Eric Coissac
5c1584967f
The command now supports reopening existing indexes instead of failing when the output file exists. Control flow branches between opening an existing index and constructing a new one, moving configuration setup exclusively to the creation path. Directory existence is enforced upfront with proper I/O error propagation. The --force flag retains its original semantics by removing the target directory before proceeding with a fresh build.
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# Coverage: implementation/storage.md
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## Code couvert
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- `obikindex/src/meta.rs` — IndexMeta, IndexConfig (version, config, genomes)
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- `obikindex/src/index.rs` — layout sur disque : partitions/, index.meta
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- `obikindex/src/layer/meta.rs` — LayerMeta (evidence kind), PartitionMeta (n_layers)
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- `obiskio/src/unitig_index.rs` — fichiers unitigs.bin + unitigs.bin.idx
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## Notes
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FORT RISQUE DE DÉRIVE. Nombreux champs ajoutés :
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- `IndexConfig` : champs `evidence` (EvidenceKind) et `block_bits` ajoutés
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- Nouveau fichier `fingerprint.bin` pour l'évidence approximative
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- `LayerMeta` / `layer_meta.json` introduit pour stocker EvidenceKind par layer
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- Structure du répertoire layer : `evidence.bin` vs `fingerprint.bin` selon le mode
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Mettre à jour le schéma de layout sur disque en conséquence.
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