large refactoring

2026-08-17 09:28:53 +02:00
parent 49e66f16a2
commit 7bac0f3850
236 changed files with 77584 additions and 3733 deletions
@@ -0,0 +1,13 @@
+<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
+# Coverage: kmers.md
+
+## Code couvert
+
+- `obikseq/src/kmer.rs` — type Kmer, propriétés, forme canonique
+- `obikseq/src/superkmer.rs` — type SuperKmer, longueur attendue
+- `obiskbuilder/src/lib.rs` — extraction de superkmers par minimiseur
+
+## Notes
+
+Chevauche `theory/encoding.md` (encodage 2 bits) et `theory/minimizer.md` (choix du minimiseur).
+Vérifier que la définition de SuperKmer est cohérente avec les invariants actuels de `obikseq`.