Eric Coissac
9379bbaad8
Update Cargo manifests, dependency paths, and Rust imports across the workspace to reflect the `obikpartitionner` to `obikpartition` rename. Synchronize architecture and implementation documentation with the new module structure. Fix minor syntax issues in test assertions to ensure compilation compatibility. No behavioral or API changes are introduced.
1.1 KiB
1.1 KiB
Coverage: implementation/merge.md
Code couvert
obikindex/src/merge.rs—KmerIndex::merge(), validation de compatibilité d'évidence,validate_evidence_compat()obikpartition/src/merge_layer.rs—merge_partition(), construction de la nouvelle layer, paramètreblock_bitsobikpartition/src/rebuild_layer.rs—rebuild_partition(), paramètreblock_bitsobilayeredmap/src/layer.rs—Layer::append_genome_column()(PersistentCompactIntMatrix et PersistentBitMatrix)obicompactvec/src/intmatrix.rs—append_columnpour PersistentCompactIntMatrixobicompactvec/src/bitmatrix.rs—append_columnpour PersistentBitMatrix
Notes
FORT RISQUE DE DÉRIVE. Changements récents :
- Ajout de la validation de compatibilité d'évidence : merge exact+approx → erreur (OKIError::IncompatibleEvidence)
merge_partitionreçoit maintenantblock_bits: u8- La commande
reindexa été ajoutée comme outil de conversion exact↔approx avant merge Vérifier que la doc décrit la politique de merge mixed-evidence et le recours àreindex.