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obikmer/docmd/implementation/merge.refs.md
T
Eric Coissac b7db3a33ed docs: add coverage reference files and flag architectural drift
These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.
2026-05-23 13:44:23 +02:00

1.1 KiB

Coverage: implementation/merge.md

Code couvert

  • obikindex/src/merge.rsKmerIndex::merge(), validation de compatibilité d'évidence, validate_evidence_compat()
  • obikpartitionner/src/merge_layer.rsmerge_partition(), construction de la nouvelle layer, paramètre block_bits
  • obikpartitionner/src/rebuild_layer.rsrebuild_partition(), paramètre block_bits
  • obilayeredmap/src/layer.rsLayer::append_genome_column() (PersistentCompactIntMatrix et PersistentBitMatrix)
  • obicompactvec/src/intmatrix.rsappend_column pour PersistentCompactIntMatrix
  • obicompactvec/src/bitmatrix.rsappend_column pour PersistentBitMatrix

Notes

FORT RISQUE DE DÉRIVE. Changements récents :

  • Ajout de la validation de compatibilité d'évidence : merge exact+approx → erreur (OKIError::IncompatibleEvidence)
  • merge_partition reçoit maintenant block_bits: u8
  • La commande reindex a été ajoutée comme outil de conversion exact↔approx avant merge Vérifier que la doc décrit la politique de merge mixed-evidence et le recours à reindex.