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obitools4/pkg/obichunk/chunk.go
Eric Coissac b49aba9c09 Implémentation du filtrage unique basé sur séquence et catégories
Ajout d'une fonctionnalité pour le filtrage unique qui prend en compte à la fois la séquence et les catégories.

- Modification de la fonction ISequenceChunk pour accepter un classifieur unique optionnel
- Implémentation du traitement unique sur disque en utilisant un classifieur composite
- Mise à jour du classifieur utilisé pour le tri sur disque
- Correction de la gestion des clés de unicité en utilisant le code et la valeur du classifieur
- Mise à jour du numéro de commit
2026-01-14 19:18:17 +01:00

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Go

package obichunk
import (
"git.metabarcoding.org/obitools/obitools4/obitools4/pkg/obiiter"
"git.metabarcoding.org/obitools/obitools4/obitools4/pkg/obiseq"
)
func ISequenceChunk(iterator obiiter.IBioSequence,
classifier *obiseq.BioSequenceClassifier,
onMemory bool,
dereplicate bool,
na string,
statsOn obiseq.StatsOnDescriptions,
uniqueClassifier *obiseq.BioSequenceClassifier,
) (obiiter.IBioSequence, error) {
if onMemory {
return ISequenceChunkOnMemory(iterator, classifier)
} else {
return ISequenceChunkOnDisk(iterator, classifier, dereplicate, na, statsOn, uniqueClassifier)
}
}