docs: add coverage reference files and flag architectural drift

These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.

docmd/index.refs.md

@@ -0,0 +1,13 @@
+<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
+# Coverage: index.md
+
+## Code couvert
+
+- `obikmer/src/main.rs` — point d'entrée CLI, contraintes globales
+- `obikmer/src/cli.rs` — structure des arguments communs
+
+## Notes
+
+Document de niveau projet (vue d'ensemble, motivations, contraintes fondamentales).
+Pas de code Rust spécifique à vérifier au-delà des contraintes générales (k impair, formats d'entrée).
+À mettre à jour si de nouvelles sous-commandes ou formats sont ajoutés.