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obikmer/TODO.md
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Eric Coissac f2de79acde Add persistent compact integer vector and cache-line-optimized MPHF
Introduce the `obicompactvec` crate, featuring a two-tier, memory-mapped integer vector that uses a primary `u8` array with a sentinel for overflow dispatch and a sparse L1-resident index for fast random access. Implement builder and reader modules with zero-copy serialization and comprehensive test coverage. Update `obilayeredmap` to replace the default hash function with a cache-line-optimized `Mphf`, adding explicit bounds checking and duplicate-slot detection. Add documentation for both modules and update project configuration files accordingly.
2026-05-13 10:09:46 +08:00

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Dans OBILayeredMap

  • Est-ce que CachelineEfVec est vraiment justifier dans notre cas. vu les contraintes sur la distribution des valeurs imposées par CachelineEfVec en terme d'ordre, de grandeur et de dispersion ?
  • Il semble que le count de kmer soit stocké, ce qui doit-être une possibilité pas une obligation.