Eric Coissac
b49aba9c09
Implémentation du filtrage unique basé sur séquence et catégories
...
Ajout d'une fonctionnalité pour le filtrage unique qui prend en compte à la fois la séquence et les catégories.
- Modification de la fonction ISequenceChunk pour accepter un classifieur unique optionnel
- Implémentation du traitement unique sur disque en utilisant un classifieur composite
- Mise à jour du classifieur utilisé pour le tri sur disque
- Correction de la gestion des clés de unicité en utilisant le code et la valeur du classifieur
- Mise à jour du numéro de commit
2026-01-14 19:18:17 +01:00
Eric Coissac
0678181023
Refactor chunk processing and update version commit
...
Optimize chunk processing by moving variable declarations inside the loop and update the commit hash in version.go to reflect the latest changes.
2026-01-14 18:46:04 +01:00
Eric Coissac
ac0d3f3fe4
Update obiuniq for very large dataset
2025-12-18 14:11:11 +01:00
Eric Coissac
7f4ebe757e
Bug obiuniq - don't clean the chunks
2025-10-28 13:50:22 +01:00
Eric Coissac
40fb4e9767
reduce the memory impact of obiuniq.
2024-11-27 13:30:16 +01:00
Eric Coissac
1b1cd41fd3
Add some code refactoring from the blackboard branch
2024-08-02 12:35:46 +02:00
Eric Coissac
67665a6b40
Xprize update
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Former-commit-id: d38919a897961e4d40da3b844057c3fb94fdb6d7
2024-07-25 18:09:03 -04:00
8d77cc4133
Change path of the obitools pkg
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Former-commit-id: 311cbf8df3b990b393c6f4885d62e74564423b65
2023-11-29 12:14:37 +01:00
d88de15cdc
Refactoring codes for removing buffer size options. An some other changes...
...
Former-commit-id: 10b57cc1a27446ade3c444217341e9651e89cdce
2023-03-07 11:12:13 +07:00
f97f92df72
rename the iterator class
2023-01-22 22:04:17 +01:00
eb32089305
Refactoring related to iterators
2022-11-16 17:13:40 +01:00
f14860a486
Patch header parting and formatiing
2022-05-27 11:53:29 +03:00
abcf02e488
Start to use leveled log
2022-02-24 12:14:52 +01:00
eaf65fbcce
Some code refactoring, a new version of obiuniq more efficient in memory and a first make file allowing to build obitools
2022-02-24 07:08:40 +01:00
2e7c1834b0
Big change iin the data model, and a first version of obiuniq
2022-02-21 19:00:23 +01:00
9737f97084
before big changes
2022-02-18 22:53:09 +01:00
2636882f9f
big bug on subschunk
2022-02-18 09:58:08 +01:00
