Eric Coissac
b7db3a33ed
These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.
1.5 KiB
1.5 KiB
Coverage: implementation/obilayeredmap.md
Code couvert
obilayeredmap/src/mphf_layer.rs— MphfLayer, LayerEvidence enum (Exact/Approx), find(), find_exact(), find_approx()obilayeredmap/src/layer.rs— Layer, trait LayerData, modes () / PersistentCompactIntMatrix / PersistentBitMatrix, build(), build_evidence(), append_genome_column()obilayeredmap/src/map.rs— LayeredMap, push_layer(), query()obilayeredmap/src/evidence.rs— Evidence, EvidenceWriter, encodage chunk_id:rankobilayeredmap/src/fingerprint.rs— FingerprintVec, FingerprintVecWriter, matches()obilayeredmap/src/meta.rs— LayerMeta, EvidenceKind (Exact / Approx { b, z })
Notes
FORT RISQUE DE DÉRIVE. C'est le fichier le plus affecté par les changements récents :
- EvidenceKind (Exact / Approx) est désormais un concept de premier plan — toute la sémantique de query en dépend
LayerEvidenceenum interne àMphfLayer: dispatch transparent find() → find_exact() ou find_approx()fingerprint.rs: module entièrement nouveau (FingerprintVec + FingerprintVecWriter)build_evidence()/build_exact_evidence()/build_approx_evidence()sont nouveauxblock_bitsdans les fonctions build : O(1) garanti avec le chemin chaud explicit pour block_bits=0- Séparation open() (accès aléatoire, requiert .idx) vs open_sequential() (itération seule) Pratiquement toute cette page est à réécrire.