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Eric Coissac b7db3a33ed docs: add coverage reference files and flag architectural drift

These files catalog test coverage for Rust modules across architecture, implementation, and theory sections. They track recent structural changes, flag areas prone to documentation drift, and mandate verification of key parameters and routing logic to maintain alignment with the active codebase.

2026-05-23 13:44:23 +02:00

1.0 KiB

Raw Blame History

Coverage: implementation/pipeline.md

Code couvert

obikpartitionner/src/partition.rs — estimation des paramètres (phase 0)
obiskbuilder/src/iter.rs — scatter : filtre entropie, extraction superkmers, routage partition (phase 1)
obikpartitionner/src/filter.rs — déduplication bucket-sort (phase 2)
obikpartitionner/src/kmer_sort.rs — tri externe + agrégation de comptages (phase 3)
obidebruinj/src/debruijn.rs — graphe De Bruijn, extraction des unitigs (phase 5)
obikpartitionner/src/index_layer.rs — construction MPHF + évidence (phase 6), paramètre block_bits
obikindex/src/index.rs — build_layers(), dereplicate_and_count()

Notes

RISQUE DE DÉRIVE modéré. Vérifier :

Phase 6 : la doc mentionne-t-elle le filtre d'abondance (min_ab, max_ab) ?
Phase 6 : block_bits passé à build_index_layer depuis IndexConfig
Phase 6 : dispatch exact/approx selon EvidenceKind dans build_index_layer

1.0 KiB Raw Blame History

Coverage: implementation/pipeline.md

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Notes

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