Eric Coissac 28162ac36f Ajout du filtre de fréquence avec v niveaux Roaring Bitmaps ...

Implémentation complète du filtre de fréquence utilisant v niveaux de Roaring Bitmaps pour éliminer efficacement les erreurs de séquençage.

- Ajout de la logique de filtrage par fréquence avec v niveaux
- Intégration des bibliothèques RoaringBitmap et bitset
- Ajout d'exemples d'utilisation et de documentation
- Implémentation de l'itérateur de k-mers pour une utilisation mémoire efficace
- Optimisation pour les distributions skewed typiques du séquençage

Ce changement permet de filtrer les k-mers par fréquence minimale avec une utilisation mémoire optimale et une seule passe sur les données.

2026-02-04 21:21:10 +01:00

9.8 KiB

Raw Blame History

View Raw