Eric Coissac
5c1584967f
The command now supports reopening existing indexes instead of failing when the output file exists. Control flow branches between opening an existing index and constructing a new one, moving configuration setup exclusively to the creation path. Directory existence is enforced upfront with proper I/O error propagation. The --force flag retains its original semantics by removing the target directory before proceeding with a fresh build.
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# Coverage: implementation/unitig_evidence.md
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## Code couvert
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- `obiskio/src/unitig_index.rs` — format unitigs.bin + unitigs.bin.idx, UnitigFileWriter, UnitigFileReader, build_unitig_idx(), DEFAULT_BLOCK_BITS=0, chemin chaud block_bits=0 dans chunk_start()
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- `obikindex/src/layer/evidence.rs` — encodage Evidence (chunk_id 25 bits | rank 7 bits), EvidenceWriter
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- `obidebruinj/src/debruijn.rs` — extraction unitigs, chunking à MAX_KMERS_PER_CHUNK
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## Notes
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FORT RISQUE DE DÉRIVE. Changements récents :
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- `DEFAULT_BLOCK_BITS` est passé de 6 à 0 (accès O(1) par défaut)
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- `block_bits` est maintenant un paramètre runtime de `build_unitig_idx()` et `UnitigFileWriter`
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- `chunk_start()` a un chemin chaud explicite pour block_bits=0 (accès tableau direct, 0 scan)
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- `open()` vs `open_sequential()` : distinction nouvelle, importante pour la compréhension du coût
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- `iter_unitigs()` ajouté comme alias public de `iter_chunks_sequential()`
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Mettre à jour la description du format .idx et le modèle de coût d'accès aléatoire.
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