Eric Coissac
9379bbaad8
Update Cargo manifests, dependency paths, and Rust imports across the workspace to reflect the `obikpartitionner` to `obikpartition` rename. Synchronize architecture and implementation documentation with the new module structure. Fix minor syntax issues in test assertions to ensure compilation compatibility. No behavioral or API changes are introduced.
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<!-- coverage sidecar — ne pas ajouter au nav mkdocs -->
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# Coverage: architecture/query.md
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## Code couvert
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- `obikmer/src/cmd/query.rs` — commande query, format de sortie
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- `obikpartition/src/query_layer.rs` — routage de la requête à travers les partitions
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- `obiread/src/lib.rs` — lecture des séquences d'entrée pour la requête
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## Notes
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RISQUE DE DÉRIVE. Vérifier :
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- La commande `unitig` a été modifiée pour utiliser `open_sequential()` — vérifier si query est concerné
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- `find_exact` / `find_approx` / `find` générique ont été ajoutés dans `MphfLayer` — le chemin de requête a changé
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- Si l'index est approximatif (Approx), la requête peut produire des faux positifs : la doc le mentionne-t-elle ?
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- Format de sortie CSV (`obikindex/src/csv.rs` ou équivalent) à vérifier
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