large refactoring

DevDocMD/theory/entropy.refs.md

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+<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
+# Coverage: theory/entropy.md
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+## Code couvert
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+- `obikentropy/src/table.rs`, `obikentropy/src/tracker.rs` — formule d'entropie et tables de correction petits effectifs
+- `obikentropy/src/kmer_entropy.rs` — entropie d'un kmer isolé (`KmerEntropy`)
+- `obiskbuilder/src/rolling_stat.rs` — composition de `obikentropy::EntropyTracker` dans le suivi streaming (sélection de minimiseur + entropie)
+- `obiskbuilder/src/iter.rs`, `obiskbuilder/src/stream_iter.rs` — application du filtre lors du scatter (phase 1)
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+## Notes
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+Le repli en classes d'équivalence circulaires + brin inverse (décrit dans une version antérieure de ce document) a été supprimé : voir la section « Why no equivalence classes » de `entropy.md` pour la justification théorique et numérique.
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+Vérifier que les paramètres `theta` et `level_max` dans le CLI
+(`obikmer/src/cli.rs` → `CommonArgs`) correspondent bien à ce qui est décrit.