docs: add coverage reference files and flag architectural drift

These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.
2026-05-23 13:19:31 +02:00
parent b2a52bfb37
commit b7db3a33ed
22 changed files with 335 additions and 0 deletions
@@ -0,0 +1,13 @@
+<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
+# Coverage: kmers.md
+
+## Code couvert
+
+- `obikseq/src/kmer.rs` — type Kmer, propriétés, forme canonique
+- `obikseq/src/superkmer.rs` — type SuperKmer, longueur attendue
+- `obiskbuilder/src/lib.rs` — extraction de superkmers par minimiseur
+
+## Notes
+
+Chevauche `theory/encoding.md` (encodage 2 bits) et `theory/minimizer.md` (choix du minimiseur).
+Vérifier que la définition de SuperKmer est cohérente avec les invariants actuels de `obikseq`.