Ajout de la gestion des métadonnées utilisateur dans KmerSet et KmerSetGroup

Cette modification ajoute la capacité de stocker et de persister des métadonnées utilisateur dans les structures KmerSet et KmerSetGroup. Les changements incluent l'ajout d'un champ Metadata dans KmerSet et KmerSetGroup, ainsi que la mise à jour des méthodes de clonage et de persistance pour gérer ces métadonnées. Cela permet de conserver des informations supplémentaires liées aux ensembles de k-mers tout en maintenant la compatibilité avec les opérations existantes.
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Eric Coissac
2026-02-05 15:02:27 +01:00
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@@ -10,23 +10,26 @@ import (
// KmerSet encapsule un ensemble de k-mers stockés dans un Roaring Bitmap
// Fournit des méthodes utilitaires pour manipuler des ensembles de k-mers
type KmerSet struct {
K int // Taille des k-mers
bitmap *roaring64.Bitmap // Bitmap contenant les k-mers
K int // Taille des k-mers
bitmap *roaring64.Bitmap // Bitmap contenant les k-mers
Metadata map[string]interface{} // Métadonnées utilisateur (clé=valeur atomique)
}
// NewKmerSet crée un nouveau KmerSet vide
func NewKmerSet(k int) *KmerSet {
return &KmerSet{
K: k,
bitmap: roaring64.New(),
K: k,
bitmap: roaring64.New(),
Metadata: make(map[string]interface{}),
}
}
// NewKmerSetFromBitmap crée un KmerSet à partir d'un bitmap existant
func NewKmerSetFromBitmap(k int, bitmap *roaring64.Bitmap) *KmerSet {
return &KmerSet{
K: k,
bitmap: bitmap,
K: k,
bitmap: bitmap,
Metadata: make(map[string]interface{}),
}
}
@@ -73,9 +76,16 @@ func (ks *KmerSet) Clear() {
// Clone crée une copie de l'ensemble
func (ks *KmerSet) Clone() *KmerSet {
// Copier les métadonnées
metadata := make(map[string]interface{}, len(ks.Metadata))
for k, v := range ks.Metadata {
metadata[k] = v
}
return &KmerSet{
K: ks.K,
bitmap: ks.bitmap.Clone(),
K: ks.K,
bitmap: ks.bitmap.Clone(),
Metadata: metadata,
}
}