Eric Coissac
b7db3a33ed
These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.
1.2 KiB
1.2 KiB
Coverage: architecture/index_architecture.md
Code couvert
obilayeredmap/src/layer.rs— Layer, trait LayerData, modes () / PersistentCompactIntMatrix / PersistentBitMatrixobilayeredmap/src/mphf_layer.rs— MphfLayer, EvidenceKind (Exact / Approx), LayerEvidence enumobilayeredmap/src/map.rs— LayeredMapobilayeredmap/src/meta.rs— LayerMeta, PartitionMetaobikindex/src/meta.rs— IndexConfig (kmer_size, n_bits, with_counts, evidence, block_bits), IndexMetaobikindex/src/index.rs— KmerIndex, build_layersobicompactvec/src/— PersistentCompactIntMatrix, PersistentBitMatrix (DataStore implementations)
Notes
FORT RISQUE DE DÉRIVE. Nombreux changements récents :
- Ajout de
EvidenceKind(Exact / Approx { b, z }) dansIndexConfigetLayerMeta - Ajout de
block_bitsdansIndexConfig LayerEvidenceenum dansmphf_layer.rsremplace l'ancienne approche monolithique- Distinction
open()vsopen_sequential()dansUnitigFileReader - Commandes
reindexetestimateajoutées Vérifier que la hiérarchie à 3 niveaux décrite est toujours exacte et que les nouveaux paramètres sont documentés.