2572: 202, // ggaata -> aatagg
|
|
2573: 218, // ggaatc -> aatcgg
|
|
2574: 234, // ggaatg -> aatggg
|
|
2575: 250, // ggaatt -> aattgg
|
|
2576: 161, // ggacaa -> aaggac
|
|
2577: 282, // ggacac -> acacgg
|
|
2578: 298, // ggacag -> acaggg
|
|
2579: 314, // ggacat -> acatgg
|
|
2580: 330, // ggacca -> accagg
|
|
2581: 346, // ggaccc -> acccgg
|
|
2582: 362, // ggaccg -> accggg
|
|
2583: 378, // ggacct -> acctgg
|
|
2584: 394, // ggacga -> acgagg
|
|
2585: 410, // ggacgc -> acgcgg
|
|
2586: 426, // ggacgg -> acgggg
|
|
2587: 442, // ggacgt -> acgtgg
|
|
2588: 458, // ggacta -> actagg
|
|
2589: 474, // ggactc -> actcgg
|
|
2590: 490, // ggactg -> actggg
|
|
2591: 506, // ggactt -> acttgg
|
|
2592: 162, // ggagaa -> aaggag
|
|
2593: 418, // ggagac -> acggag
|
|
2594: 554, // ggagag -> agaggg
|
|
2595: 570, // ggagat -> agatgg
|
|
2596: 586, // ggagca -> agcagg
|
|
2597: 602, // ggagcc -> agccgg
|
|
2598: 618, // ggagcg -> agcggg
|
|
2599: 634, // ggagct -> agctgg
|
|
2600: 650, // ggagga -> aggagg
|
|
2601: 666, // ggaggc -> aggcgg
|
|
2602: 682, // ggaggg -> aggggg
|
|
2603: 698, // ggaggt -> aggtgg
|
|
2604: 651, // ggagta -> aggagt
|
|
2605: 730, // ggagtc -> agtcgg
|
|
2606: 746, // ggagtg -> agtggg
|
|
2607: 762, // ggagtt -> agttgg
|
|
2608: 163, // ggataa -> aaggat
|
|
2609: 419, // ggatac -> acggat
|
|
2610: 675, // ggatag -> agggat
|
|
2611: 826, // ggatat -> atatgg
|
|
2612: 653, // ggatca -> aggatc
|
|
2613: 858, // ggatcc -> atccgg
|
|
2614: 874, // ggatcg -> atcggg
|
|
2615: 890, // ggatct -> atctgg
|
|
2616: 654, // ggatga -> aggatg
|
|
2617: 922, // ggatgc -> atgcgg
|
|
2618: 938, // ggatgg -> atgggg
|
|
2619: 954, // ggatgt -> atgtgg
|
|
2620: 655, // ggatta -> aggatt
|
|
2621: 986, // ggattc -> attcgg
|
|
2622: 1002, // ggattg -> attggg
|
|
2623: 1018, // ggattt -> atttgg
|
|
2624: 41, // ggcaaa -> aaaggc
|
|
2625: 105, // ggcaac -> aacggc
|
|
2626: 169, // ggcaag -> aagggc
|
|
2627: 233, // ggcaat -> aatggc
|
|
2628: 297, // ggcaca -> acaggc
|
|
2629: 361, // ggcacc -> accggc
|
|
2630: 425, // ggcacg -> acgggc
|
|
2631: 489, // ggcact -> actggc
|
|
2632: 553, // ggcaga -> agaggc
|
|
2633: 617, // ggcagc -> agcggc
|
|
2634: 681, // ggcagg -> aggggc
|
|
2635: 745, // ggcagt -> agtggc
|
|
2636: 659, // ggcata -> aggcat
|
|
2637: 873, // ggcatc -> atcggc
|
|
2638: 937, // ggcatg -> atgggc
|
|
2639: 1001, // ggcatt -> attggc
|
|
2640: 165, // ggccaa -> aaggcc
|
|
2641: 421, // ggccac -> acggcc
|
|
2642: 677, // ggccag -> agggcc
|
|
2643: 933, // ggccat -> atggcc
|
|
2644: 661, // ggccca -> aggccc
|
|
2645: 1370, // ggcccc -> ccccgg
|
|
2646: 1386, // ggcccg -> cccggg
|
|
2647: 1402, // ggccct -> ccctgg
|
|
2648: 662, // ggccga -> aggccg
|
|
2649: 1434, // ggccgc -> ccgcgg
|
|
2650: 1450, // ggccgg -> ccgggg
|
|
2651: 1466, // ggccgt -> ccgtgg
|
|
2652: 663, // ggccta -> aggcct
|
|
2653: 1498, // ggcctc -> cctcgg
|
|
2654: 1514, // ggcctg -> cctggg
|
|
2655: 1530, // ggcctt -> ccttgg
|
|
2656: 166, // ggcgaa -> aaggcg
|
|
2657: 422, // ggcgac -> acggcg
|
|
2658: 678, // ggcgag -> agggcg
|
|
2659: 934, // ggcgat -> atggcg
|
|
2660: 665, // ggcgca -> aggcgc
|
|
2661: 1446, // ggcgcc -> ccggcg
|
|
2662: 1642, // ggcgcg -> cgcggg
|
|
2663: 1658, // ggcgct -> cgctgg
|
|
2664: 666, // ggcgga -> aggcgg
|
|
2665: 1690, // ggcggc -> cggcgg
|
|
2666: 1706, // ggcggg -> cggggg
|
|
2667: 1722, // ggcggt -> cggtgg
|
|
2668: 667, // ggcgta -> aggcgt
|
|
2669: 1691, // ggcgtc -> cggcgt
|
|
2670: 1770, // ggcgtg -> cgtggg
|
|
2671: 1786, // ggcgtt -> cgttgg
|
|
2672: 167, // ggctaa -> aaggct
|
|
2673: 423, // ggctac -> acggct
|
|
2674: 679, // ggctag -> agggct
|
|
2675: 935, // ggctat -> atggct
|
|
2676: 669, // ggctca -> aggctc
|
|
2677: 1447, // ggctcc -> ccggct
|
|
2678: 1703, // ggctcg -> cgggct
|
|
2679: 1914, // ggctct -> ctctgg
|
|
2680: 670, // ggctga -> aggctg
|
|
2681: 1694, // ggctgc -> cggctg
|
|
2682: 1962, // ggctgg -> ctgggg
|
|
2683: 1978, // ggctgt -> ctgtgg
|
|
2684: 671, // ggctta -> aggctt
|
|
2685: 1695, // ggcttc -> cggctt
|
|
2686: 2026, // ggcttg -> cttggg
|
|
2687: 2042, // ggcttt -> ctttgg
|
|
2688: 42, // gggaaa -> aaaggg
|
|
2689: 106, // gggaac -> aacggg
|
|
2690: 170, // gggaag -> aagggg
|
|
2691: 234, // gggaat -> aatggg
|
|
2692: 298, // gggaca -> acaggg
|
|
2693: 362, // gggacc -> accggg
|
|
2694: 426, // gggacg -> acgggg
|
|
2695: 490, // gggact -> actggg
|
|
2696: 554, // gggaga -> agaggg
|
|
2697: 618, // gggagc -> agcggg
|
|
2698: 682, // gggagg -> aggggg
|
|
2699: 746, // gggagt -> agtggg
|
|
2700: 675, // gggata -> agggat
|
|
2701: 874, // gggatc -> atcggg
|
|
2702: 938, // gggatg -> atgggg
|
|
2703: 1002, // gggatt -> attggg
|
|
2704: 169, // gggcaa -> aagggc
|
|
2705: 425, // gggcac -> acgggc
|
|
2706: 681, // gggcag -> aggggc
|
|
2707: 937, // gggcat -> atgggc
|
|
2708: 677, // gggcca -> agggcc
|
|
2709: 1386, // gggccc -> cccggg
|
|
2710: 1450, // gggccg -> ccgggg
|
|
2711: 1514, // gggcct -> cctggg
|
|
2712: 678, // gggcga -> agggcg
|
|
2713: 1642, // gggcgc -> cgcggg
|
|
2714: 1706, // gggcgg -> cggggg
|
|
2715: 1770, // gggcgt -> cgtggg
|
|
2716: 679, // gggcta -> agggct
|
|
2717: 1703, // gggctc -> cgggct
|
|
2718: 1962, // gggctg -> ctgggg
|
|
2719: 2026, // gggctt -> cttggg
|
|
2720: 170, // ggggaa -> aagggg
|
|
2721: 426, // ggggac -> acgggg
|
|
2722: 682, // ggggag -> aggggg
|
|
2723: 938, // ggggat -> atgggg
|
|
2724: 681, // ggggca -> aggggc
|
|
2725: 1450, // ggggcc -> ccgggg
|
|
2726: 1706, // ggggcg -> cggggg
|
|
2727: 1962, // ggggct -> ctgggg
|
|
2728: 682, // ggggga -> aggggg
|
|
2729: 1706, // gggggc -> cggggg
|
|
2730: 2730, // gggggg -> gggggg
|
|
2731: 2731, // gggggt -> gggggt
|
|
2732: 683, // ggggta -> aggggt
|
|
2733: 1707, // ggggtc -> cggggt
|
|
2734: 2731, // ggggtg -> gggggt
|
|
2735: 2735, // ggggtt -> ggggtt
|
|
2736: 171, // gggtaa -> aagggt
|
|
2737: 427, // gggtac -> acgggt
|
|
2738: 683, // gggtag -> aggggt
|
|
2739: 939, // gggtat -> atgggt
|
|
2740: 685, // gggtca -> agggtc
|
|
2741: 1451, // gggtcc -> ccgggt
|
|
2742: 1707, // gggtcg -> cggggt
|
|
2743: 1963, // gggtct -> ctgggt
|
|
2744: 686, // gggtga -> agggtg
|
|
2745: 1710, // gggtgc -> cgggtg
|
|
2746: 2731, // gggtgg -> gggggt
|
|
2747: 2747, // gggtgt -> gggtgt
|
|
2748: 687, // gggtta -> agggtt
|
|
2749: 1711, // gggttc -> cgggtt
|
|
2750: 2735, // gggttg -> ggggtt
|
|
2751: 2751, // gggttt -> gggttt
|
|
2752: 43, // ggtaaa -> aaaggt
|
|
2753: 107, // ggtaac -> aacggt
|
|
2754: 171, // ggtaag -> aagggt
|
|
2755: 235, // ggtaat -> aatggt
|
|
2756: 299, // ggtaca -> acaggt
|
|
2757: 363, // ggtacc -> accggt
|
|
2758: 427, // ggtacg -> acgggt
|
|
2759: 491, // ggtact -> actggt
|
|
2760: 555, // ggtaga -> agaggt
|
|
2761: 619, // ggtagc -> agcggt
|
|
2762: 683, // ggtagg -> aggggt
|
|
2763: 747, // ggtagt -> agtggt
|
|
2764: 691, // ggtata -> aggtat
|
|
2765: 875, // ggtatc -> atcggt
|
|
2766: 939, // ggtatg -> atgggt
|
|
2767: 1003, // ggtatt -> attggt
|
|
2768: 173, // ggtcaa -> aaggtc
|
|
2769: 429, // ggtcac -> acggtc
|
|
2770: 685, // ggtcag -> agggtc
|
|
2771: 941, // ggtcat -> atggtc
|
|
2772: 693, // ggtcca -> aggtcc
|
|
2773: 1387, // ggtccc -> cccggt
|
|
2774: 1451, // ggtccg -> ccgggt
|
|
2775: 1515, // ggtcct -> cctggt
|
|
2776: 694, // ggtcga -> aggtcg
|
|
2777: 1643, // ggtcgc -> cgcggt
|
|
2778: 1707, // ggtcgg -> cggggt
|
|
2779: 1771, // ggtcgt -> cgtggt
|
|
2780: 695, // ggtcta -> aggtct
|
|
2781: 1719, // ggtctc -> cggtct
|
|
2782: 1963, // ggtctg -> ctgggt
|
|
2783: 2027, // ggtctt -> cttggt
|
|
2784: 174, // ggtgaa -> aaggtg
|
|
2785: 430, // ggtgac -> acggtg
|
|
2786: 686, // ggtgag -> agggtg
|
|
2787: 942, // ggtgat -> atggtg
|
|
2788: 697, // ggtgca -> aggtgc
|
|
2789: 1454, // ggtgcc -> ccggtg
|
|
2790: 1710, // ggtgcg -> cgggtg
|
|
2791: 1966, // ggtgct -> ctggtg
|
|
2792: 698, // ggtgga -> aggtgg
|
|
2793: 1722, // ggtggc -> cggtgg
|
|
2794: 2731, // ggtggg -> gggggt
|
|
2795: 2795, // ggtggt -> ggtggt
|
|
2796: 699, // ggtgta -> aggtgt
|
|
2797: 1723, // ggtgtc -> cggtgt
|
|
2798: 2747, // ggtgtg -> gggtgt
|
|
2799: 2799, // ggtgtt -> ggtgtt
|
|
2800: 175, // ggttaa -> aaggtt
|
|
2801: 431, // ggttac -> acggtt
|
|
2802: 687, // ggttag -> agggtt
|
|
2803: 943, // ggttat -> atggtt
|
|
2804: 701, // ggttca -> aggttc
|
|
2805: 1455, // ggttcc -> ccggtt
|
|
2806: 1711, // ggttcg -> cgggtt
|
|
2807: 1967, // ggttct -> ctggtt
|
|
2808: 702, // ggttga -> aggttg
|
|
2809: 1726, // ggttgc -> cggttg
|
|
2810: 2735, // ggttgg -> ggggtt
|
|
2811: 2811, // ggttgt -> ggttgt
|
|
2812: 703, // ggttta -> aggttt
|
|
2813: 1727, // ggtttc -> cggttt
|
|
2814: 2751, // ggtttg -> gggttt
|
|
2815: 2815, // ggtttt -> ggtttt
|
|
2816: 11, // gtaaaa -> aaaagt
|
|
2817: 27, // gtaaac -> aaacgt
|
|
2818: 43, // gtaaag -> aaaggt
|
|
2819: 59, // gtaaat -> aaatgt
|
|
2820: 75, // gtaaca -> aacagt
|
|
2821: 91, // gtaacc -> aaccgt
|
|
2822: 107, // gtaacg -> aacggt
|
|
2823: 123, // gtaact -> aactgt
|
|
2824: 139, // gtaaga -> aagagt
|
|
2825: 155, // gtaagc -> aagcgt
|
|
2826: 171, // gtaagg -> aagggt
|
|
2827: 187, // gtaagt -> aagtgt
|
|
2828: 203, // gtaata -> aatagt
|
|
2829: 219, // gtaatc -> aatcgt
|
|
2830: 235, // gtaatg -> aatggt
|
|
2831: 251, // gtaatt -> aattgt
|
|
2832: 177, // gtacaa -> aagtac
|
|
2833: 283, // gtacac -> acacgt
|
|
2834: 299, // gtacag -> acaggt
|
|
2835: 315, // gtacat -> acatgt
|
|
2836: 331, // gtacca -> accagt
|
|
2837: 347, // gtaccc -> acccgt
|
|
2838: 363, // gtaccg -> accggt
|
|
2839: 379, // gtacct -> acctgt
|
|
2840: 395, // gtacga -> acgagt
|
|
2841: 411, // gtacgc -> acgcgt
|
|
2842: 427, // gtacgg -> acgggt
|
|
2843: 443, // gtacgt -> acgtgt
|
|
2844: 459, // gtacta -> actagt
|
|
2845: 475, // gtactc -> actcgt
|
|
2846: 491, // gtactg -> actggt
|
|
2847: 507, // gtactt -> acttgt
|
|
2848: 178, // gtagaa -> aagtag
|
|
2849: 434, // gtagac -> acgtag
|
|
2850: 555, // gtagag -> agaggt
|
|
2851: 571, // gtagat -> agatgt
|
|
2852: 587, // gtagca -> agcagt
|
|
2853: 603, // gtagcc -> agccgt
|
|
2854: 619, // gtagcg -> agcggt
|
|
2855: 635, // gtagct -> agctgt
|
|
2856: 651, // gtagga -> aggagt
|
|
2857: 667, // gtaggc -> aggcgt
|
|
2858: 683, // gtaggg -> aggggt
|
|
2859: 699, // gtaggt -> aggtgt
|
|
2860: 715, // gtagta -> agtagt
|
|
2861: 731, // gtagtc -> agtcgt
|
|
2862: 747, // gtagtg -> agtggt
|
|
2863: 763, // gtagtt -> agttgt
|
|
2864: 179, // gtataa -> aagtat
|
|
2865: 435, // gtatac -> acgtat
|
|
2866: 691, // gtatag -> aggtat
|
|
2867: 827, // gtatat -> atatgt
|
|
2868: 717, // gtatca -> agtatc
|
|
2869: 859, // gtatcc -> atccgt
|
|
2870: 875, // gtatcg -> atcggt
|
|
2871: 891, // gtatct -> atctgt
|
|
2872: 718, // gtatga -> agtatg
|
|
2873: 923, // gtatgc -> atgcgt
|
|
2874: 939, // gtatgg -> atgggt
|
|
2875: 955, // gtatgt -> atgtgt
|
|
2876: 719, // gtatta -> agtatt
|
|
2877: 987, // gtattc -> attcgt
|
|
2878: 1003, // gtattg -> attggt
|
|
2879: 1019, // gtattt -> atttgt
|
|
2880: 45, // gtcaaa -> aaagtc
|
|
2881: 109, // gtcaac -> aacgtc
|
|
2882: 173, // gtcaag -> aaggtc
|
|
2883: 237, // gtcaat -> aatgtc
|
|
2884: 301, // gtcaca -> acagtc
|
|
2885: 365, // gtcacc -> accgtc
|
|
2886: 429, // gtcacg -> acggtc
|
|
2887: 493, // gtcact -> actgtc
|
|
2888: 557, // gtcaga -> agagtc
|
|
2889: 621, // gtcagc -> agcgtc
|
|
2890: 685, // gtcagg -> agggtc
|
|
2891: 749, // gtcagt -> agtgtc
|
|
2892: 723, // gtcata -> agtcat
|
|
2893: 877, // gtcatc -> atcgtc
|
|
2894: 941, // gtcatg -> atggtc
|
|
2895: 1005, // gtcatt -> attgtc
|
|
2896: 181, // gtccaa -> aagtcc
|
|
2897: 437, // gtccac -> acgtcc
|
|
2898: 693, // gtccag -> aggtcc
|
|
2899: 949, // gtccat -> atgtcc
|
|
2900: 725, // gtccca -> agtccc
|
|
2901: 1371, // gtcccc -> ccccgt
|
|
2902: 1387, // gtcccg -> cccggt
|
|
2903: 1403, // gtccct -> ccctgt
|
|
2904: 726, // gtccga -> agtccg
|
|
2905: 1435, // gtccgc -> ccgcgt
|
|
2906: 1451, // gtccgg -> ccgggt
|
|
2907: 1467, // gtccgt -> ccgtgt
|
|
2908: 727, // gtccta -> agtcct
|
|
2909: 1499, // gtcctc -> cctcgt
|
|
2910: 1515, // gtcctg -> cctggt
|
|
2911: 1531, // gtcctt -> ccttgt
|
|
2912: 182, // gtcgaa -> aagtcg
|
|
2913: 438, // gtcgac -> acgtcg
|
|
2914: 694, // gtcgag -> aggtcg
|
|
2915: 950, // gtcgat -> atgtcg
|
|
2916: 729, // gtcgca -> agtcgc
|
|
2917: 1462, // gtcgcc -> ccgtcg
|
|
2918: 1643, // gtcgcg -> cgcggt
|
|
2919: 1659, // gtcgct -> cgctgt
|
|
2920: 730, // gtcgga -> agtcgg
|
|
2921: 1691, // gtcggc -> cggcgt
|
|
2922: 1707, // gtcggg -> cggggt
|
|
2923: 1723, // gtcggt -> cggtgt
|
|
2924: 731, // gtcgta -> agtcgt
|
|
2925: 1755, // gtcgtc -> cgtcgt
|
|
2926: 1771, // gtcgtg -> cgtggt
|
|
2927: 1787, // gtcgtt -> cgttgt
|
|
2928: 183, // gtctaa -> aagtct
|
|
2929: 439, // gtctac -> acgtct
|
|
2930: 695, // gtctag -> aggtct
|
|
2931: 951, // gtctat -> atgtct
|
|
2932: 733, // gtctca -> agtctc
|
|
2933: 1463, // gtctcc -> ccgtct
|
|
2934: 1719, // gtctcg -> cggtct
|
|
2935: 1915, // gtctct -> ctctgt
|
|
2936: 734, // gtctga -> agtctg
|
|
2937: 1758, // gtctgc -> cgtctg
|
|
2938: 1963, // gtctgg -> ctgggt
|
|
2939: 1979, // gtctgt -> ctgtgt
|
|
2940: 735, // gtctta -> agtctt
|
|
2941: 1759, // gtcttc -> cgtctt
|
|
2942: 2027, // gtcttg -> cttggt
|
|
2943: 2043, // gtcttt -> ctttgt
|
|
2944: 46, // gtgaaa -> aaagtg
|
|
2945: 110, // gtgaac -> aacgtg
|
|
2946: 174, // gtgaag -> aaggtg
|
|
2947: 238, // gtgaat -> aatgtg
|
|
2948: 302, // gtgaca -> acagtg
|
|
2949: 366, // gtgacc -> accgtg
|
|
2950: 430, // gtgacg -> acggtg
|
|
2951: 494, // gtgact -> actgtg
|
|
2952: 558, // gtgaga -> agagtg
|
|
2953: 622, // gtgagc -> agcgtg
|
|
2954: 686, // gtgagg -> agggtg
|
|
2955: 750, // gtgagt -> agtgtg
|
|
2956: 739, // gtgata -> agtgat
|
|
2957: 878, // gtgatc -> atcgtg
|
|
2958: 942, // gtgatg -> atggtg
|
|
2959: 1006, // gtgatt -> attgtg
|
|
2960: 185, // gtgcaa -> aagtgc
|
|
2961: 441, // gtgcac -> acgtgc
|
|
2962: 697, // gtgcag -> aggtgc
|
|
2963: 953, // gtgcat -> atgtgc
|
|
2964: 741, // gtgcca -> agtgcc
|
|
2965: 1390, // gtgccc -> cccgtg
|
|
2966: 1454, // gtgccg -> ccggtg
|
|
2967: 1518, // gtgcct -> cctgtg
|
|
2968: 742, // gtgcga -> agtgcg
|
|
2969: 1646, // gtgcgc -> cgcgtg
|
|
2970: 1710, // gtgcgg -> cgggtg
|
|
2971: 1774, // gtgcgt -> cgtgtg
|
|
2972: 743, // gtgcta -> agtgct
|
|
2973: 1767, // gtgctc -> cgtgct
|
|
2974: 1966, // gtgctg -> ctggtg
|
|
2975: 2030, // gtgctt -> cttgtg
|
|
2976: 186, // gtggaa -> aagtgg
|
|
2977: 442, // gtggac -> acgtgg
|
|
2978: 698, // gtggag -> aggtgg
|
|
2979: 954, // gtggat -> atgtgg
|
|
2980: 745, // gtggca -> agtggc
|
|
2981: 1466, // gtggcc -> ccgtgg
|
|
2982: 1722, // gtggcg -> cggtgg
|
|
2983: 1978, // gtggct -> ctgtgg
|
|
2984: 746, // gtggga -> agtggg
|
|
2985: 1770, // gtgggc -> cgtggg
|
|
2986: 2731, // gtgggg -> gggggt
|
|
2987: 2747, // gtgggt -> gggtgt
|
|
2988: 747, // gtggta -> agtggt
|
|
2989: 1771, // gtggtc -> cgtggt
|
|
2990: 2795, // gtggtg -> ggtggt
|
|
2991: 2811, // gtggtt -> ggttgt
|
|
2992: 187, // gtgtaa -> aagtgt
|
|
2993: 443, // gtgtac -> acgtgt
|
|
2994: 699, // gtgtag -> aggtgt
|
|
2995: 955, // gtgtat -> atgtgt
|
|
2996: 749, // gtgtca -> agtgtc
|
|
2997: 1467, // gtgtcc -> ccgtgt
|
|
2998: 1723, // gtgtcg -> cggtgt
|
|
2999: 1979, // gtgtct -> ctgtgt
|
|
3000: 750, // gtgtga -> agtgtg
|
|
3001: 1774, // gtgtgc -> cgtgtg
|
|
3002: 2747, // gtgtgg -> gggtgt
|
|
3003: 3003, // gtgtgt -> gtgtgt
|
|
3004: 751, // gtgtta -> agtgtt
|
|
3005: 1775, // gtgttc -> cgtgtt
|
|
3006: 2799, // gtgttg -> ggtgtt
|
|
3007: 3007, // gtgttt -> gtgttt
|
|
3008: 47, // gttaaa -> aaagtt
|
|
3009: 111, // gttaac -> aacgtt
|
|
3010: 175, // gttaag -> aaggtt
|
|
3011: 239, // gttaat -> aatgtt
|
|
3012: 303, // gttaca -> acagtt
|
|
3013: 367, // gttacc -> accgtt
|
|
3014: 431, // gttacg -> acggtt
|
|
3015: 495, // gttact -> actgtt
|
|
3016: 559, // gttaga -> agagtt
|
|
3017: 623, // gttagc -> agcgtt
|
|
3018: 687, // gttagg -> agggtt
|
|
3019: 751, // gttagt -> agtgtt
|
|
3020: 755, // gttata -> agttat
|
|
3021: 879, // gttatc -> atcgtt
|
|
3022: 943, // gttatg -> atggtt
|
|
3023: 1007, // gttatt -> attgtt
|
|
3024: 189, // gttcaa -> aagttc
|
|
3025: 445, // gttcac -> acgttc
|
|
3026: 701, // gttcag -> aggttc
|
|
3027: 957, // gttcat -> atgttc
|
|
3028: 757, // gttcca -> agttcc
|
|
3029: 1391, // gttccc -> cccgtt
|
|
3030: 1455, // gttccg -> ccggtt
|
|
3031: 1519, // gttcct -> cctgtt
|
|
3032: 758, // gttcga -> agttcg
|
|
3033: 1647, // gttcgc -> cgcgtt
|
|
3034: 1711, // gttcgg -> cgggtt
|
|
3035: 1775, // gttcgt -> cgtgtt
|
|
3036: 759, // gttcta -> agttct
|
|
3037: 1783, // gttctc -> cgttct
|
|
3038: 1967, // gttctg -> ctggtt
|
|
3039: 2031, // gttctt -> cttgtt
|
|
3040: 190, // gttgaa -> aagttg
|
|
3041: 446, // gttgac -> acgttg
|
|
3042: 702, // gttgag -> aggttg
|
|
3043: 958, // gttgat -> atgttg
|
|
3044: 761, // gttgca -> agttgc
|
|
3045: 1470, // gttgcc -> ccgttg
|
|
3046: 1726, // gttgcg -> cggttg
|
|
3047: 1982, // gttgct -> ctgttg
|
|
3048: 762, // gttgga -> agttgg
|
|
3049: 1786, // gttggc -> cgttgg
|
|
3050: 2735, // gttggg -> ggggtt
|
|
3051: 2799, // gttggt -> ggtgtt
|
|
3052: 763, // gttgta -> agttgt
|
|
3053: 1787, // gttgtc -> cgttgt
|
|
3054: 2811, // gttgtg -> ggttgt
|
|
3055: 3055, // gttgtt -> gttgtt
|
|
3056: 191, // gtttaa -> aagttt
|
|
3057: 447, // gtttac -> acgttt
|
|
3058: 703, // gtttag -> aggttt
|
|
3059: 959, // gtttat -> atgttt
|
|
3060: 765, // gtttca -> agtttc
|
|
3061: 1471, // gtttcc -> ccgttt
|
|
3062: 1727, // gtttcg -> cggttt
|
|
3063: 1983, // gtttct -> ctgttt
|
|
3064: 766, // gtttga -> agtttg
|
|
3065: 1790, // gtttgc -> cgtttg
|
|
3066: 2751, // gtttgg -> gggttt
|
|
3067: 3007, // gtttgt -> gtgttt
|
|
3068: 767, // gtttta -> agtttt
|
|
3069: 1791, // gttttc -> cgtttt
|
|
3070: 2815, // gttttg -> ggtttt
|
|
3071: 3071, // gttttt -> gttttt
|
|
3072: 3, // taaaaa -> aaaaat
|
|
3073: 7, // taaaac -> aaaact
|
|
3074: 11, // taaaag -> aaaagt
|
|
3075: 15, // taaaat -> aaaatt
|
|
3076: 19, // taaaca -> aaacat
|
|
3077: 23, // taaacc -> aaacct
|
|
3078: 27, // taaacg -> aaacgt
|
|
3079: 31, // taaact -> aaactt
|
|
3080: 35, // taaaga -> aaagat
|
|
3081: 39, // taaagc -> aaagct
|
|
3082: 43, // taaagg -> aaaggt
|
|
3083: 47, // taaagt -> aaagtt
|
|
3084: 51, // taaata -> aaatat
|
|
3085: 55, // taaatc -> aaatct
|
|
3086: 59, // taaatg -> aaatgt
|
|
3087: 63, // taaatt -> aaattt
|
|
3088: 67, // taacaa -> aacaat
|
|
3089: 71, // taacac -> aacact
|
|
3090: 75, // taacag -> aacagt
|
|
3091: 79, // taacat -> aacatt
|
|
3092: 83, // taacca -> aaccat
|
|
3093: 87, // taaccc -> aaccct
|
|
3094: 91, // taaccg -> aaccgt
|
|
3095: 95, // taacct -> aacctt
|
|
3096: 99, // taacga -> aacgat
|
|
3097: 103, // taacgc -> aacgct
|
|
3098: 107, // taacgg -> aacggt
|
|
3099: 111, // taacgt -> aacgtt
|
|
3100: 115, // taacta -> aactat
|
|
3101: 119, // taactc -> aactct
|
|
3102: 123, // taactg -> aactgt
|
|
3103: 127, // taactt -> aacttt
|
|
3104: 131, // taagaa -> aagaat
|
|
3105: 135, // taagac -> aagact
|
|
3106: 139, // taagag -> aagagt
|
|
3107: 143, // taagat -> aagatt
|
|
3108: 147, // taagca -> aagcat
|
|
3109: 151, // taagcc -> aagcct
|
|
3110: 155, // taagcg -> aagcgt
|
|
3111: 159, // taagct -> aagctt
|
|
3112: 163, // taagga -> aaggat
|
|
3113: 167, // taaggc -> aaggct
|
|
3114: 171, // taaggg -> aagggt
|
|
3115: 175, // taaggt -> aaggtt
|
|
3116: 179, // taagta -> aagtat
|
|
3117: 183, // taagtc -> aagtct
|
|
3118: 187, // taagtg -> aagtgt
|
|
3119: 191, // taagtt -> aagttt
|
|
3120: 195, // taataa -> aataat
|
|
3121: 199, // taatac -> aatact
|
|
3122: 203, // taatag -> aatagt
|
|
3123: 207, // taatat -> aatatt
|
|
3124: 211, // taatca -> aatcat
|
|
3125: 215, // taatcc -> aatcct
|
|
3126: 219, // taatcg -> aatcgt
|
|
3127: 223, // taatct -> aatctt
|
|
3128: 227, // taatga -> aatgat
|
|
3129: 231, // taatgc -> aatgct
|
|
3130: 235, // taatgg -> aatggt
|
|
3131: 239, // taatgt -> aatgtt
|
|
3132: 243, // taatta -> aattat
|
|
3133: 247, // taattc -> aattct
|
|
3134: 251, // taattg -> aattgt
|
|
3135: 255, // taattt -> aatttt
|
|
3136: 49, // tacaaa -> aaatac
|
|
3137: 113, // tacaac -> aactac
|
|
3138: 177, // tacaag -> aagtac
|
|
3139: 241, // tacaat -> aattac
|
|
3140: 275, // tacaca -> acacat
|
|
3141: 279, // tacacc -> acacct
|
|
3142: 283, // tacacg -> acacgt
|
|
3143: 287, // tacact -> acactt
|
|
3144: 291, // tacaga -> acagat
|
|
3145: 295, // tacagc -> acagct
|
|
3146: 299, // tacagg -> acaggt
|
|
3147: 303, // tacagt -> acagtt
|
|
3148: 307, // tacata -> acatat
|
|
3149: 311, // tacatc -> acatct
|
|
3150: 315, // tacatg -> acatgt
|
|
3151: 319, // tacatt -> acattt
|
|
3152: 197, // taccaa -> aatacc
|
|
3153: 327, // taccac -> accact
|
|
3154: 331, // taccag -> accagt
|
|
3155: 335, // taccat -> accatt
|
|
3156: 339, // taccca -> acccat
|
|
3157: 343, // tacccc -> acccct
|
|
3158: 347, // tacccg -> acccgt
|
|
3159: 351, // taccct -> accctt
|
|
3160: 355, // taccga -> accgat
|
|
3161: 359, // taccgc -> accgct
|
|
3162: 363, // taccgg -> accggt
|
|
3163: 367, // taccgt -> accgtt
|
|
3164: 371, // taccta -> acctat
|
|
3165: 375, // tacctc -> acctct
|
|
3166: 379, // tacctg -> acctgt
|
|
3167: 383, // tacctt -> accttt
|
|
3168: 198, // tacgaa -> aatacg
|
|
3169: 391, // tacgac -> acgact
|
|
3170: 395, // tacgag -> acgagt
|
|
3171: 399, // tacgat -> acgatt
|
|
3172: 403, // tacgca -> acgcat
|
|
3173: 407, // tacgcc -> acgcct
|
|
3174: 411, // tacgcg -> acgcgt
|
|
3175: 415, // tacgct -> acgctt
|
|
3176: 419, // tacgga -> acggat
|
|
3177: 423, // tacggc -> acggct
|
|
3178: 427, // tacggg -> acgggt
|
|
3179: 431, // tacggt -> acggtt
|
|
3180: 435, // tacgta -> acgtat
|
|
3181: 439, // tacgtc -> acgtct
|
|
3182: 443, // tacgtg -> acgtgt
|
|
3183: 447, // tacgtt -> acgttt
|
|
3184: 199, // tactaa -> aatact
|
|
3185: 455, // tactac -> actact
|
|
3186: 459, // tactag -> actagt
|
|
3187: 463, // tactat -> actatt
|
|
3188: 467, // tactca -> actcat
|
|
3189: 471, // tactcc -> actcct
|
|
3190: 475, // tactcg -> actcgt
|
|
3191: 479, // tactct -> actctt
|
|
3192: 483, // tactga -> actgat
|
|
3193: 487, // tactgc -> actgct
|
|
3194: 491, // tactgg -> actggt
|
|
3195: 495, // tactgt -> actgtt
|
|
3196: 499, // tactta -> acttat
|
|
3197: 503, // tacttc -> acttct
|
|
3198: 507, // tacttg -> acttgt
|
|
3199: 511, // tacttt -> actttt
|
|
3200: 50, // tagaaa -> aaatag
|
|
3201: 114, // tagaac -> aactag
|
|
3202: 178, // tagaag -> aagtag
|
|
3203: 242, // tagaat -> aattag
|
|
3204: 306, // tagaca -> acatag
|
|
3205: 370, // tagacc -> acctag
|
|
3206: 434, // tagacg -> acgtag
|
|
3207: 498, // tagact -> acttag
|
|
3208: 547, // tagaga -> agagat
|
|
3209: 551, // tagagc -> agagct
|
|
3210: 555, // tagagg -> agaggt
|
|
3211: 559, // tagagt -> agagtt
|
|
3212: 563, // tagata -> agatat
|
|
3213: 567, // tagatc -> agatct
|
|
3214: 571, // tagatg -> agatgt
|
|
3215: 575, // tagatt -> agattt
|
|
3216: 201, // tagcaa -> aatagc
|
|
3217: 457, // tagcac -> actagc
|
|
3218: 587, // tagcag -> agcagt
|
|
3219: 591, // tagcat -> agcatt
|
|
3220: 595, // tagcca -> agccat
|
|
3221: 599, // tagccc -> agccct
|
|
3222: 603, // tagccg -> agccgt
|
|
3223: 607, // tagcct -> agcctt
|
|
3224: 611, // tagcga -> agcgat
|
|
3225: 615, // tagcgc -> agcgct
|
|
3226: 619, // tagcgg -> agcggt
|
|
3227: 623, // tagcgt -> agcgtt
|
|
3228: 627, // tagcta -> agctat
|
|
3229: 631, // tagctc -> agctct
|
|
3230: 635, // tagctg -> agctgt
|
|
3231: 639, // tagctt -> agcttt
|
|
3232: 202, // taggaa -> aatagg
|
|
3233: 458, // taggac -> actagg
|
|
3234: 651, // taggag -> aggagt
|
|
3235: 655, // taggat -> aggatt
|
|
3236: 659, // taggca -> aggcat
|
|
3237: 663, // taggcc -> aggcct
|
|
3238: 667, // taggcg -> aggcgt
|
|
3239: 671, // taggct -> aggctt
|
|
3240: 675, // taggga -> agggat
|
|
3241: 679, // tagggc -> agggct
|
|
3242: 683, // tagggg -> aggggt
|
|
3243: 687, // tagggt -> agggtt
|
|
3244: 691, // taggta -> aggtat
|
|
3245: 695, // taggtc -> aggtct
|
|
3246: 699, // taggtg -> aggtgt
|
|
3247: 703, // taggtt -> aggttt
|
|
3248: 203, // tagtaa -> aatagt
|
|
3249: 459, // tagtac -> actagt
|
|
3250: 715, // tagtag -> agtagt
|
|
3251: 719, // tagtat -> agtatt
|
|
3252: 723, // tagtca -> agtcat
|
|
3253: 727, // tagtcc -> agtcct
|
|
3254: 731, // tagtcg -> agtcgt
|
|
3255: 735, // tagtct -> agtctt
|
|
3256: 739, // tagtga -> agtgat
|
|
3257: 743, // tagtgc -> agtgct
|
|
3258: 747, // tagtgg -> agtggt
|
|
3259: 751, // tagtgt -> agtgtt
|
|
3260: 755, // tagtta -> agttat
|
|
3261: 759, // tagttc -> agttct
|
|
3262: 763, // tagttg -> agttgt
|
|
3263: 767, // tagttt -> agtttt
|
|
3264: 51, // tataaa -> aaatat
|
|
3265: 115, // tataac -> aactat
|
|
3266: 179, // tataag -> aagtat
|
|
3267: 243, // tataat -> aattat
|
|
3268: 307, // tataca -> acatat
|
|
3269: 371, // tatacc -> acctat
|
|
3270: 435, // tatacg -> acgtat
|
|
3271: 499, // tatact -> acttat
|
|
3272: 563, // tataga -> agatat
|
|
3273: 627, // tatagc -> agctat
|
|
3274: 691, // tatagg -> aggtat
|
|
3275: 755, // tatagt -> agttat
|
|
3276: 819, // tatata -> atatat
|
|
3277: 823, // tatatc -> atatct
|
|
3278: 827, // tatatg -> atatgt
|
|
3279: 831, // tatatt -> atattt
|
|
3280: 205, // tatcaa -> aatatc
|
|
3281: 461, // tatcac -> actatc
|
|
3282: 717, // tatcag -> agtatc
|
|
3283: 847, // tatcat -> atcatt
|
|
3284: 821, // tatcca -> atatcc
|
|
3285: 855, // tatccc -> atccct
|
|
3286: 859, // tatccg -> atccgt
|
|
3287: 863, // tatcct -> atcctt
|
|
3288: 822, // tatcga -> atatcg
|
|
3289: 871, // tatcgc -> atcgct
|
|
3290: 875, // tatcgg -> atcggt
|
|
3291: 879, // tatcgt -> atcgtt
|
|
3292: 823, // tatcta -> atatct
|
|
3293: 887, // tatctc -> atctct
|
|
3294: 891, // tatctg -> atctgt
|
|
3295: 895, // tatctt -> atcttt
|
|
3296: 206, // tatgaa -> aatatg
|
|
3297: 462, // tatgac -> actatg
|
|
3298: 718, // tatgag -> agtatg
|
|
3299: 911, // tatgat -> atgatt
|
|
3300: 825, // tatgca -> atatgc
|
|
3301: 919, // tatgcc -> atgcct
|
|
3302: 923, // tatgcg -> atgcgt
|
|
3303: 927, // tatgct -> atgctt
|
|
3304: 826, // tatgga -> atatgg
|
|
3305: 935, // tatggc -> atggct
|
|
3306: 939, // tatggg -> atgggt
|
|
3307: 943, // tatggt -> atggtt
|
|
3308: 827, // tatgta -> atatgt
|
|
3309: 951, // tatgtc -> atgtct
|
|
3310: 955, // tatgtg -> atgtgt
|
|
3311: 959, // tatgtt -> atgttt
|
|
3312: 207, // tattaa -> aatatt
|
|
3313: 463, // tattac -> actatt
|
|
3314: 719, // tattag -> agtatt
|
|
3315: 975, // tattat -> attatt
|
|
3316: 829, // tattca -> atattc
|
|
3317: 983, // tattcc -> attcct
|
|
3318: 987, // tattcg -> attcgt
|
|
3319: 991, // tattct -> attctt
|
|
3320: 830, // tattga -> atattg
|
|
3321: 999, // tattgc -> attgct
|
|
3322: 1003, // tattgg -> attggt
|
|
3323: 1007, // tattgt -> attgtt
|
|
3324: 831, // tattta -> atattt
|
|
3325: 1015, // tatttc -> atttct
|
|
3326: 1019, // tatttg -> atttgt
|
|
3327: 1023, // tatttt -> attttt
|
|
3328: 13, // tcaaaa -> aaaatc
|
|
3329: 29, // tcaaac -> aaactc
|
|
3330: 45, // tcaaag -> aaagtc
|
|
3331: 61, // tcaaat -> aaattc
|
|
3332: 77, // tcaaca -> aacatc
|
|
3333: 93, // tcaacc -> aacctc
|
|
3334: 109, // tcaacg -> aacgtc
|
|
3335: 125, // tcaact -> aacttc
|
|
3336: 141, // tcaaga -> aagatc
|
|
3337: 157, // tcaagc -> aagctc
|
|
3338: 173, // tcaagg -> aaggtc
|
|
3339: 189, // tcaagt -> aagttc
|
|
3340: 205, // tcaata -> aatatc
|
|
3341: 221, // tcaatc -> aatctc
|
|
3342: 237, // tcaatg -> aatgtc
|
|
3343: 253, // tcaatt -> aatttc
|
|
3344: 209, // tcacaa -> aatcac
|
|
3345: 285, // tcacac -> acactc
|
|
3346: 301, // tcacag -> acagtc
|
|
3347: 317, // tcacat -> acattc
|
|
3348: 333, // tcacca -> accatc
|
|
3349: 349, // tcaccc -> accctc
|
|
3350: 365, // tcaccg -> accgtc
|
|
3351: 381, // tcacct -> accttc
|
|
3352: 397, // tcacga -> acgatc
|
|
3353: 413, // tcacgc -> acgctc
|
|
3354: 429, // tcacgg -> acggtc
|
|
3355: 445, // tcacgt -> acgttc
|
|
3356: 461, // tcacta -> actatc
|
|
3357: 477, // tcactc -> actctc
|
|
3358: 493, // tcactg -> actgtc
|
|
3359: 509, // tcactt -> actttc
|
|
3360: 210, // tcagaa -> aatcag
|
|
3361: 466, // tcagac -> actcag
|
|
3362: 557, // tcagag -> agagtc
|
|
3363: 573, // tcagat -> agattc
|
|
3364: 589, // tcagca -> agcatc
|
|
3365: 605, // tcagcc -> agcctc
|
|
3366: 621, // tcagcg -> agcgtc
|
|
3367: 637, // tcagct -> agcttc
|
|
3368: 653, // tcagga -> aggatc
|
|
3369: 669, // tcaggc -> aggctc
|
|
3370: 685, // tcaggg -> agggtc
|
|
3371: 701, // tcaggt -> aggttc
|
|
3372: 717, // tcagta -> agtatc
|
|
3373: 733, // tcagtc -> agtctc
|
|
3374: 749, // tcagtg -> agtgtc
|
|
3375: 765, // tcagtt -> agtttc
|
|
3376: 211, // tcataa -> aatcat
|
|
3377: 467, // tcatac -> actcat
|
|
3378: 723, // tcatag -> agtcat
|
|
3379: 829, // tcatat -> atattc
|
|
3380: 845, // tcatca -> atcatc
|
|
3381: 861, // tcatcc -> atcctc
|
|
3382: 877, // tcatcg -> atcgtc
|
|
3383: 893, // tcatct -> atcttc
|
|
3384: 846, // tcatga -> atcatg
|
|
3385: 925, // tcatgc -> atgctc
|
|
3386: 941, // tcatgg -> atggtc
|
|
3387: 957, // tcatgt -> atgttc
|
|
3388: 847, // tcatta -> atcatt
|
|
3389: 989, // tcattc -> attctc
|
|
3390: 1005, // tcattg -> attgtc
|
|
3391: 1021, // tcattt -> attttc
|
|
3392: 53, // tccaaa -> aaatcc
|
|
3393: 117, // tccaac -> aactcc
|
|
3394: 181, // tccaag -> aagtcc
|
|
3395: 245, // tccaat -> aattcc
|
|
3396: 309, // tccaca -> acatcc
|
|
3397: 373, // tccacc -> acctcc
|
|
3398: 437, // tccacg -> acgtcc
|
|
3399: 501, // tccact -> acttcc
|
|
3400: 565, // tccaga -> agatcc
|
|
3401: 629, // tccagc -> agctcc
|
|
3402: 693, // tccagg -> aggtcc
|
|
3403: 757, // tccagt -> agttcc
|
|
3404: 821, // tccata -> atatcc
|
|
3405: 885, // tccatc -> atctcc
|
|
3406: 949, // tccatg -> atgtcc
|
|
3407: 1013, // tccatt -> atttcc
|
|
3408: 213, // tcccaa -> aatccc
|
|
3409: 469, // tcccac -> actccc
|
|
3410: 725, // tcccag -> agtccc
|
|
3411: 981, // tcccat -> attccc
|
|
3412: 853, // tcccca -> atcccc
|
|
3413: 1367, // tccccc -> ccccct
|
|
3414: 1371, // tccccg -> ccccgt
|
|
3415: 1375, // tcccct -> cccctt
|
|
3416: 854, // tcccga -> atcccg
|
|
3417: 1383, // tcccgc -> cccgct
|
|
3418: 1387, // tcccgg -> cccggt
|
|
3419: 1391, // tcccgt -> cccgtt
|
|
3420: 855, // tcccta -> atccct
|
|
3421: 1399, // tccctc -> ccctct
|
|
3422: 1403, // tccctg -> ccctgt
|
|
3423: 1407, // tccctt -> cccttt
|
|
3424: 214, // tccgaa -> aatccg
|
|
3425: 470, // tccgac -> actccg
|
|
3426: 726, // tccgag -> agtccg
|
|
3427: 982, // tccgat -> attccg
|
|
3428: 857, // tccgca -> atccgc
|
|
3429: 1431, // tccgcc -> ccgcct
|
|
3430: 1435, // tccgcg -> ccgcgt
|
|
3431: 1439, // tccgct -> ccgctt
|
|
3432: 858, // tccgga -> atccgg
|
|
3433: 1447, // tccggc -> ccggct
|
|
3434: 1451, // tccggg -> ccgggt
|
|
3435: 1455, // tccggt -> ccggtt
|
|
3436: 859, // tccgta -> atccgt
|
|
3437: 1463, // tccgtc -> ccgtct
|
|
3438: 1467, // tccgtg -> ccgtgt
|
|
3439: 1471, // tccgtt -> ccgttt
|
|
3440: 215, // tcctaa -> aatcct
|
|
3441: 471, // tcctac -> actcct
|
|
3442: 727, // tcctag -> agtcct
|
|
3443: 983, // tcctat -> attcct
|
|
3444: 861, // tcctca -> atcctc
|
|
3445: 1495, // tcctcc -> cctcct
|
|
3446: 1499, // tcctcg -> cctcgt
|
|
3447: 1503, // tcctct -> cctctt
|
|
3448: 862, // tcctga -> atcctg
|
|
3449: 1511, // tcctgc -> cctgct
|
|
3450: 1515, // tcctgg -> cctggt
|
|
3451: 1519, // tcctgt -> cctgtt
|
|
3452: 863, // tcctta -> atcctt
|
|
3453: 1527, // tccttc -> ccttct
|
|
3454: 1531, // tccttg -> ccttgt
|
|
3455: 1535, // tccttt -> cctttt
|
|
3456: 54, // tcgaaa -> aaatcg
|
|
3457: 118, // tcgaac -> aactcg
|
|
3458: 182, // tcgaag -> aagtcg
|
|
3459: 246, // tcgaat -> aattcg
|
|
3460: 310, // tcgaca -> acatcg
|
|
3461: 374, // tcgacc -> acctcg
|
|
3462: 438, // tcgacg -> acgtcg
|
|
3463: 502, // tcgact -> acttcg
|
|
3464: 566, // tcgaga -> agatcg
|
|
3465: 630, // tcgagc -> agctcg
|
|
3466: 694, // tcgagg -> aggtcg
|
|
3467: 758, // tcgagt -> agttcg
|
|
3468: 822, // tcgata -> atatcg
|
|
3469: 886, // tcgatc -> atctcg
|
|
3470: 950, // tcgatg -> atgtcg
|
|
3471: 1014, // tcgatt -> atttcg
|
|
3472: 217, // tcgcaa -> aatcgc
|
|
3473: 473, // tcgcac -> actcgc
|
|
3474: 729, // tcgcag -> agtcgc
|
|
3475: 985, // tcgcat -> attcgc
|
|
3476: 869, // tcgcca -> atcgcc
|
|
3477: 1398, // tcgccc -> ccctcg
|
|
3478: 1462, // tcgccg -> ccgtcg
|
|
3479: 1526, // tcgcct -> ccttcg
|
|
3480: 870, // tcgcga -> atcgcg
|
|
3481: 1639, // tcgcgc -> cgcgct
|
|
3482: 1643, // tcgcgg -> cgcggt
|
|
3483: 1647, // tcgcgt -> cgcgtt
|
|
3484: 871, // tcgcta -> atcgct
|
|
3485: 1655, // tcgctc -> cgctct
|
|
3486: 1659, // tcgctg -> cgctgt
|
|
3487: 1663, // tcgctt -> cgcttt
|
|
3488: 218, // tcggaa -> aatcgg
|
|
3489: 474, // tcggac -> actcgg
|
|
3490: 730, // tcggag -> agtcgg
|
|
3491: 986, // tcggat -> attcgg
|
|
3492: 873, // tcggca -> atcggc
|
|
3493: 1498, // tcggcc -> cctcgg
|
|
3494: 1691, // tcggcg -> cggcgt
|
|
3495: 1695, // tcggct -> cggctt
|
|
3496: 874, // tcggga -> atcggg
|
|
3497: 1703, // tcgggc -> cgggct
|
|
3498: 1707, // tcgggg -> cggggt
|
|
3499: 1711, // tcgggt -> cgggtt
|
|
3500: 875, // tcggta -> atcggt
|
|
3501: 1719, // tcggtc -> cggtct
|
|
3502: 1723, // tcggtg -> cggtgt
|
|
3503: 1727, // tcggtt -> cggttt
|
|
3504: 219, // tcgtaa -> aatcgt
|
|
3505: 475, // tcgtac -> actcgt
|
|
3506: 731, // tcgtag -> agtcgt
|
|
3507: 987, // tcgtat -> attcgt
|
|
3508: 877, // tcgtca -> atcgtc
|
|
3509: 1499, // tcgtcc -> cctcgt
|
|
3510: 1755, // tcgtcg -> cgtcgt
|
|
3511: 1759, // tcgtct -> cgtctt
|
|
3512: 878, // tcgtga -> atcgtg
|
|
3513: 1767, // tcgtgc -> cgtgct
|
|
3514: 1771, // tcgtgg -> cgtggt
|
|
3515: 1775, // tcgtgt -> cgtgtt
|
|
3516: 879, // tcgtta -> atcgtt
|
|
3517: 1783, // tcgttc -> cgttct
|
|
3518: 1787, // tcgttg -> cgttgt
|
|
3519: 1791, // tcgttt -> cgtttt
|
|
3520: 55, // tctaaa -> aaatct
|
|
3521: 119, // tctaac -> aactct
|
|
3522: 183, // tctaag -> aagtct
|
|
3523: 247, // tctaat -> aattct
|
|
3524: 311, // tctaca -> acatct
|
|
3525: 375, // tctacc -> acctct
|
|
3526: 439, // tctacg -> acgtct
|
|
3527: 503, // tctact -> acttct
|
|
3528: 567, // tctaga -> agatct
|
|
3529: 631, // tctagc -> agctct
|
|
3530: 695, // tctagg -> aggtct
|
|
3531: 759, // tctagt -> agttct
|
|
3532: 823, // tctata -> atatct
|
|
3533: 887, // tctatc -> atctct
|
|
3534: 951, // tctatg -> atgtct
|
|
3535: 1015, // tctatt -> atttct
|
|
3536: 221, // tctcaa -> aatctc
|
|
3537: 477, // tctcac -> actctc
|
|
3538: 733, // tctcag -> agtctc
|
|
3539: 989, // tctcat -> attctc
|
|
3540: 885, // tctcca -> atctcc
|
|
3541: 1399, // tctccc -> ccctct
|
|
3542: 1463, // tctccg -> ccgtct
|
|
3543: 1527, // tctcct -> ccttct
|
|
3544: 886, // tctcga -> atctcg
|
|
3545: 1655, // tctcgc -> cgctct
|
|
3546: 1719, // tctcgg -> cggtct
|
|
3547: 1783, // tctcgt -> cgttct
|
|
3548: 887, // tctcta -> atctct
|
|
3549: 1911, // tctctc -> ctctct
|
|
3550: 1915, // tctctg -> ctctgt
|
|
3551: 1919, // tctctt -> ctcttt
|
|
3552: 222, // tctgaa -> aatctg
|
|
3553: 478, // tctgac -> actctg
|
|
3554: 734, // tctgag -> agtctg
|
|
3555: 990, // tctgat -> attctg
|
|
3556: 889, // tctgca -> atctgc
|
|
3557: 1502, // tctgcc -> cctctg
|
|
3558: 1758, // tctgcg -> cgtctg
|
|
3559: 1951, // tctgct -> ctgctt
|
|
3560: 890, // tctgga -> atctgg
|
|
3561: 1914, // tctggc -> ctctgg
|
|
3562: 1963, // tctggg -> ctgggt
|
|
3563: 1967, // tctggt -> ctggtt
|
|
3564: 891, // tctgta -> atctgt
|
|
3565: 1915, // tctgtc -> ctctgt
|
|
3566: 1979, // tctgtg -> ctgtgt
|
|
3567: 1983, // tctgtt -> ctgttt
|
|
3568: 223, // tcttaa -> aatctt
|
|
3569: 479, // tcttac -> actctt
|
|
3570: 735, // tcttag -> agtctt
|
|
3571: 991, // tcttat -> attctt
|
|
3572: 893, // tcttca -> atcttc
|
|
3573: 1503, // tcttcc -> cctctt
|
|
3574: 1759, // tcttcg -> cgtctt
|
|
3575: 2015, // tcttct -> cttctt
|
|
3576: 894, // tcttga -> atcttg
|
|
3577: 1918, // tcttgc -> ctcttg
|
|
3578: 2027, // tcttgg -> cttggt
|
|
3579: 2031, // tcttgt -> cttgtt
|
|
3580: 895, // tcttta -> atcttt
|
|
3581: 1919, // tctttc -> ctcttt
|
|
3582: 2043, // tctttg -> ctttgt
|
|
3583: 2047, // tctttt -> cttttt
|
|
3584: 14, // tgaaaa -> aaaatg
|
|
3585: 30, // tgaaac -> aaactg
|
|
3586: 46, // tgaaag -> aaagtg
|
|
3587: 62, // tgaaat -> aaattg
|
|
3588: 78, // tgaaca -> aacatg
|
|
3589: 94, // tgaacc -> aacctg
|
|
3590: 110, // tgaacg -> aacgtg
|
|
3591: 126, // tgaact -> aacttg
|
|
3592: 142, // tgaaga -> aagatg
|
|
3593: 158, // tgaagc -> aagctg
|
|
3594: 174, // tgaagg -> aaggtg
|
|
3595: 190, // tgaagt -> aagttg
|
|
3596: 206, // tgaata -> aatatg
|
|
3597: 222, // tgaatc -> aatctg
|
|
3598: 238, // tgaatg -> aatgtg
|
|
3599: 254, // tgaatt -> aatttg
|
|
3600: 225, // tgacaa -> aatgac
|
|
3601: 286, // tgacac -> acactg
|
|
3602: 302, // tgacag -> acagtg
|
|
3603: 318, // tgacat -> acattg
|
|
3604: 334, // tgacca -> accatg
|
|
3605: 350, // tgaccc -> accctg
|
|
3606: 366, // tgaccg -> accgtg
|
|
3607: 382, // tgacct -> accttg
|
|
3608: 398, // tgacga -> acgatg
|
|
3609: 414, // tgacgc -> acgctg
|
|
3610: 430, // tgacgg -> acggtg
|
|
3611: 446, // tgacgt -> acgttg
|
|
3612: 462, // tgacta -> actatg
|
|
3613: 478, // tgactc -> actctg
|
|
3614: 494, // tgactg -> actgtg
|
|
3615: 510, // tgactt -> actttg
|
|
3616: 226, // tgagaa -> aatgag
|
|
3617: 482, // tgagac -> actgag
|
|
3618: 558, // tgagag -> agagtg
|
|
3619: 574, // tgagat -> agattg
|
|
3620: 590, // tgagca -> agcatg
|
|
3621: 606, // tgagcc -> agcctg
|
|
3622: 622, // tgagcg -> agcgtg
|
|
3623: 638, // tgagct -> agcttg
|
|
3624: 654, // tgagga -> aggatg
|
|
3625: 670, // tgaggc -> aggctg
|
|
3626: 686, // tgaggg -> agggtg
|
|
3627: 702, // tgaggt -> aggttg
|
|
3628: 718, // tgagta -> agtatg
|
|
3629: 734, // tgagtc -> agtctg
|
|
3630: 750, // tgagtg -> agtgtg
|
|
3631: 766, // tgagtt -> agtttg
|
|
3632: 227, // tgataa -> aatgat
|
|
3633: 483, // tgatac -> actgat
|
|
3634: 739, // tgatag -> agtgat
|
|
3635: 830, // tgatat -> atattg
|
|
3636: 846, // tgatca -> atcatg
|
|
3637: 862, // tgatcc -> atcctg
|
|
3638: 878, // tgatcg -> atcgtg
|
|
3639: 894, // tgatct -> atcttg
|
|
3640: 910, // tgatga -> atgatg
|
|
3641: 926, // tgatgc -> atgctg
|
|
3642: 942, // tgatgg -> atggtg
|
|
3643: 958, // tgatgt -> atgttg
|
|
3644: 911, // tgatta -> atgatt
|
|
3645: 990, // tgattc -> attctg
|
|
3646: 1006, // tgattg -> attgtg
|
|
3647: 1022, // tgattt -> attttg
|
|
3648: 57, // tgcaaa -> aaatgc
|
|
3649: 121, // tgcaac -> aactgc
|
|
3650: 185, // tgcaag -> aagtgc
|
|
3651: 249, // tgcaat -> aattgc
|
|
3652: 313, // tgcaca -> acatgc
|
|
3653: 377, // tgcacc -> acctgc
|
|
3654: 441, // tgcacg -> acgtgc
|
|
3655: 505, // tgcact -> acttgc
|
|
3656: 569, // tgcaga -> agatgc
|
|
3657: 633, // tgcagc -> agctgc
|
|
3658: 697, // tgcagg -> aggtgc
|
|
3659: 761, // tgcagt -> agttgc
|
|
3660: 825, // tgcata -> atatgc
|
|
3661: 889, // tgcatc -> atctgc
|
|
3662: 953, // tgcatg -> atgtgc
|
|
3663: 1017, // tgcatt -> atttgc
|
|
3664: 229, // tgccaa -> aatgcc
|
|
3665: 485, // tgccac -> actgcc
|
|
3666: 741, // tgccag -> agtgcc
|
|
3667: 997, // tgccat -> attgcc
|
|
3668: 917, // tgccca -> atgccc
|
|
3669: 1374, // tgcccc -> cccctg
|
|
3670: 1390, // tgcccg -> cccgtg
|
|
3671: 1406, // tgccct -> cccttg
|
|
3672: 918, // tgccga -> atgccg
|
|
3673: 1438, // tgccgc -> ccgctg
|
|
3674: 1454, // tgccgg -> ccggtg
|
|
3675: 1470, // tgccgt -> ccgttg
|
|
3676: 919, // tgccta -> atgcct
|
|
3677: 1502, // tgcctc -> cctctg
|
|
3678: 1518, // tgcctg -> cctgtg
|
|
3679: 1534, // tgcctt -> cctttg
|
|
3680: 230, // tgcgaa -> aatgcg
|
|
3681: 486, // tgcgac -> actgcg
|
|
3682: 742, // tgcgag -> agtgcg
|
|
3683: 998, // tgcgat -> attgcg
|
|
3684: 921, // tgcgca -> atgcgc
|
|
3685: 1510, // tgcgcc -> cctgcg
|
|
3686: 1646, // tgcgcg -> cgcgtg
|
|
3687: 1662, // tgcgct -> cgcttg
|
|
3688: 922, // tgcgga -> atgcgg
|
|
3689: 1694, // tgcggc -> cggctg
|
|
3690: 1710, // tgcggg -> cgggtg
|
|
3691: 1726, // tgcggt -> cggttg
|
|
3692: 923, // tgcgta -> atgcgt
|
|
3693: 1758, // tgcgtc -> cgtctg
|
|
3694: 1774, // tgcgtg -> cgtgtg
|
|
3695: 1790, // tgcgtt -> cgtttg
|
|
3696: 231, // tgctaa -> aatgct
|
|
3697: 487, // tgctac -> actgct
|
|
3698: 743, // tgctag -> agtgct
|
|
3699: 999, // tgctat -> attgct
|
|
3700: 925, // tgctca -> atgctc
|
|
3701: 1511, // tgctcc -> cctgct
|
|
3702: 1767, // tgctcg -> cgtgct
|
|
3703: 1918, // tgctct -> ctcttg
|
|
3704: 926, // tgctga -> atgctg
|
|
3705: 1950, // tgctgc -> ctgctg
|
|
3706: 1966, // tgctgg -> ctggtg
|
|
3707: 1982, // tgctgt -> ctgttg
|
|
3708: 927, // tgctta -> atgctt
|
|
3709: 1951, // tgcttc -> ctgctt
|
|
3710: 2030, // tgcttg -> cttgtg
|
|
3711: 2046, // tgcttt -> cttttg
|
|
3712: 58, // tggaaa -> aaatgg
|
|
3713: 122, // tggaac -> aactgg
|
|
3714: 186, // tggaag -> aagtgg
|
|
3715: 250, // tggaat -> aattgg
|
|
3716: 314, // tggaca -> acatgg
|
|
3717: 378, // tggacc -> acctgg
|
|
3718: 442, // tggacg -> acgtgg
|
|
3719: 506, // tggact -> acttgg
|
|
3720: 570, // tggaga -> agatgg
|
|
3721: 634, // tggagc -> agctgg
|
|
3722: 698, // tggagg -> aggtgg
|
|
3723: 762, // tggagt -> agttgg
|
|
3724: 826, // tggata -> atatgg
|
|
3725: 890, // tggatc -> atctgg
|
|
3726: 954, // tggatg -> atgtgg
|
|
3727: 1018, // tggatt -> atttgg
|
|
3728: 233, // tggcaa -> aatggc
|
|
3729: 489, // tggcac -> actggc
|
|
3730: 745, // tggcag -> agtggc
|
|
3731: 1001, // tggcat -> attggc
|
|
3732: 933, // tggcca -> atggcc
|
|
3733: 1402, // tggccc -> ccctgg
|
|
3734: 1466, // tggccg -> ccgtgg
|
|
3735: 1530, // tggcct -> ccttgg
|
|
3736: 934, // tggcga -> atggcg
|
|
3737: 1658, // tggcgc -> cgctgg
|
|
3738: 1722, // tggcgg -> cggtgg
|
|
3739: 1786, // tggcgt -> cgttgg
|
|
3740: 935, // tggcta -> atggct
|
|
3741: 1914, // tggctc -> ctctgg
|
|
3742: 1978, // tggctg -> ctgtgg
|
|
3743: 2042, // tggctt -> ctttgg
|
|
3744: 234, // tgggaa -> aatggg
|
|
3745: 490, // tgggac -> actggg
|
|
3746: 746, // tgggag -> agtggg
|
|
3747: 1002, // tgggat -> attggg
|
|
3748: 937, // tgggca -> atgggc
|
|
3749: 1514, // tgggcc -> cctggg
|
|
3750: 1770, // tgggcg -> cgtggg
|
|
3751: 2026, // tgggct -> cttggg
|
|
3752: 938, // tgggga -> atgggg
|
|
3753: 1962, // tggggc -> ctgggg
|
|
3754: 2731, // tggggg -> gggggt
|
|
3755: 2735, // tggggt -> ggggtt
|
|
3756: 939, // tgggta -> atgggt
|
|
3757: 1963, // tgggtc -> ctgggt
|
|
3758: 2747, // tgggtg -> gggtgt
|
|
3759: 2751, // tgggtt -> gggttt
|
|
3760: 235, // tggtaa -> aatggt
|
|
3761: 491, // tggtac -> actggt
|
|
3762: 747, // tggtag -> agtggt
|
|
3763: 1003, // tggtat -> attggt
|
|
3764: 941, // tggtca -> atggtc
|
|
3765: 1515, // tggtcc -> cctggt
|
|
3766: 1771, // tggtcg -> cgtggt
|
|
3767: 2027, // tggtct -> cttggt
|
|
3768: 942, // tggtga -> atggtg
|
|
3769: 1966, // tggtgc -> ctggtg
|
|
3770: 2795, // tggtgg -> ggtggt
|
|
3771: 2799, // tggtgt -> ggtgtt
|
|
3772: 943, // tggtta -> atggtt
|
|
3773: 1967, // tggttc -> ctggtt
|
|
3774: 2811, // tggttg -> ggttgt
|
|
3775: 2815, // tggttt -> ggtttt
|
|
3776: 59, // tgtaaa -> aaatgt
|
|
3777: 123, // tgtaac -> aactgt
|
|
3778: 187, // tgtaag -> aagtgt
|
|
3779: 251, // tgtaat -> aattgt
|
|
3780: 315, // tgtaca -> acatgt
|
|
3781: 379, // tgtacc -> acctgt
|
|
3782: 443, // tgtacg -> acgtgt
|
|
3783: 507, // tgtact -> acttgt
|
|
3784: 571, // tgtaga -> agatgt
|
|
3785: 635, // tgtagc -> agctgt
|
|
3786: 699, // tgtagg -> aggtgt
|
|
3787: 763, // tgtagt -> agttgt
|
|
3788: 827, // tgtata -> atatgt
|
|
3789: 891, // tgtatc -> atctgt
|
|
3790: 955, // tgtatg -> atgtgt
|
|
3791: 1019, // tgtatt -> atttgt
|
|
3792: 237, // tgtcaa -> aatgtc
|
|
3793: 493, // tgtcac -> actgtc
|
|
3794: 749, // tgtcag -> agtgtc
|
|
3795: 1005, // tgtcat -> attgtc
|
|
3796: 949, // tgtcca -> atgtcc
|
|
3797: 1403, // tgtccc -> ccctgt
|
|
3798: 1467, // tgtccg -> ccgtgt
|
|
3799: 1531, // tgtcct -> ccttgt
|
|
3800: 950, // tgtcga -> atgtcg
|
|
3801: 1659, // tgtcgc -> cgctgt
|
|
3802: 1723, // tgtcgg -> cggtgt
|
|
3803: 1787, // tgtcgt -> cgttgt
|
|
3804: 951, // tgtcta -> atgtct
|
|
3805: 1915, // tgtctc -> ctctgt
|
|
3806: 1979, // tgtctg -> ctgtgt
|
|
3807: 2043, // tgtctt -> ctttgt
|
|
3808: 238, // tgtgaa -> aatgtg
|
|
3809: 494, // tgtgac -> actgtg
|
|
3810: 750, // tgtgag -> agtgtg
|
|
3811: 1006, // tgtgat -> attgtg
|
|
3812: 953, // tgtgca -> atgtgc
|
|
3813: 1518, // tgtgcc -> cctgtg
|
|
3814: 1774, // tgtgcg -> cgtgtg
|
|
3815: 2030, // tgtgct -> cttgtg
|
|
3816: 954, // tgtgga -> atgtgg
|
|
3817: 1978, // tgtggc -> ctgtgg
|
|
3818: 2747, // tgtggg -> gggtgt
|
|
3819: 2811, // tgtggt -> ggttgt
|
|
3820: 955, // tgtgta -> atgtgt
|
|
3821: 1979, // tgtgtc -> ctgtgt
|
|
3822: 3003, // tgtgtg -> gtgtgt
|
|
3823: 3007, // tgtgtt -> gtgttt
|
|
3824: 239, // tgttaa -> aatgtt
|
|
3825: 495, // tgttac -> actgtt
|
|
3826: 751, // tgttag -> agtgtt
|
|
3827: 1007, // tgttat -> attgtt
|
|
3828: 957, // tgttca -> atgttc
|
|
3829: 1519, // tgttcc -> cctgtt
|
|
3830: 1775, // tgttcg -> cgtgtt
|
|
3831: 2031, // tgttct -> cttgtt
|
|
3832: 958, // tgttga -> atgttg
|
|
3833: 1982, // tgttgc -> ctgttg
|
|
3834: 2799, // tgttgg -> ggtgtt
|
|
3835: 3055, // tgttgt -> gttgtt
|
|
3836: 959, // tgttta -> atgttt
|
|
3837: 1983, // tgtttc -> ctgttt
|
|
3838: 3007, // tgtttg -> gtgttt
|
|
3839: 3071, // tgtttt -> gttttt
|
|
3840: 15, // ttaaaa -> aaaatt
|
|
3841: 31, // ttaaac -> aaactt
|
|
3842: 47, // ttaaag -> aaagtt
|
|
3843: 63, // ttaaat -> aaattt
|
|
3844: 79, // ttaaca -> aacatt
|
|
3845: 95, // ttaacc -> aacctt
|
|
3846: 111, // ttaacg -> aacgtt
|
|
3847: 127, // ttaact -> aacttt
|
|
3848: 143, // ttaaga -> aagatt
|
|
3849: 159, // ttaagc -> aagctt
|
|
3850: 175, // ttaagg -> aaggtt
|
|
3851: 191, // ttaagt -> aagttt
|
|
3852: 207, // ttaata -> aatatt
|
|
3853: 223, // ttaatc -> aatctt
|
|
3854: 239, // ttaatg -> aatgtt
|
|
3855: 255, // ttaatt -> aatttt
|
|
3856: 241, // ttacaa -> aattac
|
|
3857: 287, // ttacac -> acactt
|
|
3858: 303, // ttacag -> acagtt
|
|
3859: 319, // ttacat -> acattt
|
|
3860: 335, // ttacca -> accatt
|
|
3861: 351, // ttaccc -> accctt
|
|
3862: 367, // ttaccg -> accgtt
|
|
3863: 383, // ttacct -> accttt
|
|
3864: 399, // ttacga -> acgatt
|
|
3865: 415, // ttacgc -> acgctt
|
|
3866: 431, // ttacgg -> acggtt
|
|
3867: 447, // ttacgt -> acgttt
|
|
3868: 463, // ttacta -> actatt
|
|
3869: 479, // ttactc -> actctt
|
|
3870: 495, // ttactg -> actgtt
|
|
3871: 511, // ttactt -> actttt
|
|
3872: 242, // ttagaa -> aattag
|
|
3873: 498, // ttagac -> acttag
|
|
3874: 559, // ttagag -> agagtt
|
|
3875: 575, // ttagat -> agattt
|
|
3876: 591, // ttagca -> agcatt
|
|
3877: 607, // ttagcc -> agcctt
|
|
3878: 623, // ttagcg -> agcgtt
|
|
3879: 639, // ttagct -> agcttt
|
|
3880: 655, // ttagga -> aggatt
|
|
3881: 671, // ttaggc -> aggctt
|
|
3882: 687, // ttaggg -> agggtt
|
|
3883: 703, // ttaggt -> aggttt
|
|
3884: 719, // ttagta -> agtatt
|
|
3885: 735, // ttagtc -> agtctt
|
|
3886: 751, // ttagtg -> agtgtt
|
|
3887: 767, // ttagtt -> agtttt
|
|
3888: 243, // ttataa -> aattat
|
|
3889: 499, // ttatac -> acttat
|
|
3890: 755, // ttatag -> agttat
|
|
3891: 831, // ttatat -> atattt
|
|
3892: 847, // ttatca -> atcatt
|
|
3893: 863, // ttatcc -> atcctt
|
|
3894: 879, // ttatcg -> atcgtt
|
|
3895: 895, // ttatct -> atcttt
|
|
3896: 911, // ttatga -> atgatt
|
|
3897: 927, // ttatgc -> atgctt
|
|
3898: 943, // ttatgg -> atggtt
|
|
3899: 959, // ttatgt -> atgttt
|
|
3900: 975, // ttatta -> attatt
|
|
3901: 991, // ttattc -> attctt
|
|
3902: 1007, // ttattg -> attgtt
|
|
3903: 1023, // ttattt -> attttt
|
|
3904: 61, // ttcaaa -> aaattc
|
|
3905: 125, // ttcaac -> aacttc
|
|
3906: 189, // ttcaag -> aagttc
|
|
3907: 253, // ttcaat -> aatttc
|
|
3908: 317, // ttcaca -> acattc
|
|
3909: 381, // ttcacc -> accttc
|
|
3910: 445, // ttcacg -> acgttc
|
|
3911: 509, // ttcact -> actttc
|
|
3912: 573, // ttcaga -> agattc
|
|
3913: 637, // ttcagc -> agcttc
|
|
3914: 701, // ttcagg -> aggttc
|
|
3915: 765, // ttcagt -> agtttc
|
|
3916: 829, // ttcata -> atattc
|
|
3917: 893, // ttcatc -> atcttc
|
|
3918: 957, // ttcatg -> atgttc
|
|
3919: 1021, // ttcatt -> attttc
|
|
3920: 245, // ttccaa -> aattcc
|
|
3921: 501, // ttccac -> acttcc
|
|
3922: 757, // ttccag -> agttcc
|
|
3923: 1013, // ttccat -> atttcc
|
|
3924: 981, // ttccca -> attccc
|
|
3925: 1375, // ttcccc -> cccctt
|
|
3926: 1391, // ttcccg -> cccgtt
|
|
3927: 1407, // ttccct -> cccttt
|
|
3928: 982, // ttccga -> attccg
|
|
3929: 1439, // ttccgc -> ccgctt
|
|
3930: 1455, // ttccgg -> ccggtt
|
|
3931: 1471, // ttccgt -> ccgttt
|
|
3932: 983, // ttccta -> attcct
|
|
3933: 1503, // ttcctc -> cctctt
|
|
3934: 1519, // ttcctg -> cctgtt
|
|
3935: 1535, // ttcctt -> cctttt
|
|
3936: 246, // ttcgaa -> aattcg
|
|
3937: 502, // ttcgac -> acttcg
|
|
3938: 758, // ttcgag -> agttcg
|
|
3939: 1014, // ttcgat -> atttcg
|
|
3940: 985, // ttcgca -> attcgc
|
|
3941: 1526, // ttcgcc -> ccttcg
|
|
3942: 1647, // ttcgcg -> cgcgtt
|
|
3943: 1663, // ttcgct -> cgcttt
|
|
3944: 986, // ttcgga -> attcgg
|
|
3945: 1695, // ttcggc -> cggctt
|
|
3946: 1711, // ttcggg -> cgggtt
|
|
3947: 1727, // ttcggt -> cggttt
|
|
3948: 987, // ttcgta -> attcgt
|
|
3949: 1759, // ttcgtc -> cgtctt
|
|
3950: 1775, // ttcgtg -> cgtgtt
|
|
3951: 1791, // ttcgtt -> cgtttt
|
|
3952: 247, // ttctaa -> aattct
|
|
3953: 503, // ttctac -> acttct
|
|
3954: 759, // ttctag -> agttct
|
|
3955: 1015, // ttctat -> atttct
|
|
3956: 989, // ttctca -> attctc
|
|
3957: 1527, // ttctcc -> ccttct
|
|
3958: 1783, // ttctcg -> cgttct
|
|
3959: 1919, // ttctct -> ctcttt
|
|
3960: 990, // ttctga -> attctg
|
|
3961: 1951, // ttctgc -> ctgctt
|
|
3962: 1967, // ttctgg -> ctggtt
|
|
3963: 1983, // ttctgt -> ctgttt
|
|
3964: 991, // ttctta -> attctt
|
|
3965: 2015, // ttcttc -> cttctt
|
|
3966: 2031, // ttcttg -> cttgtt
|
|
3967: 2047, // ttcttt -> cttttt
|
|
3968: 62, // ttgaaa -> aaattg
|
|
3969: 126, // ttgaac -> aacttg
|
|
3970: 190, // ttgaag -> aagttg
|
|
3971: 254, // ttgaat -> aatttg
|
|
3972: 318, // ttgaca -> acattg
|
|
3973: 382, // ttgacc -> accttg
|
|
3974: 446, // ttgacg -> acgttg
|
|
3975: 510, // ttgact -> actttg
|
|
3976: 574, // ttgaga -> agattg
|
|
3977: 638, // ttgagc -> agcttg
|
|
3978: 702, // ttgagg -> aggttg
|
|
3979: 766, // ttgagt -> agtttg
|
|
3980: 830, // ttgata -> atattg
|
|
3981: 894, // ttgatc -> atcttg
|
|
3982: 958, // ttgatg -> atgttg
|
|
3983: 1022, // ttgatt -> attttg
|
|
3984: 249, // ttgcaa -> aattgc
|
|
3985: 505, // ttgcac -> acttgc
|
|
3986: 761, // ttgcag -> agttgc
|
|
3987: 1017, // ttgcat -> atttgc
|
|
3988: 997, // ttgcca -> attgcc
|
|
3989: 1406, // ttgccc -> cccttg
|
|
3990: 1470, // ttgccg -> ccgttg
|
|
3991: 1534, // ttgcct -> cctttg
|
|
3992: 998, // ttgcga -> attgcg
|
|
3993: 1662, // ttgcgc -> cgcttg
|
|
3994: 1726, // ttgcgg -> cggttg
|
|
3995: 1790, // ttgcgt -> cgtttg
|
|
3996: 999, // ttgcta -> attgct
|
|
3997: 1918, // ttgctc -> ctcttg
|
|
3998: 1982, // ttgctg -> ctgttg
|
|
3999: 2046, // ttgctt -> cttttg
|
|
4000: 250, // ttggaa -> aattgg
|
|
4001: 506, // ttggac -> acttgg
|
|
4002: 762, // ttggag -> agttgg
|
|
4003: 1018, // ttggat -> atttgg
|
|
4004: 1001, // ttggca -> attggc
|
|
4005: 1530, // ttggcc -> ccttgg
|
|
4006: 1786, // ttggcg -> cgttgg
|
|
4007: 2042, // ttggct -> ctttgg
|
|
4008: 1002, // ttggga -> attggg
|
|
4009: 2026, // ttgggc -> cttggg
|
|
4010: 2735, // ttgggg -> ggggtt
|
|
4011: 2751, // ttgggt -> gggttt
|
|
4012: 1003, // ttggta -> attggt
|
|
4013: 2027, // ttggtc -> cttggt
|
|
4014: 2799, // ttggtg -> ggtgtt
|
|
4015: 2815, // ttggtt -> ggtttt
|
|
4016: 251, // ttgtaa -> aattgt
|
|
4017: 507, // ttgtac -> acttgt
|
|
4018: 763, // ttgtag -> agttgt
|
|
4019: 1019, // ttgtat -> atttgt
|
|
4020: 1005, // ttgtca -> attgtc
|
|
4021: 1531, // ttgtcc -> ccttgt
|
|
4022: 1787, // ttgtcg -> cgttgt
|
|
4023: 2043, // ttgtct -> ctttgt
|
|
4024: 1006, // ttgtga -> attgtg
|
|
4025: 2030, // ttgtgc -> cttgtg
|
|
4026: 2811, // ttgtgg -> ggttgt
|
|
4027: 3007, // ttgtgt -> gtgttt
|
|
4028: 1007, // ttgtta -> attgtt
|
|
4029: 2031, // ttgttc -> cttgtt
|
|
4030: 3055, // ttgttg -> gttgtt
|
|
4031: 3071, // ttgttt -> gttttt
|
|
4032: 63, // tttaaa -> aaattt
|
|
4033: 127, // tttaac -> aacttt
|
|
4034: 191, // tttaag -> aagttt
|
|
4035: 255, // tttaat -> aatttt
|
|
4036: 319, // tttaca -> acattt
|
|
4037: 383, // tttacc -> accttt
|
|
4038: 447, // tttacg -> acgttt
|
|
4039: 511, // tttact -> actttt
|
|
4040: 575, // tttaga -> agattt
|
|
4041: 639, // tttagc -> agcttt
|
|
4042: 703, // tttagg -> aggttt
|
|
4043: 767, // tttagt -> agtttt
|
|
4044: 831, // tttata -> atattt
|
|
4045: 895, // tttatc -> atcttt
|
|
4046: 959, // tttatg -> atgttt
|
|
4047: 1023, // tttatt -> attttt
|
|
4048: 253, // tttcaa -> aatttc
|
|
4049: 509, // tttcac -> actttc
|
|
4050: 765, // tttcag -> agtttc
|
|
4051: 1021, // tttcat -> attttc
|
|
4052: 1013, // tttcca -> atttcc
|
|
4053: 1407, // tttccc -> cccttt
|
|
4054: 1471, // tttccg -> ccgttt
|
|
4055: 1535, // tttcct -> cctttt
|
|
4056: 1014, // tttcga -> atttcg
|
|
4057: 1663, // tttcgc -> cgcttt
|
|
4058: 1727, // tttcgg -> cggttt
|
|
4059: 1791, // tttcgt -> cgtttt
|
|
4060: 1015, // tttcta -> atttct
|
|
4061: 1919, // tttctc -> ctcttt
|
|
4062: 1983, // tttctg -> ctgttt
|
|
4063: 2047, // tttctt -> cttttt
|
|
4064: 254, // tttgaa -> aatttg
|
|
4065: 510, // tttgac -> actttg
|
|
4066: 766, // tttgag -> agtttg
|
|
4067: 1022, // tttgat -> attttg
|
|
4068: 1017, // tttgca -> atttgc
|
|
4069: 1534, // tttgcc -> cctttg
|
|
4070: 1790, // tttgcg -> cgtttg
|
|
4071: 2046, // tttgct -> cttttg
|
|
4072: 1018, // tttgga -> atttgg
|
|
4073: 2042, // tttggc -> ctttgg
|
|
4074: 2751, // tttggg -> gggttt
|
|
4075: 2815, // tttggt -> ggtttt
|
|
4076: 1019, // tttgta -> atttgt
|
|
4077: 2043, // tttgtc -> ctttgt
|
|
4078: 3007, // tttgtg -> gtgttt
|
|
4079: 3071, // tttgtt -> gttttt
|
|
4080: 255, // ttttaa -> aatttt
|
|
4081: 511, // ttttac -> actttt
|
|
4082: 767, // ttttag -> agtttt
|
|
4083: 1023, // ttttat -> attttt
|
|
4084: 1021, // ttttca -> attttc
|
|
4085: 1535, // ttttcc -> cctttt
|
|
4086: 1791, // ttttcg -> cgtttt
|
|
4087: 2047, // ttttct -> cttttt
|
|
4088: 1022, // ttttga -> attttg
|
|
4089: 2046, // ttttgc -> cttttg
|
|
4090: 2815, // ttttgg -> ggtttt
|
|
4091: 3071, // ttttgt -> gttttt
|
|
4092: 1023, // ttttta -> attttt
|
|
4093: 2047, // tttttc -> cttttt
|
|
4094: 3071, // tttttg -> gttttt
|
|
4095: 4095, // tttttt -> tttttt
|
|
},
|
|
}
|
|
|
|
// NormalizeInt retourne le code du k-mer canonique (le plus petit lexicographiquement
|
|
// parmi toutes les permutations circulaires) pour un k-mer encodé en entier.
|
|
// Pour les k-mers de taille 1 à 6, utilise la table pré-calculée.
|
|
// Pour les k-mers plus grands, calcule à la volée.
|
|
func NormalizeInt(kmerCode int, kmerSize int) int {
|
|
// Pour les k-mers de taille <= 6, utiliser la table
|
|
if kmerSize <= 6 && kmerSize > 0 {
|
|
if canonical, ok := LexicographicNormalizationInt[kmerSize][kmerCode]; ok {
|
|
return canonical
|
|
}
|
|
// Si non trouvé dans la table (ne devrait pas arriver pour des k-mers valides)
|
|
}
|
|
|
|
// Pour les k-mers > 6 ou non trouvés, calculer les rotations circulaires
|
|
return getCanonicalCircularInt(kmerCode, kmerSize)
|
|
}
|
|
|
|
// getCanonicalCircularInt retourne le code du plus petit k-mer lexicographiquement
|
|
// parmi toutes les permutations circulaires du k-mer encodé donné.
|
|
func getCanonicalCircularInt(kmerCode int, kmerSize int) int {
|
|
if kmerSize <= 0 {
|
|
return kmerCode
|
|
}
|
|
|
|
canonical := kmerCode
|
|
mask := (1 << (kmerSize * 2)) - 1 // Masque pour garder k*2 bits
|
|
shiftAmount := (kmerSize * 2) - 2 // Position du premier nucléotide
|
|
|
|
// Générer toutes les permutations circulaires
|
|
currentCode := kmerCode
|
|
for i := 1; i < kmerSize; i++ {
|
|
// Extraire le premier nucléotide (2 bits de poids fort)
|
|
firstNuc := (currentCode >> shiftAmount) & 3
|
|
// Décaler vers la gauche et ajouter le premier nucléotide à la fin
|
|
currentCode = ((currentCode << 2) & mask) | firstNuc
|
|
|
|
// Comparer lexicographiquement (le plus petit code est le plus petit lexicographiquement)
|
|
if currentCode < canonical {
|
|
canonical = currentCode
|
|
}
|
|
}
|
|
|
|
return canonical
|
|
}
|
|
|
|
// EncodeKmer encode un k-mer (string) en entier selon le schéma de EncodeNucleotide.
|
|
// Cette fonction est utile pour les tests et le debug.
|
|
func EncodeKmer(kmer string) int {
|
|
code := 0
|
|
for i := 0; i < len(kmer); i++ {
|
|
code = (code << 2) + int(EncodeNucleotide(kmer[i]))
|
|
}
|
|
return code
|
|
}
|
|
|
|
// DecodeKmer décode un entier en k-mer (string).
|
|
// Cette fonction est utile pour les tests et le debug.
|
|
func DecodeKmer(code int, kmerSize int) string {
|
|
bases := []byte{'a', 'c', 'g', 't'}
|
|
result := make([]byte, kmerSize)
|
|
for i := kmerSize - 1; i >= 0; i-- {
|
|
result[i] = bases[code&3]
|
|
code >>= 2
|
|
}
|
|
return string(result)
|
|
}
|
|
|
|
// eulerTotient computes Euler's totient function φ(n), which counts
|
|
// the number of integers from 1 to n that are coprime with n.
|
|
func eulerTotient(n int) int {
|
|
if n <= 0 {
|
|
return 0
|
|
}
|
|
|
|
result := n
|
|
|
|
// Process all prime factors
|
|
for p := 2; p*p <= n; p++ {
|
|
// Check if p is a prime factor
|
|
if n%p == 0 {
|
|
// Remove all occurrences of p
|
|
for n%p == 0 {
|
|
n /= p
|
|
}
|
|
// Apply the formula: φ(n) = n * (1 - 1/p) = n * (p-1)/p
|
|
result -= result / p
|
|
}
|
|
}
|
|
|
|
// If n is still greater than 1, then it's a prime factor
|
|
if n > 1 {
|
|
result -= result / n
|
|
}
|
|
|
|
return result
|
|
}
|
|
|
|
// divisors returns all divisors of n in ascending order.
|
|
func divisors(n int) []int {
|
|
if n <= 0 {
|
|
return []int{}
|
|
}
|
|
|
|
divs := []int{}
|
|
for i := 1; i*i <= n; i++ {
|
|
if n%i == 0 {
|
|
divs = append(divs, i)
|
|
if i != n/i {
|
|
divs = append(divs, n/i)
|
|
}
|
|
}
|
|
}
|
|
|
|
// Sort in ascending order
|
|
for i := 0; i < len(divs)-1; i++ {
|
|
for j := i + 1; j < len(divs); j++ {
|
|
if divs[i] > divs[j] {
|
|
divs[i], divs[j] = divs[j], divs[i]
|
|
}
|
|
}
|
|
}
|
|
|
|
return divs
|
|
}
|
|
|
|
// necklaceCount computes the number of distinct necklaces (equivalence classes
|
|
// under rotation) for sequences of length n over an alphabet of size a.
|
|
// Uses Moreau's necklace-counting formula (also known as the necklace polynomial):
|
|
//
|
|
// N(n, a) = (1/n) * Σ φ(d) * a^(n/d)
|
|
//
|
|
// where the sum is over all divisors d of n, and φ is Euler's totient function.
|
|
func necklaceCount(n, alphabetSize int) int {
|
|
if n <= 0 {
|
|
return 0
|
|
}
|
|
|
|
divs := divisors(n)
|
|
sum := 0
|
|
|
|
for _, d := range divs {
|
|
// Compute a^(n/d)
|
|
power := 1
|
|
exp := n / d
|
|
for i := 0; i < exp; i++ {
|
|
power *= alphabetSize
|
|
}
|
|
|
|
sum += eulerTotient(d) * power
|
|
}
|
|
|
|
return sum / n
|
|
}
|
|
|
|
// CanonicalKmerCount returns the number of canonical k-mers (unique normalized forms)
|
|
// for a given k-mer size after circular normalization.
|
|
//
|
|
// For k=1 to 6, uses exact counts from pre-computed tables.
|
|
// For k>6, uses Moreau's necklace-counting formula for exact computation:
|
|
//
|
|
// N(n, 4) = (1/n) * Σ φ(d) * 4^(n/d)
|
|
//
|
|
// where the sum is over all divisors d of n, and φ is Euler's totient function.
|
|
//
|
|
// These values are critical for calculating maximum entropy in entropy-based
|
|
// complexity filters, as circular normalization reduces the effective alphabet size.
|
|
func CanonicalKmerCount(kmerSize int) int {
|
|
// Exact counts for k=1 to 6 (counted from normalization tables)
|
|
switch kmerSize {
|
|
case 1:
|
|
return 4
|
|
case 2:
|
|
return 10
|
|
case 3:
|
|
return 24
|
|
case 4:
|
|
return 70
|
|
case 5:
|
|
return 208
|
|
case 6:
|
|
return 700
|
|
default:
|
|
// For k>6, use Moreau's necklace-counting formula for exact count
|
|
// DNA alphabet has 4 bases
|
|
return necklaceCount(kmerSize, 4)
|
|
}
|
|
}
|