Eric Coissac
b7db3a33ed
These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.
1.4 KiB
1.4 KiB
Coverage: implementation/evidence_elimination.md
Code couvert
obilayeredmap/src/fingerprint.rs— FingerprintVec, FingerprintVecWriter, stockage b bits/slot, matches()obilayeredmap/src/mphf_layer.rs— build_approx_evidence(dir, b, z), find_approx()obilayeredmap/src/meta.rs— EvidenceKind::Approx { b, z }, LayerMetaobikindex/src/reindex.rs— KmerIndex::reindex(), conversion exact↔approx en placeobikmer/src/cmd/reindex.rs— CLI reindex, options --approx, -z, --evidence-bits, --fp, --block-sizeobikmer/src/cmd/index.rs— resolve_approx_params(), options --approx, -z, --evidence-bits, --fpobikmer/src/cmd/estimate.rs— commande estimate (dry-run des paramètres)
Notes
Ce document était à l'origine une discussion de design (4 approches). L'implémentation a maintenant convergé vers l'approche fingerprint (Findere-style). FORT RISQUE DE DÉRIVE — le contenu est probablement un mélange de design et d'implémentation :
- Le modèle FP = 1/2^(b·z) et les règles de résolution (2-of-3 parmi b, z, fp) sont implémentés
- La commande
reindexpermet la conversion a posteriori exact↔approx - La commande
estimatefait le dry-run des paramètres Cette page doit être réécrite pour documenter l'implémentation Findere réelle plutôt que les alternatives abandonnées.