large refactoring

2026-08-17 09:28:53 +02:00
parent 49e66f16a2
commit 7bac0f3850
236 changed files with 77584 additions and 3733 deletions
@@ -0,0 +1,13 @@
+<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
+# Coverage: implementation/superkmer.md
+
+## Code couvert
+
+- `obikseq/src/superkmer.rs` — layout mémoire SuperKmer (header 32 bits + séquence byte-alignée), encodage ASCII, revcomp, deque minimiseur
+- `obiskbuilder/src/lib.rs` — fenêtre glissante monotone pour le maintien du minimiseur
+
+## Notes
+
+Document d'implémentation détaillé. Vérifier que le layout header (longueur, orientation,
+position minimiseur) n'a pas changé. La doc mentionne un revcomp SIMD — vérifier si c'est
+toujours le cas ou si l'implémentation est scalaire.